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CD14和IL-8基因多态性与新生儿坏死性小肠结肠炎易感性的关联性分析
被引量:
9
1
作者
田佳怡
朱彤
+2 位作者
王健
房明丽
严超英
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期958-962,共5页
目的:探讨白细胞分化抗原14(CD14)-159C/T(rs2569190)和白细胞介素8(IL-8)-251A/T(rs4073)基因多态性与坏死性小肠结肠炎(NEC)易感性之间的关系,阐明NEC易感性的可能影响因素,为NEC的发病机制研究提供遗传学理论依据。方法...
目的:探讨白细胞分化抗原14(CD14)-159C/T(rs2569190)和白细胞介素8(IL-8)-251A/T(rs4073)基因多态性与坏死性小肠结肠炎(NEC)易感性之间的关系,阐明NEC易感性的可能影响因素,为NEC的发病机制研究提供遗传学理论依据。方法:选取28例NEC新生儿(NEC组)和41例非NEC新生儿(对照组)作为研究对象,提取并应用基因聚合酶链式反应(PCR)扩增其外周血DNA,并采用Sanger基因测序方法,检测CD14-159C/T和IL-8-251A/T区域的等位基因频数和基因型频数的分布,探讨其与NEC易感性的关联性。结果:CD14-159C/T和IL-8-251A/T位点基因型频数分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P〉0.05);CD14-159C/T的等位基因和基因型频数分布在2组间比较差异无统计学意义(P〉0.05);IL-8-251A/T位点的基因型频数分布在2组间比较差异无统计学意义(P〉0.05);而NEC组IL8-251A/T基因位点T等位基因频数分布高于对照组(χ~2=4.184,P=0.041,OR=2.14,95%CI:1.03~4.46)。结论:CD14-159C/T的基因位点多态性和NEC的发病无关联,而IL-8基因的-251T位点与NEC发病易感性存在关联,IL-8基因的-251T等位基因突变可能是NEC的危险因素之一。
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关键词
坏死性小肠结肠炎
白细胞分化抗原14
白细胞介素-8
单核苷酸多态性
下载PDF
职称材料
实时荧光定量PCR法检测人粪便中双歧杆菌方法的建立及评价
被引量:
6
2
作者
张力文
王宗润
+2 位作者
吴秀丽
房明丽
张云峰
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期686-691,共6页
目的:建立利用实时荧光定量PCR法检测人粪便中双歧杆菌浓度的方法,为检测人肠道内菌群浓度提供有效手段。方法:提取60例儿童粪便样本中细菌总DNA。选择细菌种属的特异性基因16SrRNA作为扩增区,依据双歧杆菌的16 SrRNA序列共设计3条...
目的:建立利用实时荧光定量PCR法检测人粪便中双歧杆菌浓度的方法,为检测人肠道内菌群浓度提供有效手段。方法:提取60例儿童粪便样本中细菌总DNA。选择细菌种属的特异性基因16SrRNA作为扩增区,依据双歧杆菌的16 SrRNA序列共设计3条引物,以常规 PCR扩增出的16 SrRNA部分基因片段制作标准品,应用 SYBR Green Ⅰ双链嵌合染料,对连续稀释的标准品及待测样本进行分析,建立绝对定量的标准曲线,同时计算出待测样本双歧杆菌浓度;根据可检测到的标准品最低拷贝数计算反应灵敏度;分析 PCR产物熔解曲线评价反应特异性;重复检测梯度稀释的标准品,用相同浓度标准品的Ct值变异系数(CV)评价反应稳定性。结果:常规PCR扩增出双歧杆菌16SrRNA部分基因片段长度约为613 bp,测序结果正确,成功构建了双歧杆菌实时荧光定量PCR反应中的标准品;生成的标准曲线R2=0.999,最低检测限度为每个反应1.48&#215;102个拷贝;实时荧光定量PCR产物的熔解曲线为单峰。对待测样本分批进行荧光定量 PCR检测,各组间每微升1.48×10^3~1.48×10^7个拷贝浓度标准品Ct值的变异系数为2.94%、3.39%、3.54%、3.08%和3.34%。60份儿童粪便样本双歧杆菌浓度对数值为7.77±0.86(拷贝数·-1湿便)。结论:本研究所建立的实时荧光定量 PCR法敏感性高、特异性强,且重复性好,适用于检测人粪便中双歧杆菌的浓度。
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关键词
实时荧光定量聚合酶链式反应
引物
标准曲线
双歧杆菌
下载PDF
职称材料
题名
CD14和IL-8基因多态性与新生儿坏死性小肠结肠炎易感性的关联性分析
被引量:
9
1
作者
田佳怡
朱彤
王健
房明丽
严超英
机构
吉林大学
第一
医院
新生
儿科
吉林大学第一医院儿科研究所
出处
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期958-962,共5页
