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基于GWAS数据分析肠道菌群与脑出血的关系
被引量:
1
1
作者
林迪慧
刘新鹏
+3 位作者
黎祺
秦家碧
熊震东
吴欣锐
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1176-1184,共9页
目的:自发性脑出血(intracerebral hemorrhage,ICH)在脑卒中各亚型中病死率、致残率最高,既往研究表明肠道菌群(gut microbiome,GM)与ICH的危险因素和病理基础密切相关。本研究旨在探索两者的因果关联及GM对ICH发病的潜在作用机制。方法...
目的:自发性脑出血(intracerebral hemorrhage,ICH)在脑卒中各亚型中病死率、致残率最高,既往研究表明肠道菌群(gut microbiome,GM)与ICH的危险因素和病理基础密切相关。本研究旨在探索两者的因果关联及GM对ICH发病的潜在作用机制。方法:从微生物基因组联盟及国际脑卒中协会获取有关GM和ICH的全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)数据,对GWAS数据使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探讨GM与ICH的因果关联,运用条件错误发现率(conditional false discovery rate,cFDR)法识别两者的多效性易感遗传变异。结果:MR分析结果显示:Pasteurellales目、Pasteurellaceae科、Haemophilus属的GM与ICH有负向因果效应;Verrucomicrobiae纲、Verrucomicrobiales目、Verrucomicrobiaceae科、Akkermansia属、Holdemanella属和LachnospiraceaeUCG010属的GM与ICH有正向因果效应。通过cFDR法识别出GM与ICH的3个多效性遗传位点,分别为rs331083、rs4315115和rs12553325。结论:GM与ICH发病存在因果关联和多效性易感遗传变异。
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关键词
肠道菌群
脑出血
孟德尔随机化
条件错误发现率
全基因组关联分析
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题名
基于GWAS数据分析肠道菌群与脑出血的关系
被引量:
1
1
作者
林迪慧
刘新鹏
黎祺
秦家碧
熊震东
吴欣锐
机构
吉首大学医学院公共卫生与医学技术系
湘西土家族苗族自治州疾病预防控制中心
中南
大学
湘雅
公共
卫生
学院
流行病与
卫生
统计学
系
出处
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1176-1184,共9页
基金
国家自然科学基金(82073653)
湖南省自然科学基金(2022JJ10087,2022JJ40343)
+2 种基金
湖南省教育厅科学研究项目(21B0513)
湖南省卫生健康委员会科研计划项目(202212053368)
吉首大学校级科研项目(Jdx22035)。
文摘
目的:自发性脑出血(intracerebral hemorrhage,ICH)在脑卒中各亚型中病死率、致残率最高,既往研究表明肠道菌群(gut microbiome,GM)与ICH的危险因素和病理基础密切相关。本研究旨在探索两者的因果关联及GM对ICH发病的潜在作用机制。方法:从微生物基因组联盟及国际脑卒中协会获取有关GM和ICH的全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)数据,对GWAS数据使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探讨GM与ICH的因果关联,运用条件错误发现率(conditional false discovery rate,cFDR)法识别两者的多效性易感遗传变异。结果:MR分析结果显示:Pasteurellales目、Pasteurellaceae科、Haemophilus属的GM与ICH有负向因果效应;Verrucomicrobiae纲、Verrucomicrobiales目、Verrucomicrobiaceae科、Akkermansia属、Holdemanella属和LachnospiraceaeUCG010属的GM与ICH有正向因果效应。通过cFDR法识别出GM与ICH的3个多效性遗传位点,分别为rs331083、rs4315115和rs12553325。结论:GM与ICH发病存在因果关联和多效性易感遗传变异。
关键词
肠道菌群
脑出血
孟德尔随机化
条件错误发现率
全基因组关联分析
Keywords
gut microbiome
intracerebral hemorrhage
Mendelian randomization
conditional false discovery rate
genome wide association study
分类号
R743.34 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于GWAS数据分析肠道菌群与脑出血的关系
林迪慧
刘新鹏
黎祺
秦家碧
熊震东
吴欣锐
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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