博奥生物：芯片上的微小机遇

生物芯片技术是近十几年来生命科学领域出现的一门新兴技术,是生物技术的一个重要组成部分.生物芯片可分为基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片、微流体芯片和整合式芯片实验室.它集合计算机、微电子、微机械、生物化学、分子生物学和生物信息学等技术,在一个微小的芯片表面或芯片内部的微流体系统研究生物大分子之间,或者生物大分子和其它化学小分子之间的反应.生物芯片能整合样品制备、分子识别和反应、信号检测和信号放大等独立的分析过程,使之连续化、平行化、集成化和微型化.将生物芯片与相关的试剂、仪器和软件系统配套使用,可对基因、蛋白质和其它化学分子进行高通量检测和分析.

基因芯片在个体化医疗的实际应用 博奥生物的HLA基因分型技术服务介绍

人的所有特征和疾病几乎都与人的基因组相关，在人类个体之间，约有四千分之一的DNA序列不同．这些不同导致了人们对许多疾病易感性的不同，也影响了个体对同一治疗的反应不同。HLA是Human Leukocyte Antigen的缩写，即人类白细胞抗原．存在于人体的各种有核细胞表面，在不同种族、不同个体间呈现高度多态性，是人体生物学的“身份证”，由父母遗传人类白细胞抗原（HLA）是临床医学中常见的DNA序列差异而导致对疾病易患性不同的例子．

猪肉及其制品中几种病原微生物芯片检测方法的建立及应用

[目的]建立金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、大肠杆菌O157:H7、单增李斯特氏菌和空肠弯曲杆菌检测的基因芯片方法,并在实际应用中检测芯片的效果。[方法]以5种目标菌保守基因片段为模板设计引物,用待检样品增菌后提取的DNA模板进行2个独立的多重PCR扩增。扩增产物与固定有5种目标致病菌特异性探针的基因芯片进行杂交,用芯片扫描仪对芯片杂交结果进行扫描并判定结果。[结果]使用基因芯片检测5种细菌的检测下限分别为:金黄色葡萄球菌8.7×105cell/ml;大肠杆菌O157:H7 5.0×105cell/ml;沙门氏菌4.4×105cell/ml;单增李斯特氏菌2.4×105cell/ml;空肠弯曲杆菌6.2×106cell/ml。[结论]与传统方法比较,芯片法具有较高的特异性和灵敏性,是一种能应用于实际的快速高通量检测细菌的方法。

用寡核苷酸微阵列芯片方法检测常见的食源性致病微生物

研制了1种高通量检测食品中常见致病微生物的寡核苷酸微阵列芯片。该芯片在种的水平可鉴别金黄色葡萄球菌、阪崎肠杆菌、肠出血性大肠埃希氏菌0157：H7、霍乱弧菌、空肠弯曲杆菌、大肠弯曲杆菌、单核细胞增生李斯特菌、乙型溶血型链球菌和副溶血性弧菌；在属的水平可鉴别弯曲肠杆菌属、沙门氏菌属和李斯特氏菌属。研究中利用16S rDNA和沙门氏菌、O157：H7和副溶血性弧菌的特异基因序列设计引物和探针。用参比菌株和实验室自分离的菌株检测该芯片的特异性，结果表明该芯片的特异性良好，在所检测的菌株之间无交叉反应，与同属的其他菌株之间也不存在交叉反应。在鲜活海产品的24h增菌液中添加参比菌株，当样品增菌液中的目的菌的量达到10^6～10^7 CFU／mL时，芯片可以准确检测出目的菌。

生物芯片在聋病分子检测中的应用

在20世纪科技史上有两件事影响深远：一是微电子芯片，它是计算机和许多家电的“心脏”，它改变了我们的经济和文化生活，并已进入每一个家庭；另一件事就是生物芯片，它将改变生命科学的研究方式，革新医学诊断和治疗，极大地提高人口素质和健康水平。这是美国《财富》杂志对生物芯片的评价。什么是生物芯片，它为何一诞生就被赋予如此高的评价？它是如何制作的？它又是如何走进千家万户，走近聋病患者的身边？