基金
吉林省科技厅自然科学基金资助课题(3D513S393428)
文摘
目的:探讨白细胞分化抗原14(CD14)-159C/T(rs2569190)和白细胞介素8(IL-8)-251A/T(rs4073)基因多态性与坏死性小肠结肠炎(NEC)易感性之间的关系,阐明NEC易感性的可能影响因素,为NEC的发病机制研究提供遗传学理论依据。方法:选取28例NEC新生儿(NEC组)和41例非NEC新生儿(对照组)作为研究对象,提取并应用基因聚合酶链式反应(PCR)扩增其外周血DNA,并采用Sanger基因测序方法,检测CD14-159C/T和IL-8-251A/T区域的等位基因频数和基因型频数的分布,探讨其与NEC易感性的关联性。结果:CD14-159C/T和IL-8-251A/T位点基因型频数分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P〉0.05);CD14-159C/T的等位基因和基因型频数分布在2组间比较差异无统计学意义(P〉0.05);IL-8-251A/T位点的基因型频数分布在2组间比较差异无统计学意义(P〉0.05);而NEC组IL8-251A/T基因位点T等位基因频数分布高于对照组(χ~2=4.184,P=0.041,OR=2.14,95%CI:1.03~4.46)。结论:CD14-159C/T的基因位点多态性和NEC的发病无关联,而IL-8基因的-251T位点与NEC发病易感性存在关联,IL-8基因的-251T等位基因突变可能是NEC的危险因素之一。
关键词
坏死性小肠结肠炎
白细胞分化抗原14
白细胞介素-8
单核苷酸多态性
Keywords
necrotizing enterocolitis
single nucleotide polymorphism
分类号
R722.19 [医药卫生—儿科]
下载PDF
职称材料
题名
实时荧光定量PCR法检测人粪便中双歧杆菌方法的建立及评价
被引量:
6
2
作者
张力文
王宗润
吴秀丽
房明丽
张云峰
机构
吉林大学
第一
医院
小儿呼吸一科
吉林大学第一医院儿科研究所
吉林大学
基础医学院分子生物学教研室
出处
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期686-691,共6页
基金
国家自然科学基金青年基金资助课题(813000021006165)
文摘
目的:建立利用实时荧光定量PCR法检测人粪便中双歧杆菌浓度的方法,为检测人肠道内菌群浓度提供有效手段。方法:提取60例儿童粪便样本中细菌总DNA。选择细菌种属的特异性基因16SrRNA作为扩增区,依据双歧杆菌的16 SrRNA序列共设计3条引物,以常规 PCR扩增出的16 SrRNA部分基因片段制作标准品,应用 SYBR Green Ⅰ双链嵌合染料,对连续稀释的标准品及待测样本进行分析,建立绝对定量的标准曲线,同时计算出待测样本双歧杆菌浓度;根据可检测到的标准品最低拷贝数计算反应灵敏度;分析 PCR产物熔解曲线评价反应特异性;重复检测梯度稀释的标准品,用相同浓度标准品的Ct值变异系数(CV)评价反应稳定性。结果:常规PCR扩增出双歧杆菌16SrRNA部分基因片段长度约为613 bp,测序结果正确,成功构建了双歧杆菌实时荧光定量PCR反应中的标准品;生成的标准曲线R2=0.999,最低检测限度为每个反应1.48&#215;102个拷贝;实时荧光定量PCR产物的熔解曲线为单峰。对待测样本分批进行荧光定量 PCR检测,各组间每微升1.48×10^3~1.48×10^7个拷贝浓度标准品Ct值的变异系数为2.94%、3.39%、3.54%、3.08%和3.34%。60份儿童粪便样本双歧杆菌浓度对数值为7.77±0.86(拷贝数·-1湿便)。结论:本研究所建立的实时荧光定量 PCR法敏感性高、特异性强,且重复性好,适用于检测人粪便中双歧杆菌的浓度。
关键词
实时荧光定量聚合酶链式反应
引物
标准曲线
双歧杆菌
Keywords
real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction
primer
standard curve
bifidobacteria
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CD14和IL-8基因多态性与新生儿坏死性小肠结肠炎易感性的关联性分析
田佳怡
朱彤
王健
房明丽
严超英
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016
9
下载PDF
职称材料
2
实时荧光定量PCR法检测人粪便中双歧杆菌方法的建立及评价
张力文
王宗润
吴秀丽
房明丽
张云峰
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014
6
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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