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长春地区人与猪戊型肝炎病毒分子流行病学及部分基因序列分析 被引量:12
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作者 孙中锋 金宁一 +4 位作者 朱光泽 屈勇刚 李红文 金扩世 田明尧 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期941-945,共5页
目的 分析长春地区猪和人群流行的戊型肝炎病毒的系统进化关系。方法 参照文献设计引物.对长春地区猪和人群流行的8株HEV(其中3株来源于人,5株来源于猪)进行RT-PCR,并将RT-PCR产物克隆到PMD18-T载体。筛选阳性重组质粒测序,测序... 目的 分析长春地区猪和人群流行的戊型肝炎病毒的系统进化关系。方法 参照文献设计引物.对长春地区猪和人群流行的8株HEV(其中3株来源于人,5株来源于猪)进行RT-PCR,并将RT-PCR产物克隆到PMD18-T载体。筛选阳性重组质粒测序,测序结果采用Clustal X v.1.8进行多重比对分析,并与基因1~4型HEV代表株的核苷酸及氨基酸进行同源性比较。绘制遗传进化树。结果 本研究获得的8株HEV核苷酸同源性在91.2%~99.1%。推导氨基酸同源性在97.4%~100%之间;基因1~4型内各株序列间同源性分别为:87.9%~100%,100%,85.9%~96.6%。84.8%~100%。结论 研究表明获得的长春各株病毒均属基因4型。由进化关系看长春地区猪HEV与人HEV可能由同一毒株进化而来。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 系统进化分析 同源性 序列测定 多重比对
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