荣获2007年度国家技术发明奖二等奖 系统化生物芯片和相关仪器设备的研制及应用

生物芯片被公认为是具有战略意义的前沿高新技术，具有广阔的商业前景。这一新技术平台所具有的高通量、多参数以及经济快速等鲜明特点，为生物和医药相关的生命科学研究和应用领域带来了巨大冲击。该项目最初的立项目的是希望借助我国近年来在生命科学基础研究、光机电仪器设备涉及的技术和工艺水平有较大提升的势头下，积累和丰富我国在生物芯片研究、开发和生产方面的经验，

生物芯片在临床医学上的应用

随着生命科学的不断发展,生物芯片逐渐成为研究热点,这项技术大幅度提高了人类研究生命科学和探索疾病的分子基础的能力。目前可以通过不同类型的生物芯片对肿瘤、自身免疫性疾病、传染性疾病和遗传疾病等进行危险因素研究、治疗方法探索、疾病初筛和耐药性研究。

生物芯片:对兽药残留说“不”

兽药残留对人体及环境的危害主要是慢性、远期和累积性的,如致癌、发育毒性、体内蓄积等.随着兽医学和兽药科学的迅速发展,经过十几年的积累,一套基于分析化学、药物化学、临床药理与毒理学以及管理科学之上的兽药残留分析方法已经建立,其中心任务是为动物和动物性食品中的兽药残留监控提供分析手段,内容包括食品残留(药物原形及代谢产物)的含量测定与结构鉴定(静态残留分析)以及组织分布与代谢(动态残留分析).

生物芯片系统在肿瘤研究中的应用

1背景介绍肿瘤是一种高度复杂的疾病，肿瘤的治疗也一直是困扰医学界的难题之一。目前研究表明，肿瘤是细胞多种基因突变累积的结果，这些基因突变主要发生在癌基因、抑癌基因和DNA修复基因上。绝大多数肿瘤基因均为体细胞变异，包括点突变、扩增、重排、缺失或甲基化状态的改变。

中医四诊客观化研究面临的主要问题与挑战

中医四诊客观化研究顺应中医药现代化、国际化发展的趋势。通过简要介绍中医四诊客观化技术研究的国内外现状,阐述了其当前面临的主要问题以及局限性;总结了中医四诊客观化需要解决的关键技术以及发展方向。

基因芯片技术在非综合征性耳聋快速基因诊断中的应用研究

目的应用耳聋基因芯片对非综合征性感音神经性耳聋患者进行分子病因学研究,评估其在快速耳聋基因诊断中的可行性。方法采集158名来自北京第三聋哑学校的非综合征性耳聋学生的外周血,提取基因组DNA,用耳聋基因芯片检测四个国人中常见的耳聋相关基因中的9个热点突变,包括GJB2(35delG,176del16bp,235delC及299_300delAT),GJB3(538C>T及547G>A),SLC26A4(IVS7-2A>G、2168A>G)和线粒体DNA 12S rRNA(A1555G)。同时,应用酶切法或直接测序法分别对线粒体12SrRNA A1555G突变,以及GJB2、SLC26A4基因编码区序列进行检测,以验证基因芯片结果的准确性。结果在158名耳聋患者中,基因芯片方法共检出67例携带致聋突变(42.41%)。其中,线粒体DNA 12S rRNA A1555G突变5例(3.16%);GJB2基因突变39例(24.68%),包括235delC纯合突变24例,235delC和299_300delAT复合杂合突变7例,235delC单杂合突变5例,299_300delAT单杂合突变2例,35delG单杂合突变1例;SLC26A4基因突变22例(13.92%),包括IVS7-2A>G纯合突变5例,IVS7-2A>G和2168A>G复合杂合突变5例,IVS7-2A>G单杂合突变11例,2168A>G单杂合1例;另外还有1例患者检出299_300delAT和IVS7-2A>G双杂合突变。未检出GJB3基因突变。除两例纯合235delC被判读为杂合外,基因芯片的结果同酶切及测序方法结果一致,后者的阳性患者检出率为70例(44.3%),与芯片检测结果相比无统计学差异(P=0.250)。经探针优化后,上述两例误判的235delC样品的芯片检测结果均与测序方法一致,同时经测序证实的其他22例235delC纯合突变样品验证,基因芯片的结果均与测序结果一致。结论针对国人常见耳聋相关基因热点突变设计的耳聋基因芯片对非综合征性重度和极重度耳聋患者的突变检出率高(42.41%)。与传统方法相比,它具有快速、高通量、高准确性、低成本等特点,能够满足临床耳聋基因检测的要求;且其操作简单,易于标准化,适于推广,显示出广阔的临床应用前景。

