RNA测序观察低氧培养环境下卵巢癌细胞内管家基因表达的变化

卵巢癌是危害女性健康的主要恶性肿瘤之一。阐明卵巢癌发生和进展的分子机制有助于提升卵巢癌诊断与治疗水平。明确卵巢癌细胞在不同病理与生理条件下差异基因表达模式是研究其分子机制重要途径。实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)是一种快速有效的检测细胞内基因表达水平的技术^([1])。在基因表达分析中,需要控制不同样本之间总体转录活性差异的变量,使用内部控制(参考)基因是最常用的方法。

低氧环境下生长的卵巢癌细胞株SKOV3的转录组分析

目的 探讨卵巢癌细胞在常氧与低氧环境培养下mRNA表达谱的差异。方法 将卵巢癌细胞株SKOV3置于低氧(2%)与常氧(21%)环境下培养,应用氧探针进行细胞乏氧状态检测,应用高通量测序对细胞内整体的mRNA进行测序,应用生物信息学分析工具对测序结果进行基因表达差异分析与功能富集分析,应用逆转录实时荧光定量PCR进行相关差异基因表达的进一步验证。结果 与常氧培养的细胞相比,在低氧环境下培养的细胞共有999个基因表达显著上调,646个基因表达显著下调。这些表达差异基因参与细胞外基质形成、细胞黏附、糖酵解、纤毛组装等生物学过程以及癌症信号、PI3K-AKT信号、RNA转运以及肿瘤胆碱代谢等信号通路。逆转录实时荧光定量PCR结果验证了低氧组的HILPDA、MT1B、CA9、MT1X与LOX-L2基因表达明显高于常氧组,而低氧组的WARS1、CHAC1、PSAT1、UPP1与DDX5基因表达明显低于常氧组。结论 本研究揭示了在不同浓度氧环境下卵巢癌细胞mRNA转录水平差异表达的相关基因及分子通路,为进一步探讨低氧环境对卵巢癌细胞生长影响的潜在分子机制提供实验基础。

肺癌患者外周血淋巴细胞亚群计数水平的比较分析

目的探究肺癌患者外周血淋巴细胞亚群计数水平变化及临床意义。方法收集长春肿瘤医院2021年1月至2021年12月收治的190例肺癌患者,并选择同期体检的24例健康人作为对照组。应用流式细胞术检测外周血淋巴细胞亚群细胞(包括CD3^(+)、CD3^(+)CD4^(+)、CD3^(+)CD8^(+)、CD3-CD19^(+)与CD3-CD56^(+))绝对计数与百分比,分析肺癌患者与健康人群之间,不同病理类型、不同临床分期肺癌患者的淋巴细胞亚群计数水平的差异。结果肺癌患者淋巴细胞各亚群绝对计数均低于健康人群(P<0.05),CD3^(+)细胞与CD3^(+)CD4^(+)T细胞百分比低于健康人群,而CD3^(+)CD8^(+)T细胞百分比高于健康人群(P<0.05)。非小细胞肺癌患者淋巴各亚群绝对计数水平明显高于小细胞肺癌患者(P<0.05),CD3^(+)细胞百分比低于健康人群和小细胞肺癌患者而CD3-CD56^(+)细胞百分比高于健康人群和小细胞肺癌患者(P<0.05)。随临床分期的进展,在非小细胞肺癌CD3^(+)细胞与CD3^(+)CD4^(+)T细胞百分比呈现递减趋势(P<0.05),在小细胞肺癌无差异。结论肺癌患者的免疫功能较健康人群减弱,且随着肺癌分期的进展其免疫功能减弱的程度递增,非小细胞肺癌患者的免疫功能减弱以T淋巴细胞主导的细胞免疫功能低下为主,而小细胞肺癌患者免疫功能减弱以NK自然杀伤细胞功能低下更为显著。

BRAF V600E基因突变与甲状腺癌病理生物学特点及其靶向治疗的研究进展

BRAF基因突变在甲状腺癌发病机制中具有重要意义,由此促进了甲状腺癌分子发病机制领域的研究进展。BRAF基因突变将导致MAPK通路的持续活化,引发细胞异常增殖,进而导致肿瘤的发生发展。BRAF基因最常见的突变为第1799位碱基由胸腺嘧啶错义突变为腺嘌呤(T1799A),导致其翻译的缬氨酸变为谷氨酸,即BRAF V600E基因突变。BRAF V600E基因突变与甲状旁腺浸润、淋巴结转移和复发具有明显的相关性。并且,BRAF V600E基因突变对于指导甲状腺癌的初始治疗方式、控制放射碘治疗的剂量和预后的判断也具有重要的意义。目前,针对该突变的靶向药物也正处于试验阶段。本文将对甲状腺癌领域的BRAF基因突变的最新研究进展综述。

RAS基因家族在实体瘤中突变率的研究进展

RAS基因家族包含3种原癌基因,即KRAS、NRAS和HRAS。在多种肿瘤中RAS基因突变使其激活成为有致癌活性的癌基因。点突变、表达量升高以及插入/转位突变等是其常见的激活方式。深入了解RAS基因家族的突变特征以及其在各种肿瘤中的发生率,可以对肿瘤的发生、发展、早期诊断、靶向治疗以及预后起到很好的指导作用。本文分别从KRAS基因突变、NRAS基因突变以及HRAS基因突变3个方面,对RAS基因家族在实体瘤中突变率的研究进展进行文献回顾。

长春地区2051例女性人乳头瘤病毒检测基因类型及感染人群特征分析

目的观察人乳头瘤病毒在吉林省长春地区女性人群的感染状况及感染人群特征,为本地区HPV感染引发的疾病的防治提供理论依据。方法应用聚合酶链式反应(PCR)-膜斑点杂交技术对2020年10月至2021年11月在医院体检和就诊的2051例不同年龄的女性患者采集的宫颈脱落细胞标本进行6种低危型和15种高危型HPV检测。结果2051例受检者检出HPV阳性为329例,总阳性率为16.05%。检出20种HPV亚型,HPV42基因型未被检出,其中高危型为310例(占15.12%),低危型为19例(占0.93%)。高危HPV优势亚型阳性率居前5位的是HPV16(3.61%)、HPV52(2.93%)、HPV58(2.10%)、HPV53(1.76%)和HPV31(1.22%);单一HPV基因型别感染率为12.48%,双重感染率为2.09%,三重及以上感染率为0.54%。高危HPV阳性率最高是60岁以上人群(占21.54%),其次为15~30年龄段人群(占19.33%)。结论长春地区女性HPV感染率低于国内平均感染率,感染HPV以单一型别感染为主,其中高危型HPV16、52及58亚型为主要感染型别;感染年龄段以60岁以上人群及年轻人(小于30岁)为主,需要针对不同年龄段易感人群定期进行HPV核酸检测及基因分型筛查。