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合肥市发热伴呼吸道症候群病原学检测结果分析
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作者 汤仁树 金晶 +3 位作者 赵科伕 朱引娣 宋永庆 张文艳 《安徽医学》 2023年第12期1497-1500,共4页
目的掌握合肥市发热伴呼吸道症候群病原谱的构成,为发热伴呼吸道症候群的防控、诊断与治疗提供科学依据。方法按照发热伴呼吸道症候群监测方案要求,采集哨点医院2019年2月至2020年11月符合发热伴呼吸道症候群病例定义患者的咽拭子或支... 目的掌握合肥市发热伴呼吸道症候群病原谱的构成,为发热伴呼吸道症候群的防控、诊断与治疗提供科学依据。方法按照发热伴呼吸道症候群监测方案要求,采集哨点医院2019年2月至2020年11月符合发热伴呼吸道症候群病例定义患者的咽拭子或支气管灌洗液,采用呼吸道病原体PCR检测技术,定性检测22种呼吸道病原体,对流感病毒阳性标本采样荧光PCR法进行分型,对结果进行统计分析。结果共收集251份呼吸道标本,检出阳性标本73份,阳性率为29.08%,有3份双重感染。单一阳性检出率前4位的病原体为呼吸道腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒和肺炎链球菌,阳性率分别为8.76%、5.98%、4.38%和3.58%。出现3个阳性检出峰:2019年夏季峰、2020年冬春季峰和2020年秋季峰。结论合肥市发热呼吸道症候群病原体主要为呼吸道腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒和肺炎链球菌,同时存在混合感染情况。 展开更多
关键词 呼吸道疾病 呼吸道感染 呼吸道腺病毒
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一起由金黄色葡萄球菌引起的食源性疾病的微生物检测与分析
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作者 陈少华 刘了了 彭康 《中国基层医药》 CAS 2023年第5期741-746,共6页
目的利用多种检测方法查明一起疑似细菌性食物中毒引起的食源性疾病的病因。方法2022年8月9日上午9时35分合肥市疾病预防控制中心处理的一起疑似食源性疾病事件,实验室检测结果初步显示为金黄色葡萄球菌(金葡菌)感染。运用实时荧光聚合... 目的利用多种检测方法查明一起疑似细菌性食物中毒引起的食源性疾病的病因。方法2022年8月9日上午9时35分合肥市疾病预防控制中心处理的一起疑似食源性疾病事件,实验室检测结果初步显示为金黄色葡萄球菌(金葡菌)感染。运用实时荧光聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测分离培养鉴定所得的16株金葡菌的肠毒素基因(SEA-SEE)。同时对分离出的16株不同来源的金葡菌菌株运用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术进行分子分型,分析菌株之间的相关性。结果分离到的16株金葡菌肠毒素(SEs)分布情况是李姓售卖员肛拭子和砧板(内)涂抹样为SEB型,其余14株都同时携带A、C、E型肠毒素基因。PFGE分型结果显示所有菌株分为2个型别,除李姓售卖员肛拭子和砧板(内)涂抹样外其他14株均为同一型别,相似度为100%。李姓售卖株员肛拭子和砧板(内)涂抹样相似度为80.65%,与另一型别相似度为59.26%。这一结果和SEs的检测结果基本一致。结论该例食源性疾病是由具有肠毒素的2种或3种不同来源的金葡菌混合污染引起的。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 肠毒素类 聚合酶链反应 电泳 凝胶 脉冲场 食物传播疾病
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合肥市肾综合征出血热疫源地健康者隐性感染情况调查 被引量:6
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作者 张磊 仰凤桃 +2 位作者 尤恩情 陆群 金晶 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期671-674,共4页
目的了解合肥市疫源地健康者肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)抗体水平和隐性感染的风险因素,为制定防治措施提供科学依据。方法采用多阶段抽样的方法采集246名≥3岁疫源地健康者血样,用酶联免疫吸附试验... 目的了解合肥市疫源地健康者肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)抗体水平和隐性感染的风险因素,为制定防治措施提供科学依据。方法采用多阶段抽样的方法采集246名≥3岁疫源地健康者血样,用酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)检测HFRS的Ig G抗体。采用自行设计调查表问卷调查226名成人,其隐性感染的风险因素采用多因素Logistic回归分析。结果 246名健康者,抗体阳性率为13.01%,抗体几何平均滴度(geometric mean of antibody titer,GMT)为1∶25.20。年龄和地区间阳性率和GMT差异有统计学意义(均有P〈0.05)。性别和职业类型阳性率和GMT差异无统计学意义(均有P〉0.05)。多因素分析结果显示,近1月昆虫叮咬史(OR=4.70,95%CI:1.25-17.77)、40-59岁人群(OR=3.50,95%CI:1.02-11.95)、近1月鼠类接触史(OR=3.39,95%CI:1.44-8.02)、近1月食用鼠排泄物污染的食物(OR=2.90,95%CI:1.24-6.80)是其危险因素。结论本次研究为HFRS防控工作提供了基线资料和依据。灭鼠防鼠是防控HFRS的首选措施,加强健康教育,定期开展抗体水平检测,有助于HFRS疫情的及时判断。 展开更多
关键词 肾综合征出血热 感染 流行病学研究
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2019年合肥市呼吸道腺病毒感染病例基因型别研究 被引量:1