食源性致病病毒基因芯片方法检测

目的将基因芯片技术用于食源性致病病毒诺如病毒、轮状病毒、甲肝病毒、星状病毒和脊髓灰质炎病毒的检测,达到同时检测2种以上病毒的需求。方法采用基因芯片方法检测贝类食品中引起人类腹泻的5种食源性致病病毒。结果所研制的检测5种病毒的基因芯片具有良好的特异性,在5种病毒之间无交叉反应;其灵敏度与荧光PCR方法基本一致;芯片在4℃条件下,保存7.5个月,性能稳定。结论建立了检测5种食源性病毒的基因芯片方法,同时该方法也可用于医疗检验目的。为基因芯片在微生物检测领域的应用提供基础依据。

乳腺癌miRNAs表达谱检测及初步分析

目的制作哺乳动物micro RNAs(miRNAs)检测微阵列,筛选乳腺癌miRNAs表达谱并进行初步分析。方法利用已知的人及小鼠的miRNAs序列,设计了496条探针,制作miRNAs微阵列并验证其可靠性;培养乳腺癌细胞株MCF-7和正常乳腺上皮细胞株MCF-10A,分别抽提细胞总RNA,分离小分子RNA,经T4RNA连接酶荧光标记后与微阵列杂交,通过芯片扫描和数据分析,获得乳腺癌miRNAs表达谱。结果成功制作哺乳动物miRNAs微阵列,筛选获得57个乳腺癌相关miRNAs,其中,29个为低表达,28个为高表达。结论建立了哺乳动物miRNAs检测微阵列的技术平台,并筛选到乳腺癌miRNAs表达谱,为进一步研究其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础。

MicroRNA 122对肝癌细胞基因表达谱的影响

为研究microRNA(miR-122)对肝癌细胞Hep3B基因表达谱的影响,并探讨其在肝癌发生过程中的可能作用,构建了miR-122稳定高表达的Hep3B细胞,利用基因表达谱芯片技术筛选得到和对照组细胞比较的差异表达基因.研究结果显示,2倍以上变化的差异表达基因有490个,其中上调的有345个,下调的有145个.这些基因中有16个与肿瘤发生相关,其它基因涉及细胞周期、信号转导、细胞凋亡和细胞增殖分化等众多生物学过程.这些结果提示,miR-122可能在肝癌发生的过程中发挥作用,并可能与这些差异表达基因密切相关.另外,还结合生物信息学方法,在下调表达的基因中预测了miR-122可能直接作用的靶基因.本研究初步探讨了miR-122在肝癌细胞中的生物学功能,为进一步研究miR-122在肝癌发生中的作用奠定了基础,同时也为miRNA的生物学功能及其作用机制的研究提供了一些参考.

