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2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析
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作者 李响 魏雷雷 +8 位作者 黄飚 程涛 单元春 秦桂香 孙鸿燕 季尚玮 田鑫 付思美 王爽 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2024年第5期521-526,共6页
目的分析2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)流行株基因型特征。方法收集吉林省2010—2023年VZV散发病例样本78份,选取经荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,Real-Time PCR)检测后CT<... 目的分析2010—2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)流行株基因型特征。方法收集吉林省2010—2023年VZV散发病例样本78份,选取经荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,Real-Time PCR)检测后CT<25阳性标本26份,采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)扩增开放阅读框(Open reading framme,ORF)ORF22、ORF38及ORF62,扩增产物测序后根据ORF22的5个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNPs)位点(37902,38019,38055,38081和38177)和ORF38的1个SNP位点(69424),进行基因分型,根据ORF38的1个位点(69349)及ORF62的3个位点(106262、107252、108111)确定是疫苗株或野毒株。通过序列比对构建系统进化树。结果26份样本序列与Dumas株相比,SNPs(37902,38055,38081和38177)四个分型位点发生突变,与pOka株相同,均属于clade2分支,与Dumas和Baike株相比,26份样本均为野毒株。JL2016-4株在38059位点苏氨酸变为天冬胺酰,JL2021-4株在37933位点精氨酸变为脯氨酸,37935位点天冬氨酸变为酪氨酸,38031位点碱基天冬氨酸变为酪氨酸。JL2023-1株在37933位点精氨酸变为亮氨酸。结论吉林省2010—2023年连续14年均存在VZV流行,主要流行株属于clade2分支,应加强VZV暴发监测,提高VZV疫苗接种的覆盖率。 展开更多
关键词 水痘-带状疱疹病毒 单核苷酸多态性 基因型 分支
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