基于TCGA和HADb数据库筛选自噬相关基因在舌癌中的差异表达及对预后的影响

目的:探讨自噬相关基因(ATG)在舌癌发病机制中的作用,以建立一个基于ATG表达谱的舌癌患者预后预测模型。方法:基于TCGA和HADb数据库,采用Wilcox检验方法确定舌癌中差异表达的ATG,COX回归分析ATG与舌癌患者总生存率的相关性;GO、KEGG分析揭示舌癌中与自噬基因相关的信号通路和生物学过程;评价ATG与舌癌患者临床性状之间的关系。结果:舌癌组织和癌旁组织的ATG具有差异性表达,5个差异基因(VEGFA、ATG9B、WDR45、BAK1、VAMP3)与舌癌患者的总生存率显著相关,可预测患者预后生存;GO、KEGG分析显示多条关键自噬相关通路显著富集,如细胞凋亡、P53信号通路、自噬功能、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药等;ATG9B、VEGFA、WDR45等ATG与患者不同临床病理特征具有显著相关性。结论:VEGFA、ATG9B、WDR45、BAK1、VAMP3等差异自噬基因可预测舌癌的预后。