长链非编码RNA在非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药中的研究进展

携带表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者经EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs),如吉非替尼长期治疗后,其中的绝大部分患者会最终发生获得性耐药,导致疾病进展。EGFR-TKIs耐药涉及多种机制。目前对长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在EGFR-TKIs耐药中的作用还知之甚少。本文旨在对lncRNAs在NSCLC EGFR-TKIs耐药中的研究进展进行综述。

厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌细胞的差异表达mRNAs和lncRNAs分析

目的筛选并分析厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌细胞的差异表达mRNAs和lncRNAs。方法在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中挑选数据集GSE80344,其数据来自厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞。通过GEO2R和探针匹配分析差异表达mRNAs和lncRNAs,筛选标准为|Fold change|>1.5,P value<0.01。通过Panther(http://www.pantherdb.org)、KEGG(http://www.kegg.jp/)、STRING(http://string-db.org)等数据库分析筛选得到的差异表达mRNAs和lncRNAs的可能的作用机制。通过TCGA(https://cancergenome.nih.gov/)数据库对筛选得到的关键mRNAs和lncRNAs进行生存分析验证。结果厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞相比,差异表达mRNAs共644个,差异表达lncRNAs共367个,其中128 mRNAs表达上调,516 mRNAs表达下调;137 lncRNAs表达上调,230 lncRNAs表达下调。这些mRNAs和lncRNAs主要涉及在PI3K-Akt、Ras、MAPK、ECM受体相互作用等与癌症密切相关的信号通路中发挥作用。基于数据库的分析验证结果与筛选结果一致。结论筛选分析得到的关健mRNAs和lncRNAs可为深入研究非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药机制的前期实验依据。