基于小鼠肝细胞癌全转录组测序的Ighmbp2表达上调的机制

目的探讨免疫球蛋白μ结合蛋白2(Ighmbp2)在小鼠肝细胞癌(HCC)中上调表达的可能机制。方法20只小鼠注射生理盐水,收集其肝组织作为SL组。80只小鼠注射H22肝癌细胞系,分别收集注射3 d的小鼠的肝组织、30 d未成瘤小鼠的肝组织及成瘤小鼠的癌旁组织和瘤组织,分别作为H3L组、H30NL组、H30L组和H30T组。采用全转录组测序和生物信息学分析Ighmbp2基因在各组中的表达,并进一步采用华大基因多组学系统筛选差异表达的Ighmbp2相关基因,构建差异表达相关基因的PPI、Target以及ceRNA网络,分析其功能。结果与SL组相比,H3L组、H30NL组、H30L组和H30T组Ighmbp2基因表达均上调,其中H30T组中表达最高;组间比较显示,仅H30T组与其他四组间Ighmbp2基因的表达差异具有统计学意义(P<0.05)。PPI、Target和ceRNA调控网络显示,与Ighmbp2存在密切关系的转录本有5个、基因编码蛋白有43个,互为竞争性ceRNA的分子有143个,其中miR-107-5p、miR-3064-5p和miR-1968-5p在H30T组中的表达显著低于其他各组,转录本XM_006531702.1大量表达于各组,并且在H30T组的表达远高于其他组。GO和KEGG富集分析发现,Ighmbp2及其相关基因共同参与的功能包括核苷酸结合、ATP结合等,其中部分基因与Ighmbp2基因一样属于核、核仁等细胞组分。结论Ighmbp2基因的上调表达主要是转录本XM_006531702.1的上调表达;miR-107-5p、miR-3064-5p和miR-1968-5p这3种miRNA可能在瘤体组织中低表达从而减弱了抑制效应进而间接促进Ighmbp2在瘤体组织中的上调表达,其中miR-1968-5p可能是影响Ighmbp2表达的关键因素,多种相关分子可能与以上3种miRNA结合形成ceRNA调控机制进而进一步精细调控Ighmbp2的表达。

糖原合酶激酶-3,一个参与多种信号通路的重要调节因子

糖原合酶激酶-3(glycogen synthase kinase-3,GSK-3)是一种多功能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,在蛋白质合成、信号传递、细胞增殖、细胞分化、神经功能、肿瘤形成及胚胎发育等众多细胞进程中均扮演重要的角色.GSK-3能够使多种底物发生磷酸化,并参与胰岛素、Wnt及Hedgehog等多个信号通路的调控.GSK-3抑制剂在信号通路中能有效地抑制病理情况下GSK-3活性的异常增高,达到治疗的目的.GSK-3的抑制剂将作为一种潜在的药物对治疗糖尿病、阿尔海默茨症、肿瘤等疾病发挥效用.