基于分子对接研究甘油脱氢酶的催化多功能性

基于生物信息学的方法研究甘油脱氢酶的催化多功能性。通过Brenda数据库搜索,查找、归纳甘油脱氢酶(EC1.1.1.6,Glycerol dehydrogenase,GDH)的底物谱。利用分子模拟对接的方法,研究甘油脱氢酶和手性对映体R-1-氨基-2-丙醇和S-1-氨基-2-丙醇的结合模式,获得酶与底物结合的关键氨基酸残基位点为ASP123,THR177,SER243和GLU180。通过比较结合能,研究手性对映体与酶结合的差异性,阐明甘油脱氢酶对R-1-氨基-2-丙醇,S-1-氨基-2-丙醇选择性的来源。分子对接可以反映酶对手性化合物的识别能力,可用作研究甘油脱氢酶的催化多功能性的手性底物谱的初步筛选手段,节省研究时间和成本。