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乳腺导管原位癌浸润性进展相关基因的生物信息学研究
被引量:
3
1
作者
周军
麻怀露
+2 位作者
丁晓飞
梁勇
陈光
《浙江医学》
CAS
2019年第12期1249-1252,I0007,共5页
目的筛选介导乳腺导管原位癌(DCIS)浸润性进展的相关基因。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片(GEO)数据库下载含正常乳腺(NC)、DCIS和微小浸润乳腺癌(IBC)这3种类型样本的基因芯片;使用R软件包limma分析IBC与DCIS、DCIS...
目的筛选介导乳腺导管原位癌(DCIS)浸润性进展的相关基因。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片(GEO)数据库下载含正常乳腺(NC)、DCIS和微小浸润乳腺癌(IBC)这3种类型样本的基因芯片;使用R软件包limma分析IBC与DCIS、DCIS与NC之间的差异表达基因;使用STEM软件对上述两组差异表达基因进行趋势分析,筛选出随着NC-DCISIBC的趋势表达水平逐渐变化的基因;对筛选出的差异表达的基因进行KEGG信号通路富集分析。结果通过对差异基因的趋势分析,筛选出12个随着NC-DCIS-IBC的趋势表达显著下调的基因,以及10个显著上调的基因,其中运动神经元和胰腺同源盒1(MNX1)、基质金属蛋白酶1(MMP-1)可能为介导DCIS浸润性进展的相关基因。信号通路富集分析结果显示,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、黏附和细胞外基质/受体相互作用3个信号通路分子异常在DCIS发生及浸润性进展中均存在显著异常调控。结论MNX1、MMP-1可能为介导DCIS浸润性进展的相关基因,PI3K/AKT信号通路可能参与介导MNX1/MMP-1促进DCIS浸润性进展。
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关键词
乳腺癌
乳腺导管原位癌
浸润性癌
生物信息分析
下载PDF
职称材料
题名
乳腺导管原位癌浸润性进展相关基因的生物信息学研究
被引量:
3
1
作者
周军
麻怀露
丁晓飞
梁勇
陈光
机构
台州学院医学院药理室
出处
《浙江医学》
CAS
2019年第12期1249-1252,I0007,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(81802657)
文摘
目的筛选介导乳腺导管原位癌(DCIS)浸润性进展的相关基因。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片(GEO)数据库下载含正常乳腺(NC)、DCIS和微小浸润乳腺癌(IBC)这3种类型样本的基因芯片;使用R软件包limma分析IBC与DCIS、DCIS与NC之间的差异表达基因;使用STEM软件对上述两组差异表达基因进行趋势分析,筛选出随着NC-DCISIBC的趋势表达水平逐渐变化的基因;对筛选出的差异表达的基因进行KEGG信号通路富集分析。结果通过对差异基因的趋势分析,筛选出12个随着NC-DCIS-IBC的趋势表达显著下调的基因,以及10个显著上调的基因,其中运动神经元和胰腺同源盒1(MNX1)、基质金属蛋白酶1(MMP-1)可能为介导DCIS浸润性进展的相关基因。信号通路富集分析结果显示,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、黏附和细胞外基质/受体相互作用3个信号通路分子异常在DCIS发生及浸润性进展中均存在显著异常调控。结论MNX1、MMP-1可能为介导DCIS浸润性进展的相关基因,PI3K/AKT信号通路可能参与介导MNX1/MMP-1促进DCIS浸润性进展。
关键词
乳腺癌
乳腺导管原位癌
浸润性癌
生物信息分析
Keywords
Breastcancer
DCIS
IBC
Bioinformatics
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乳腺导管原位癌浸润性进展相关基因的生物信息学研究
周军
麻怀露
丁晓飞
梁勇
陈光
《浙江医学》
CAS
2019
3
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