基于shotgun技术对鹿茸蛋白质组学的初步分析

目的利用Shotgun方法分析吉林双阳梅花鹿生长期鹿茸蛋白组分,完善鹿茸蛋白质表达谱的分析。方法先将新鲜鹿茸高速匀浆取上清;硫酸铵沉淀获取鹿茸总蛋白粗提物,DEAE纯化获取蛋白组分I;行溶液内酶解、毛细管高效液相色谱方法/质谱shotgun分析,所得数据按照IPI号对蛋白进行GO功能在线分析。结果鹿茸蛋白组分I共有38个蛋白质,注释蛋白34个;其中,高丰度蛋白质8个;参与生物过程的蛋白质占鹿茸蛋白组分I总量的20.5%;参与细胞成分的蛋白质占总量的38.2%;参与分子功能的占总量的44.1%。鉴定出的蛋白质细胞内外分布平衡,已知最多的蛋白质为具有结合功能的蛋白质。结论 Shotgun方法可有效分离和分析鹿茸蛋白质组分,为鹿茸蛋白组学的研究提供了基础理论数据。