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采用基于Gene Ontology的聚类方法研究白血病的遗传异质性
被引量:
3
1
作者
肖国华
李永进
+6 位作者
郭政
彭春方
王栋
朱晶
杨达
姚晨
王靖
《生物信息学》
2008年第1期9-11,共3页
采用基因表达谱可以研究基因功能模块与疾病异质性之间的关系。根据两套白血病基因表达谱数据,将富集高变异基因的Gene Ontology基因功能模块作为特征功能模块,将疾病样本聚为两类。通过对比原始多类标签,采用聚类评估指标来分析两类化...
采用基因表达谱可以研究基因功能模块与疾病异质性之间的关系。根据两套白血病基因表达谱数据,将富集高变异基因的Gene Ontology基因功能模块作为特征功能模块,将疾病样本聚为两类。通过对比原始多类标签,采用聚类评估指标来分析两类化聚类结果的效果,并探讨特征功能模块与疾病异质性之间的关系。实验结果显示:在两套不同的白血病基因表达谱数据中得到的特征功能模块类似,它们对白血病亚型有较强的分型能力。
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关键词
基因表达谱
GENE
ONTOLOGY
聚类分析
遗传异质性
下载PDF
职称材料
题名
采用基于Gene Ontology的聚类方法研究白血病的遗传异质性
被引量:
3
1
作者
肖国华
李永进
郭政
彭春方
王栋
朱晶
杨达
姚晨
王靖
机构
哈尔滨医科大学生物信息学系与黑龙江省生物医药省部共建国家重点实验室培育基地
出处
《生物信息学》
2008年第1期9-11,共3页
基金
国家自然科学基金(30370388
30670539)资助项目
文摘
采用基因表达谱可以研究基因功能模块与疾病异质性之间的关系。根据两套白血病基因表达谱数据,将富集高变异基因的Gene Ontology基因功能模块作为特征功能模块,将疾病样本聚为两类。通过对比原始多类标签,采用聚类评估指标来分析两类化聚类结果的效果,并探讨特征功能模块与疾病异质性之间的关系。实验结果显示:在两套不同的白血病基因表达谱数据中得到的特征功能模块类似,它们对白血病亚型有较强的分型能力。
关键词
基因表达谱
GENE
ONTOLOGY
聚类分析
遗传异质性
Keywords
gene expression profile
Gene Ontology
clustering method
genetic heterogeneity
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
采用基于Gene Ontology的聚类方法研究白血病的遗传异质性
肖国华
李永进
郭政
彭春方
王栋
朱晶
杨达
姚晨
王靖
《生物信息学》
2008
3
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