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作者 汤仁树 张文艳 +3 位作者 金晶 周伟 刘玮 胡中旺 《中国卫生检验杂志》 CAS 2021年第17期2057-2059,共3页
目的分析合肥市2019年呼吸道腺病毒感染病例基因型别。方法收集2019年合肥市急性呼吸道感染聚集性病例和不明原因肺炎病例的腺病毒阳性呼吸道标本,采用PCR方法扩增六邻体基因片段,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析。结果共收集25份... 目的分析合肥市2019年呼吸道腺病毒感染病例基因型别。方法收集2019年合肥市急性呼吸道感染聚集性病例和不明原因肺炎病例的腺病毒阳性呼吸道标本,采用PCR方法扩增六邻体基因片段,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析。结果共收集25份呼吸道标本,腺病毒荧光PCR检测阳性23份,对其中的20份进行普通PCR扩增六邻体基因片段,成功扩增18份,经序列测定得17份基因序列,经Blast其中HAd V-3型11份、HAd V-7型6份。结论 2019年合肥市腺病毒感染病例基因型别分别为3型和7型。 展开更多
关键词 呼吸道腺病毒 急性呼吸道感染 六邻体
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一起疱疹性咽峡炎疫情病原学分析
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作者 朱引娣 金晶 +4 位作者 汤仁树 尤恩情 刘玮 周伟 张文艳 《安徽预防医学杂志》 2024年第1期71-74,共4页
目的 了解2020年合肥地区一起幼儿园疱疹性咽峡炎(HA)聚集性疫情病原体型别及基因进化情况。方法采用实时荧光定量RT-PCR方法对11份咽拭子标本进行肠道病毒(EV)病原检测,柯萨奇病毒A6型(CVA6)核酸阳性的标本经传统RT-PCR扩增VP1基因,进... 目的 了解2020年合肥地区一起幼儿园疱疹性咽峡炎(HA)聚集性疫情病原体型别及基因进化情况。方法采用实时荧光定量RT-PCR方法对11份咽拭子标本进行肠道病毒(EV)病原检测,柯萨奇病毒A6型(CVA6)核酸阳性的标本经传统RT-PCR扩增VP1基因,进行序列测定,用MEGA 6.0软件构建基因进化树。结果 11份咽拭子标本中6份CVA6核酸阳性,6条基因序列均为CVA6 D3亚型。结论 CVA6 D3型是引起本次幼儿园HA疫情的病原体,应加强对肠道病毒的监测,重视在幼托机构暴发的此类疫情。 展开更多
关键词 疱疹性咽峡炎 柯萨奇病毒A组6型 聚集性疫情 基因型
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2020-2021年安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型多样性分析 被引量:4
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作者 史永林 傅荔艳 +5 位作者 金晶 葛盈露 王鹏 程鹏 张文艳 孙永 《国际病毒学杂志》 2022年第2期103-108,共6页
目的了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本,荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组,采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合... 目的了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本,荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组,采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合酶区(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)和VP1区部分基因片段并测序。运用诺如病毒在线分型工具鉴定基因型别,利用MEGA 6.0软件构建RdRp和VP1区基因系统进化树。结果45起疫情142份诺如病毒核酸阳性标本中检出23份为GI阳性,占19%(23/142);119份为GII阳性,占81%(119/142)。20份GI阳性标本PCR扩增产物测序成功。获取的20株诺如病毒RdRp-VP1区序列有6种分型,包括2株GI.1[P1]、2株GI.3[P10]、5株GI.3[P13]、2株GI.4[P4]、7株GI.5[P4]、2株GI.6[P11]。系统进化树显示:GI.1[P1]型安徽株与韩国株(MZ021974)、法国株(MK956173)同属一个进化分支;GI.3[P10]和GI.3[P13]型安徽株与中国台湾株(MN922742)、四川株(MW255366)、韩国株(MZ022026)进化距离较近;GI.4[P4]和GI.5[P4]型安徽株与2019年湖南株(MN938461)、2021年广东株(OK562729)处于一个进化分支;GI.6[P11]型安徽株独立为一个进化簇,与陕西株(MW243609)、日本株(LC646339)进化距离较近。结论安徽省急性胃肠炎GI组诺如病毒基因型分布呈多样性,有必要开展感染性腹泻疫情分子溯源监测。 展开更多
关键词 诺如病毒 急性胃肠炎 基因型 进化特征
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丙型肝炎病毒基因分型及其分子流行病学研究进展 被引量:4
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作者 陈红霞 王海 +1 位作者 类延花 胡中旺 《国际病毒学杂志》 2019年第5期348-351,共4页
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染慢性化率高,并且容易发展为肝硬化和肝癌.HCV具有高度异质性,且HCV基因型与其传播途径、地域分布、人群分布有一定关系,本文就HCV的基因分型和分子流行病学进展进行综述.
关键词 丙型肝炎病毒 基因分型 流行病学
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