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吉林省2011年手足口病死亡病例肠道病毒71型分离株全基因组基因特征分析
被引量:
1
1
作者
魏雷雷
周剑惠
+8 位作者
黄飚
邓立权
王爽
李可维
单元春
杨尧
曹凤瑞
程涛
付思美
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2017年第11期1146-1149,共4页
目的分析吉林省2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)死亡病例标本中分离获得的肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)毒株全基因组基因特征。方法采用分段RT-PCR法对2011年吉林省HFMD死亡病例EV71分离株JL2011-56全基因组进...
目的分析吉林省2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)死亡病例标本中分离获得的肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)毒株全基因组基因特征。方法采用分段RT-PCR法对2011年吉林省HFMD死亡病例EV71分离株JL2011-56全基因组进行扩增和测序。利用Clustal X2和MEGA5软件构建分离株JL2011-56与Gen Bank中27株参考株的全基因组序列和VP1区全基因组序列的进化树,分析Jl2011-56株的流行病学特征;同时与Gen Bank中12株C4a基因亚型参考株进行全基因组核苷酸和氨基酸序列的同源性分析。结果 JL2011-56分离株属于C4a亚型,核苷酸序列和氨基酸序列与山东分离株SDLY107(JX244186.1)同源性最高,分别为99.2%和99.5%,与EV71原型株Br Cr的同源性分别为79.9%和95.7%。结论 JL2011-56分离株与山东株亲缘关系较近,可能存在共同的与中枢神经毒力相关的氨基酸突变位点。
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关键词
手足口病
肠道病毒71型
全基因组
原文传递
题名
吉林省2011年手足口病死亡病例肠道病毒71型分离株全基因组基因特征分析
被引量:
1
1
作者
魏雷雷
周剑惠
黄飚
邓立权
王爽
李可维
单元春
杨尧
曹凤瑞
程涛
付思美
机构
吉林省卫生监测检验中心病毒所
吉林省
疾病预防控制
中心
免疫规划所
出处
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2017年第11期1146-1149,共4页
基金
吉林省人社厅2010年度留学回国人员科技创新创业项目(2010-27)
国家科学技术艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项传染病监测技术平台项目(2012ZX10004209-003)
文摘
目的分析吉林省2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)死亡病例标本中分离获得的肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)毒株全基因组基因特征。方法采用分段RT-PCR法对2011年吉林省HFMD死亡病例EV71分离株JL2011-56全基因组进行扩增和测序。利用Clustal X2和MEGA5软件构建分离株JL2011-56与Gen Bank中27株参考株的全基因组序列和VP1区全基因组序列的进化树,分析Jl2011-56株的流行病学特征;同时与Gen Bank中12株C4a基因亚型参考株进行全基因组核苷酸和氨基酸序列的同源性分析。结果 JL2011-56分离株属于C4a亚型,核苷酸序列和氨基酸序列与山东分离株SDLY107(JX244186.1)同源性最高,分别为99.2%和99.5%,与EV71原型株Br Cr的同源性分别为79.9%和95.7%。结论 JL2011-56分离株与山东株亲缘关系较近,可能存在共同的与中枢神经毒力相关的氨基酸突变位点。
关键词
手足口病
肠道病毒71型
全基因组
Keywords
Hand, foot and mouth disease (HFMD)
Enterovirus 71 (EV71)
Whole genome
分类号
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
Q789 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
吉林省2011年手足口病死亡病例肠道病毒71型分离株全基因组基因特征分析
魏雷雷
周剑惠
黄飚
邓立权
王爽
李可维
单元春
杨尧
曹凤瑞
程涛
付思美
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2017
1
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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