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基于GWAS数据分析肠道菌群与脑出血的关系 被引量:1
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作者 林迪慧 刘新鹏 +3 位作者 黎祺 秦家碧 熊震东 吴欣锐 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1176-1184,共9页
目的:自发性脑出血(intracerebral hemorrhage,ICH)在脑卒中各亚型中病死率、致残率最高,既往研究表明肠道菌群(gut microbiome,GM)与ICH的危险因素和病理基础密切相关。本研究旨在探索两者的因果关联及GM对ICH发病的潜在作用机制。方法... 目的:自发性脑出血(intracerebral hemorrhage,ICH)在脑卒中各亚型中病死率、致残率最高,既往研究表明肠道菌群(gut microbiome,GM)与ICH的危险因素和病理基础密切相关。本研究旨在探索两者的因果关联及GM对ICH发病的潜在作用机制。方法:从微生物基因组联盟及国际脑卒中协会获取有关GM和ICH的全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)数据,对GWAS数据使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探讨GM与ICH的因果关联,运用条件错误发现率(conditional false discovery rate,cFDR)法识别两者的多效性易感遗传变异。结果:MR分析结果显示:Pasteurellales目、Pasteurellaceae科、Haemophilus属的GM与ICH有负向因果效应;Verrucomicrobiae纲、Verrucomicrobiales目、Verrucomicrobiaceae科、Akkermansia属、Holdemanella属和LachnospiraceaeUCG010属的GM与ICH有正向因果效应。通过cFDR法识别出GM与ICH的3个多效性遗传位点,分别为rs331083、rs4315115和rs12553325。结论:GM与ICH发病存在因果关联和多效性易感遗传变异。 展开更多
关键词 肠道菌群 脑出血 孟德尔随机化 条件错误发现率 全基因组关联分析
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