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2019年1月至2023年4月河南省南阳市甲型流感病毒流行变迁及实验室检测方法学差异分析
1
作者
汪海霞
冯扬帆
+4 位作者
蔡晶晶
杜锴
张雪玲
朱丹燕
赵莹莹
《疾病监测》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期20-25,共6页
目的探讨河南省南阳市甲型流感病毒(IAVs)的流行变迁及多中心实验室不同检测方法学检测IAVs的差异分析。方法收集河南省南阳市中心医院、南阳市第一人民医院、南阳康圣医学检验所和郑州金域临床检验中心有限公司2019年1月至2023年4月期...
目的探讨河南省南阳市甲型流感病毒(IAVs)的流行变迁及多中心实验室不同检测方法学检测IAVs的差异分析。方法收集河南省南阳市中心医院、南阳市第一人民医院、南阳康圣医学检验所和郑州金域临床检验中心有限公司2019年1月至2023年4月期间,经临床医生诊疗疑似IAVs感染发热患者外周静脉血、咽拭子和肺泡灌洗液等标本,采用间接免疫荧光法(IFA)、磁微粒化学发光法(CLIA)、胶体金法、一代测序法、反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)及靶向高通量测序技术(tNGS)分别进行检测,分析各中心实验室不同检测方法学优劣及关联,以及分析IAVs流行变迁。结果发热门诊送检IAVs标本检测量较大,IAVs患者分布于各年龄段,各人群均易感。2020—2022年期间IAVs处于低流行状态,2019年和2023年至今,IAVs出现大流行。tNGS、一代测序与RT-PCR检测IAV-RNA阳性率比较,三者之间差异无统计学意义(χ^(2)=1.449、0.838,P=0.229、0.360),IAV-IgM(欧蒙)对IAVs检出阳性率与上述方法学之间差异无统计学意义(χ^(2)=2.447,P=0.118),IAV-IgM(西班牙)、IAV-IgM(CLIA)对IAVs检出阳性率较低。tNGS与一代测序可以对IAVs进行分型,检测IAVs及亚型IAV-H3N2阳性率之间差异具有统计学意义(u=4.335、4.213,P<0.001)。当IAV-RNA的Ct值<25时,患者咽拭子中IAV-Ag敏感度高达88/90=97.78%,当Ct值≥30时,IAV-Ag阳性检出率仍保持在40.00%以上,金标法检测IAV-Ag敏感度可达77.22%。一代测序和tNGS显示出检测IAV-RNA及其亚型的优势,IFA和CLIA显示出检测肺炎支原体IgM的优势。结论河南省南阳市IAVs常年流行,冬季为流行季。不同中心实验室不同检测方法对IAVs阳性检出率不同,选择IAVRNA联合IAV-IgM检测可为临床提供准确的IAVs检测结果。
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关键词
甲型流感病毒
靶向高通量测序
实验室检测
流行
原文传递
题名
2019年1月至2023年4月河南省南阳市甲型流感病毒流行变迁及实验室检测方法学差异分析
1
作者
汪海霞
冯扬帆
蔡晶晶
杜锴
张雪玲
朱丹燕
赵莹莹
机构
河南省
南阳
市中心医院
河南省
南阳
市第一人民医院
南阳康圣医学检验所有限公司
郑州金域临床
检验
中心
有限公司
出处
《疾病监测》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期20-25,共6页
基金
南阳市科技攻关项目(No.KJGG091)
2021-2022年度河南省医学科技攻关省部共建重点项目(No.SBGJ20212222)。
文摘
目的探讨河南省南阳市甲型流感病毒(IAVs)的流行变迁及多中心实验室不同检测方法学检测IAVs的差异分析。方法收集河南省南阳市中心医院、南阳市第一人民医院、南阳康圣医学检验所和郑州金域临床检验中心有限公司2019年1月至2023年4月期间,经临床医生诊疗疑似IAVs感染发热患者外周静脉血、咽拭子和肺泡灌洗液等标本,采用间接免疫荧光法(IFA)、磁微粒化学发光法(CLIA)、胶体金法、一代测序法、反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)及靶向高通量测序技术(tNGS)分别进行检测,分析各中心实验室不同检测方法学优劣及关联,以及分析IAVs流行变迁。结果发热门诊送检IAVs标本检测量较大,IAVs患者分布于各年龄段,各人群均易感。2020—2022年期间IAVs处于低流行状态,2019年和2023年至今,IAVs出现大流行。tNGS、一代测序与RT-PCR检测IAV-RNA阳性率比较,三者之间差异无统计学意义(χ^(2)=1.449、0.838,P=0.229、0.360),IAV-IgM(欧蒙)对IAVs检出阳性率与上述方法学之间差异无统计学意义(χ^(2)=2.447,P=0.118),IAV-IgM(西班牙)、IAV-IgM(CLIA)对IAVs检出阳性率较低。tNGS与一代测序可以对IAVs进行分型,检测IAVs及亚型IAV-H3N2阳性率之间差异具有统计学意义(u=4.335、4.213,P<0.001)。当IAV-RNA的Ct值<25时,患者咽拭子中IAV-Ag敏感度高达88/90=97.78%,当Ct值≥30时,IAV-Ag阳性检出率仍保持在40.00%以上,金标法检测IAV-Ag敏感度可达77.22%。一代测序和tNGS显示出检测IAV-RNA及其亚型的优势,IFA和CLIA显示出检测肺炎支原体IgM的优势。结论河南省南阳市IAVs常年流行,冬季为流行季。不同中心实验室不同检测方法对IAVs阳性检出率不同,选择IAVRNA联合IAV-IgM检测可为临床提供准确的IAVs检测结果。
关键词
甲型流感病毒
靶向高通量测序
实验室检测
流行
Keywords
Influenza A virus
Target next generation sequencing
Laboratory testing
Epidemic
分类号
R211 [医药卫生—中医学]
R183.1 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2019年1月至2023年4月河南省南阳市甲型流感病毒流行变迁及实验室检测方法学差异分析
汪海霞
冯扬帆
蔡晶晶
杜锴
张雪玲
朱丹燕
赵莹莹
《疾病监测》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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