厦门地区腹泻儿童A组轮状病毒基因型别流行特征

目的监测厦门地区岛内外4家不同医院门诊和住院腹泻患儿A组轮状病毒感染基因型特征,为防治轮状病毒感染所致腹泻提供基础数据和理论依据。方法对2016年1月至2017年12月厦门地区4家医院共5 787例年龄≤10岁腹泻患儿粪便样本进行免疫层析双抗体夹心法检测,按检测时间先后顺序对1 435例轮状病毒抗原阳性标本进行编号,再依序等间隔抽取98份轮状病毒阳性样本,采用反转录套式聚合酶链式反应对样本进行A组轮状病毒G基因型及P基因型分型检测。结果5 787例粪便标本中A组轮状病毒抗原阳性1 435例,检出率为24.8%。98份轮状病毒阳性样本进行基因分型G分型结果显示,G9型有68株(69.4%)为主要流行株,其次是G2型5株(5.1%),G1型4株(4.1%),G3型1株(1.0%),G未能分型20株;P分型P[8]型74株(75.5%)为主要流行株,P[4]型5株(5.1%),P未能分型19株。G/P组合基因型P[8]G9型检出63株(64.3%)为主要基因组合型,其次是P[4]G2型5株(5.1%),P[8]G1型4株(4.1%),P[8]G3型1株(1.0%)。结论轮状病毒是引起该地区患儿腹泻的主要病原体之一,P[8]G9型为主要基因组合型,持续监测A组轮状病毒基因型对该地区A组轮状病毒感染防控及疫苗准入是必要的。

厦门地区G9型A组轮状病毒7基因序列特征的分析

目的了解厦门地区G9型A组轮状病毒主要中和抗原VP7的编码基因进化遗传变异与国内外部分地区VP7基因的差异。方法4株G9型A组轮状病毒毒株来自厦门市儿童医院腹泻患儿的粪便样本,采集时间分别为2017年10月5日、2017年11月12日、2017年12月7日和2018年1月15日。采用反转录聚合酶链反应检测G9型A组轮状病毒VP7的基因全长序列,并用DNA Star、MEGA等生物学软件对测序后获得的基因序列进行同源性分析、系统进化分析,以及氨基酸序列比对。结果进化树分析显示,厦门地区Amoy CHINA/2018地方株与成都市human/SC7/CHN/2013/G9地方株联系最为密切,与江苏省Hu/JS2016地方株同源性较远。氨基酸序列比对分析显示,与参考株WI61相比,厦门地方株在氨基酸一级结构上存在变异,包括D100N、Y144H,这两个位点是进化树Amoy CHINA/2018簇内的代表性变异位点。结论G9型A组轮状病毒VP7的基因组全长序列显示该病毒株在我国存在进化变异。