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长春地区人与猪戊型肝炎病毒分子流行病学及部分基因序列分析
被引量:
12
1
作者
孙中锋
金宁一
+4 位作者
朱光泽
屈勇刚
李红文
金扩世
田明尧
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期941-945,共5页
目的 分析长春地区猪和人群流行的戊型肝炎病毒的系统进化关系。方法 参照文献设计引物.对长春地区猪和人群流行的8株HEV(其中3株来源于人,5株来源于猪)进行RT-PCR,并将RT-PCR产物克隆到PMD18-T载体。筛选阳性重组质粒测序,测序...
目的 分析长春地区猪和人群流行的戊型肝炎病毒的系统进化关系。方法 参照文献设计引物.对长春地区猪和人群流行的8株HEV(其中3株来源于人,5株来源于猪)进行RT-PCR,并将RT-PCR产物克隆到PMD18-T载体。筛选阳性重组质粒测序,测序结果采用Clustal X v.1.8进行多重比对分析,并与基因1~4型HEV代表株的核苷酸及氨基酸进行同源性比较。绘制遗传进化树。结果 本研究获得的8株HEV核苷酸同源性在91.2%~99.1%。推导氨基酸同源性在97.4%~100%之间;基因1~4型内各株序列间同源性分别为:87.9%~100%,100%,85.9%~96.6%。84.8%~100%。结论 研究表明获得的长春各株病毒均属基因4型。由进化关系看长春地区猪HEV与人HEV可能由同一毒株进化而来。
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关键词
戊型肝炎病毒
系统进化分析
同源性
序列测定
多重比对
下载PDF
职称材料
题名
长春地区人与猪戊型肝炎病毒分子流行病学及部分基因序列分析
被引量:
12
1
作者
孙中锋
金宁一
朱光泽
屈勇刚
李红文
金扩世
田明尧
机构
吉林大学畜牧畜医学院
解放军军事
医学
科
学院
兽医研究所
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期941-945,共5页
基金
国家"973"计划资助项目(No.2005CB523005)
文摘
目的 分析长春地区猪和人群流行的戊型肝炎病毒的系统进化关系。方法 参照文献设计引物.对长春地区猪和人群流行的8株HEV(其中3株来源于人,5株来源于猪)进行RT-PCR,并将RT-PCR产物克隆到PMD18-T载体。筛选阳性重组质粒测序,测序结果采用Clustal X v.1.8进行多重比对分析,并与基因1~4型HEV代表株的核苷酸及氨基酸进行同源性比较。绘制遗传进化树。结果 本研究获得的8株HEV核苷酸同源性在91.2%~99.1%。推导氨基酸同源性在97.4%~100%之间;基因1~4型内各株序列间同源性分别为:87.9%~100%,100%,85.9%~96.6%。84.8%~100%。结论 研究表明获得的长春各株病毒均属基因4型。由进化关系看长春地区猪HEV与人HEV可能由同一毒株进化而来。
关键词
戊型肝炎病毒
系统进化分析
同源性
序列测定
多重比对
Keywords
hepatitis E virus , phylogeny analysis , homology, sequencing, multiple alignment
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长春地区人与猪戊型肝炎病毒分子流行病学及部分基因序列分析
孙中锋
金宁一
朱光泽
屈勇刚
李红文
金扩世
田明尧
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
12
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