[目的]基于网络药理学与分子对接方法探讨大陷胸汤治疗急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的药理作用机制。[方法]为获取大陷胸汤的主要化学成分,在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis...[目的]基于网络药理学与分子对接方法探讨大陷胸汤治疗急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的药理作用机制。[方法]为获取大陷胸汤的主要化学成分,在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库、中医药百科全书(Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)数据库、化学专业数据库进行检索并筛选潜在有效化合物,通过Swiss Target Prediction数据库对潜在有效成分进行靶点预测;使用人类基因数据库(Human Gene Database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、DisGeNet数据库、DrugBank数据库获取疾病目标靶点;结合STRING平台获取蛋白互作网络,并对关键靶点蛋白进行网络拓扑学指标分析;运用Metascape数据平台对成分与靶点参与的生物过程及通路进行分析,获取富集分析结果。使用Cytoscape 3.7.1软件构建成分、靶点与通路三者间的关联网络,最后通过AutoDock进行分子对接验证。[结果]大陷胸汤中筛选获得70个活性成分,160个作用靶点,1486个疾病靶点。基因本体(gene ontology,GO)富集分析中生物过程包含细胞对氮化合物的反应、肽反应、激酶活性调节、丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)级联调节等;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析显示关键通路为磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase-protein kinase B,PI3K-AKT)信号通路、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药(epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor resistance,EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance)信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products-receptor of advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路等,其功能主要为参与炎症反应与激酶活性调节,细胞稳态调节及细胞的增殖调控。分子对接结果显示,大部分核心靶点与主要成分之间结合活性良好。[结论]大陷胸汤干预AP的作用机制呈现成分、靶点、通路的多层级协同,其作用机制可能与大陷胸汤的活性成分对PI3K-AKT信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药信号通路及AGE-RAGE信号通路等产生协同调控作用有关。展开更多
背景:溃疡性结肠炎(UC)发病率高且易复发。目前已有大量系统评价/meta分析探讨了粪菌移植(FMT)治疗UC的疗效和安全性,但得出的结论并不相同,然而这些研究的质量尚未得到充分评估。目的:对FMT治疗UC的系统评价/meta分析进行再评价。方法...背景:溃疡性结肠炎(UC)发病率高且易复发。目前已有大量系统评价/meta分析探讨了粪菌移植(FMT)治疗UC的疗效和安全性,但得出的结论并不相同,然而这些研究的质量尚未得到充分评估。目的:对FMT治疗UC的系统评价/meta分析进行再评价。方法:计算机检索PubMed、Cochrane Library、Embase、Web of Science、中国知网、中国生物医学文献数据库、万方、维普等数据库,搜集FMT治疗UC的系统评价/meta分析,检索时间为建库至2023年5月。同时手工检索灰色文献并咨询专家。两名研究者交互进行文献筛选和提取资料。采用PRISMA报告清单、AMSTAR-2工具分别评估纳入研究的报告质量和方法学质量,同时基于GRADE系统对结局指标进行证据质量分级。结果:最终纳入17篇系统评价/meta分析,纳入原始研究包括随机对照试验和观察性研究,大多数研究对FMT治疗UC的有效性和安全性得出肯定结论。纳入研究的PRISMA报告清单评分为12.5~22.5分,平均为17.68分。3篇研究报告相对完整,10篇有一定缺陷,4篇有相对严重的报告缺陷。AMSTAR-2评分显示:2篇属中质量,3篇属低质量,12篇为极低质量。GRADE系统评级结果显示:8个结局指标中6个为中级,2个为低级。结论:FMT可能是一种安全有效的治疗UC的方法,但当前证据质量较低,临床证据使用者需谨慎对待以上证据。展开更多
文摘[目的]基于网络药理学与分子对接方法探讨大陷胸汤治疗急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的药理作用机制。[方法]为获取大陷胸汤的主要化学成分,在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库、中医药百科全书(Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)数据库、化学专业数据库进行检索并筛选潜在有效化合物,通过Swiss Target Prediction数据库对潜在有效成分进行靶点预测;使用人类基因数据库(Human Gene Database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、DisGeNet数据库、DrugBank数据库获取疾病目标靶点;结合STRING平台获取蛋白互作网络,并对关键靶点蛋白进行网络拓扑学指标分析;运用Metascape数据平台对成分与靶点参与的生物过程及通路进行分析,获取富集分析结果。使用Cytoscape 3.7.1软件构建成分、靶点与通路三者间的关联网络,最后通过AutoDock进行分子对接验证。[结果]大陷胸汤中筛选获得70个活性成分,160个作用靶点,1486个疾病靶点。基因本体(gene ontology,GO)富集分析中生物过程包含细胞对氮化合物的反应、肽反应、激酶活性调节、丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)级联调节等;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析显示关键通路为磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase-protein kinase B,PI3K-AKT)信号通路、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药(epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor resistance,EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance)信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products-receptor of advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路等,其功能主要为参与炎症反应与激酶活性调节,细胞稳态调节及细胞的增殖调控。分子对接结果显示,大部分核心靶点与主要成分之间结合活性良好。[结论]大陷胸汤干预AP的作用机制呈现成分、靶点、通路的多层级协同,其作用机制可能与大陷胸汤的活性成分对PI3K-AKT信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药信号通路及AGE-RAGE信号通路等产生协同调控作用有关。
文摘背景:溃疡性结肠炎(UC)发病率高且易复发。目前已有大量系统评价/meta分析探讨了粪菌移植(FMT)治疗UC的疗效和安全性,但得出的结论并不相同,然而这些研究的质量尚未得到充分评估。目的:对FMT治疗UC的系统评价/meta分析进行再评价。方法:计算机检索PubMed、Cochrane Library、Embase、Web of Science、中国知网、中国生物医学文献数据库、万方、维普等数据库,搜集FMT治疗UC的系统评价/meta分析,检索时间为建库至2023年5月。同时手工检索灰色文献并咨询专家。两名研究者交互进行文献筛选和提取资料。采用PRISMA报告清单、AMSTAR-2工具分别评估纳入研究的报告质量和方法学质量,同时基于GRADE系统对结局指标进行证据质量分级。结果:最终纳入17篇系统评价/meta分析,纳入原始研究包括随机对照试验和观察性研究,大多数研究对FMT治疗UC的有效性和安全性得出肯定结论。纳入研究的PRISMA报告清单评分为12.5~22.5分,平均为17.68分。3篇研究报告相对完整,10篇有一定缺陷,4篇有相对严重的报告缺陷。AMSTAR-2评分显示:2篇属中质量,3篇属低质量,12篇为极低质量。GRADE系统评级结果显示:8个结局指标中6个为中级,2个为低级。结论:FMT可能是一种安全有效的治疗UC的方法,但当前证据质量较低,临床证据使用者需谨慎对待以上证据。