PCR-荧光探针法检测临床痰标本结核分枝杆菌的可靠性研究

目的评价PCR-荧光探针法快速检测Mtb和非结核分枝杆菌(NTM)的临床应用价值。方法应用分枝杆菌核酸检测试剂对1015例痰标本和56株临床分离株进行检测,与Mtb核酸扩增(PCR)荧光(目前临床上认可惟一同类产品)检测结果进行比较。采用SPSS 11.5统计软件进行数据统计处理,采用χ2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果PCR-荧光探针法检测痰标本分枝杆菌灵敏度50.3%(373/741),特异度98.9%(271/274);菌阳肺结核标本检测灵敏度97.0%(257/265),菌阴肺结核标本检测灵敏度24.4%(116/476);1015份痰标本中检测出11例非结核分枝杆菌(NTM)核酸阳性标本(占1.1%),经16SrDNA测序确认,准确率100.0%。随机数字量表法抽取138例标本重复进行第2次检测,符合率100.0%。对56株临床分离株(1株Mtb临床分离株,55株NTM临床分离株)检测,准确率100.0%。对临床需要的226份标本同时与达安公司试剂盒检测结果比较,总体符合率95.1%(215/226),经统计学分析,两者之间差异无统计学意义(χ2=2.98,P=0.226)。结论PCR-荧光探针法可快速检测和区分痰标本Mtb与NTM,具有临床推广应用价值。

十五项遗传性耳聋基因突变微阵列诊断芯片的临床应用研究

目的验证十五项遗传性耳聋基因检测试剂盒(微阵列芯片法)在临床耳聋基因检测的准确性及有效性。方法采用420例解放军总医院临床门诊病人或住院病人的全血,其中未携带突变的样本103例,携带基因突变样本317例,包括50例大前庭水管综合征患者;对血样进行随机编盲,并用十五项遗传性耳聋基因检测芯片检测,以九项遗传性耳聋基因检测试剂盒(微阵列芯片法)及测序法作为对比方法进行比较。结果检测结果显示,本组病人样本的各位点检测探针的灵敏度达100%,特异性达100%,与对比方法的检测结果一致性达100%;经χ2检验和Kappa值分析,两种方法的检测结果无显著性差异,一致性较好。结论十五项遗传性耳聋基因检测试剂盒(微阵列芯片法)的临床检测结果稳定、可靠,通量较高,基本满足临床遗传性耳聋基因检测需求,并进一步提高大前庭水管综合征(EVAS)患者的阳性检出率和确诊率。

北京部分地铁线路乘车人噪声暴露水平的初步研究

目的通过对北京5条地铁线路车厢内部噪声进行测量,并与噪声性聋的噪声暴露标准进行比较,对地铁车厢内的噪声防护措施进行分析和探讨。方法采用噪声分析系统对北京5条主要地铁线路(1号线、2号线、4号线+大兴线和5号线)的不同路段进行车厢内部噪声平均等效声级(Leq)、最大声压级(Lmax)、最小声压级(Lmin)、累计百分声压级(L10和L90)的测试以及未计权的最大声压级(Lpeak)的测量。结果在检测的北京地铁线路及其区间,车厢内的噪声Leq平均值都≥75dB A。1号线和2号线的Leq平均值相对较小,介于75～78dBA之间;而4号线+大兴线介于79～82dB A之间;5号线介于78～81dB A之间,均高于WHO关于噪声性聋的限值(每日24小时的平均噪声水平应在70dB A以下)。结论对于地铁内的工作人员和部分地铁乘车人(在地铁内用耳机长时间听音乐者),地铁的噪声污染有导致噪声性聋的潜在危险。避免在地铁内用耳机听音乐和使用防护性耳塞将有助于保护乘车人的听力健康。

慢性乙肝临床网络信息平台及样本库系统的建立与运行

慢性乙肝是严重危害我国人民健康和生命的公共卫生问题,建立规范化的大容量乙肝患者资源库对慢性乙肝诊断和治疗的临床研究具有重大意义。为此,我们组建了慢性乙肝临床网络信息平台及样本库系统,现将该系统的建立及运行情况做总体介绍。