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3株鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析
1
作者
王静
许鑫
+5 位作者
李宛玉
王雪雨
吴倩倩
姚伦广
阚云超
冀君
《动物医学进展》
北大核心
2019年第8期11-17,共7页
对河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地鸭血清样本用PCR进行鸭乙型肝炎病毒(DHBV)检测,并从三地经检测为DHBV阳性的样本中各挑选1份进行DHBV全基因的扩增、克隆、测序及序列分析。结果显示,河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地的鸭乙型肝炎...
对河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地鸭血清样本用PCR进行鸭乙型肝炎病毒(DHBV)检测,并从三地经检测为DHBV阳性的样本中各挑选1份进行DHBV全基因的扩增、克隆、测序及序列分析。结果显示,河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地的鸭乙型肝炎自然感染率分别为17.6%、13.6%、16.1%,差异不显著(P>0.05)。河南南阳、安徽亳州、湖北潜江3株DHBV基因组全长分别为3024、3027、3024bp,均含有编码P、S和C蛋白的3个开放阅读框。通过各开放阅读框氨基酸同源性比较,发现编码P蛋白的区域差异较大。全基因序列分析显示,3株DHBV核苷酸同源性为95.1%~97.4%,与选取的25株参考株同源性为90.3%~96.2%。遗传进化分析及P蛋白关键位点分析结果表明,3株均为类中国基因型,湖北潜江的DHBV毒株P蛋白3位-345位关键氨基酸残基位点与中国毒株基因型相同,在367位-771位关键氨基酸残基位点与西方毒株基因型相同,推测其产生了重组。结果表明,成功克隆了华中地区的3株鸭DHBV全基因序列,为DHBV的分子流行病学调查提供参考。
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关键词
鸭乙型肝炎病毒
全基因
序列分析
克隆
同源性
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题名
3株鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析
1
作者
王静
许鑫
李宛玉
王雪雨
吴倩倩
姚伦广
阚云超
冀君
机构
南阳师范学院/南阳市兽医生物工程技术研究中心/南阳师范学院昆虫生物反应器河南省工程实验室
出处
《动物医学进展》
北大核心
2019年第8期11-17,共7页
基金
河南省高等学校重点科研项目(18A230012)
南阳师范学院青年项目(16134)
南阳师范学院研究生创新基金项目(2017CX099)
文摘
对河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地鸭血清样本用PCR进行鸭乙型肝炎病毒(DHBV)检测,并从三地经检测为DHBV阳性的样本中各挑选1份进行DHBV全基因的扩增、克隆、测序及序列分析。结果显示,河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地的鸭乙型肝炎自然感染率分别为17.6%、13.6%、16.1%,差异不显著(P>0.05)。河南南阳、安徽亳州、湖北潜江3株DHBV基因组全长分别为3024、3027、3024bp,均含有编码P、S和C蛋白的3个开放阅读框。通过各开放阅读框氨基酸同源性比较,发现编码P蛋白的区域差异较大。全基因序列分析显示,3株DHBV核苷酸同源性为95.1%~97.4%,与选取的25株参考株同源性为90.3%~96.2%。遗传进化分析及P蛋白关键位点分析结果表明,3株均为类中国基因型,湖北潜江的DHBV毒株P蛋白3位-345位关键氨基酸残基位点与中国毒株基因型相同,在367位-771位关键氨基酸残基位点与西方毒株基因型相同,推测其产生了重组。结果表明,成功克隆了华中地区的3株鸭DHBV全基因序列,为DHBV的分子流行病学调查提供参考。
关键词
鸭乙型肝炎病毒
全基因
序列分析
克隆
同源性
Keywords
Duck hepatitis B virus
whole genome
sequence analysis
cloning
homology
分类号
S852.659.3 [农业科学—基础兽医学]
S858.32 [农业科学—临床兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
3株鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析
王静
许鑫
李宛玉
王雪雨
吴倩倩
姚伦广
阚云超
冀君
《动物医学进展》
北大核心
2019
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