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2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析
1
作者
李响
魏雷雷
+8 位作者
黄飚
程涛
单元春
秦桂香
孙鸿燕
季尚玮
田鑫
付思美
王爽
《中华实验和临床病毒学杂志》
CAS
CSCD
2024年第5期521-526,共6页
目的分析2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)流行株基因型特征。方法收集吉林省2010—2023年VZV散发病例样本78份,选取经荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,Real-Time PCR)检测后CT<...
目的分析2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)流行株基因型特征。方法收集吉林省2010—2023年VZV散发病例样本78份,选取经荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,Real-Time PCR)检测后CT<25阳性标本26份,采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)扩增开放阅读框(Open reading framme,ORF)ORF22、ORF38及ORF62,扩增产物测序后根据ORF22的5个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNPs)位点(37902,38019,38055,38081和38177)和ORF38的1个SNP位点(69424),进行基因分型,根据ORF38的1个位点(69349)及ORF62的3个位点(106262、107252、108111)确定是疫苗株或野毒株。通过序列比对构建系统进化树。结果26份样本序列与Dumas株相比,SNPs(37902,38055,38081和38177)四个分型位点发生突变,与pOka株相同,均属于clade2分支,与Dumas和Baike株相比,26份样本均为野毒株。JL2016-4株在38059位点苏氨酸变为天冬胺酰,JL2021-4株在37933位点精氨酸变为脯氨酸,37935位点天冬氨酸变为酪氨酸,38031位点碱基天冬氨酸变为酪氨酸。JL2023-1株在37933位点精氨酸变为亮氨酸。结论吉林省2010—2023年连续14年均存在VZV流行,主要流行株属于clade2分支,应加强VZV暴发监测,提高VZV疫苗接种的覆盖率。
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关键词
水痘-带状疱疹病毒
单核苷酸多态性
基因型
分支
原文传递
题名
2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析
1
作者
李响
魏雷雷
黄飚
程涛
单元春
秦桂香
孙鸿燕
季尚玮
田鑫
付思美
王爽
机构
吉林
省疾病预防控制
中
心(
吉林
省预防医学科学院)
长春市传染病
医院
吉林大学中日联谊医院生物样本库
吉林大学
中
日
联谊
医院
传染科
出处
《中华实验和临床病毒学杂志》
CAS
CSCD
2024年第5期521-526,共6页
基金
吉林省卫生健康科技能力提升项目(2023GW005,2023GW006,2021GW014)
吉林省科技发展计划(20240304200SF)
+1 种基金
中华预防医学会"疫苗与免疫青年人才托举项目"(20190206)
吉林省"长白山领军人才"支持经费资助。
文摘
目的分析2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)流行株基因型特征。方法收集吉林省2010—2023年VZV散发病例样本78份,选取经荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,Real-Time PCR)检测后CT<25阳性标本26份,采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)扩增开放阅读框(Open reading framme,ORF)ORF22、ORF38及ORF62,扩增产物测序后根据ORF22的5个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNPs)位点(37902,38019,38055,38081和38177)和ORF38的1个SNP位点(69424),进行基因分型,根据ORF38的1个位点(69349)及ORF62的3个位点(106262、107252、108111)确定是疫苗株或野毒株。通过序列比对构建系统进化树。结果26份样本序列与Dumas株相比,SNPs(37902,38055,38081和38177)四个分型位点发生突变,与pOka株相同,均属于clade2分支,与Dumas和Baike株相比,26份样本均为野毒株。JL2016-4株在38059位点苏氨酸变为天冬胺酰,JL2021-4株在37933位点精氨酸变为脯氨酸,37935位点天冬氨酸变为酪氨酸,38031位点碱基天冬氨酸变为酪氨酸。JL2023-1株在37933位点精氨酸变为亮氨酸。结论吉林省2010—2023年连续14年均存在VZV流行,主要流行株属于clade2分支,应加强VZV暴发监测,提高VZV疫苗接种的覆盖率。
关键词
水痘-带状疱疹病毒
单核苷酸多态性
基因型
分支
Keywords
Varicella-zoster virus
Single nucleotide polymorphism
Genotype
Clade
分类号
S85 [农业科学—兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析
李响
魏雷雷
黄飚
程涛
单元春
秦桂香
孙鸿燕
季尚玮
田鑫
付思美
王爽
《中华实验和临床病毒学杂志》
CAS
CSCD
2024
0
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已选择
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