基于ITS2序列及二级结构对易混淆药材牛尾独活、当归、独活和羌活的鉴别研究

本文利用ITS2序列及其二级结构对传统中药材牛尾独活、当归、独活和羌活进行分类鉴定。通过GenBank数据库中下载牛尾独活等药材共7个物种26条ITS序列,采用隐马尔可夫模型注释获得ITS2序列。采用MEGA软件计算种内、种间K2P遗传距离,构建NJ系统发育树。同时利用ITS2 Database预测各样本ITS2二级结构,并利用4Sale软件比对一级结构和二级结构的联合矩阵,最终采用ProfDistS软件基于距离法构建PNJ进化树。结果表明,各样本种间平均遗传距离均远大于种内平均遗传距离,各药材间存在明显的Barcoding Gap;系统发育树显示各样本均独立分支;样本间的二级结构均有一定的差异;PNJ进化树比NJ树显示出更高的分辨率。因此,本研究建议将ITS2作为鉴别药材牛尾独活、当归、独活和羌活及其基源植物的DNA条形码,为4种中药材的分类与准确鉴定提供一定的科学依据。