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猪胸膜肺炎放线杆菌、肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌联合检测芯片的研制及应用
被引量:
5
1
作者
肖国生
曹三杰
+1 位作者
黄小波
文心田
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期77-85,共9页
本研究旨在建立联合检测胸膜肺炎放线杆菌、猪肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌的DNA芯片。用7个从3种病菌基因组中扩增出的不同特异性靶DNA制作基因芯片,并对芯片的靶DNA和探针浓度、杂交温度、重复性、特异性和灵敏度进行了研究。结果表明...
本研究旨在建立联合检测胸膜肺炎放线杆菌、猪肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌的DNA芯片。用7个从3种病菌基因组中扩增出的不同特异性靶DNA制作基因芯片,并对芯片的靶DNA和探针浓度、杂交温度、重复性、特异性和灵敏度进行了研究。结果表明,检测芯片的特异性强,能与测试的李氏放线杆菌、猪鼻支原体和副猪嗜血杆菌等9种病原区分;灵敏度高,在50μL标记反应体系中,能检测到10~50 pg基组DNA,芯片可重复利用。用芯片对44株目标菌的不同型标准菌株、分离株和疫苗株进行了检测,其信号值≥1 000,信号噪音比(SNR)≥6。用芯片对45头病猪和97头健康猪的临床样品选择培养物进行了检测,其检出率分别为多杀性巴氏杆菌71.1%和49.5%、胸膜肺炎放线杆菌42.2%和26.8%、猪肺炎支原体20%和22.7%,混合感染率分别为42.2%和24.7%。在检测临床样品时,芯片法与PCR的符合率为97.8%~100%,与分离鉴定法的符合率为87.6%~95.6%。研究表明,研制的芯片特异性强、敏感性高、可重复使用,是一种能有效用于胸膜肺炎放线杆菌、猪多杀性巴氏杆菌和猪肺炎支原体鉴定和联合检测的新工具。
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关键词
基因芯片
胸膜肺炎放线杆菌
猪肺炎支原体
多杀性巴氏杆菌
检测
下载PDF
职称材料
猪多杀性巴氏杆菌5:A型Ts-8株psl基因的克隆和序列分析
被引量:
3
2
作者
肖国生
曹三杰
+1 位作者
黄小波
文心田
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2008年第4期108-110,114,共4页
根据禽多杀性巴氏杆菌psl基因序列,设计了1对引物,从猪源多杀性巴氏杆菌5:A型Ts-8株中扩增出453bp的psl基因,将其克隆到pMD18-T载体后测序。序列分析表明,该基因与禽多杀性巴氏杆菌T16株的psl基因序列只相差2个碱基,同源性高达99%;与流...
根据禽多杀性巴氏杆菌psl基因序列,设计了1对引物,从猪源多杀性巴氏杆菌5:A型Ts-8株中扩增出453bp的psl基因,将其克隆到pMD18-T载体后测序。序列分析表明,该基因与禽多杀性巴氏杆菌T16株的psl基因序列只相差2个碱基,同源性高达99%;与流感嗜血杆菌编码P6蛋白的基因序列同源性为83%。猪psl基因的推导氨基酸序列与禽psl基因、P6蛋白的氨基酸序列同源性分别为100%,87%。结果表明,多杀性巴氏杆菌psl基因在猪和禽的菌株中是高度保守的,而且与P6蛋白的氨基酸序列具有较高的同源性。
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关键词
猪多杀性巴氏杆菌
psl基因
克隆
序列分析
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职称材料
题名
猪胸膜肺炎放线杆菌、肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌联合检测芯片的研制及应用
被引量:
5
1
作者
肖国生
曹三杰
黄小波
文心田
机构
四川农业大学动物医学院基因芯片实验室/动物疫病与人类健康四川省重点实验室
重庆三峡
学院
生物系
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期77-85,共9页
基金
教育部长江学者和创新团队发展计划基金资助项目(IRT0848)
重庆市科委自然科学基金计划资助项目(CSTC
2009BB5235)
文摘
本研究旨在建立联合检测胸膜肺炎放线杆菌、猪肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌的DNA芯片。用7个从3种病菌基因组中扩增出的不同特异性靶DNA制作基因芯片,并对芯片的靶DNA和探针浓度、杂交温度、重复性、特异性和灵敏度进行了研究。结果表明,检测芯片的特异性强,能与测试的李氏放线杆菌、猪鼻支原体和副猪嗜血杆菌等9种病原区分;灵敏度高,在50μL标记反应体系中,能检测到10~50 pg基组DNA,芯片可重复利用。用芯片对44株目标菌的不同型标准菌株、分离株和疫苗株进行了检测,其信号值≥1 000,信号噪音比(SNR)≥6。用芯片对45头病猪和97头健康猪的临床样品选择培养物进行了检测,其检出率分别为多杀性巴氏杆菌71.1%和49.5%、胸膜肺炎放线杆菌42.2%和26.8%、猪肺炎支原体20%和22.7%,混合感染率分别为42.2%和24.7%。在检测临床样品时,芯片法与PCR的符合率为97.8%~100%,与分离鉴定法的符合率为87.6%~95.6%。研究表明,研制的芯片特异性强、敏感性高、可重复使用,是一种能有效用于胸膜肺炎放线杆菌、猪多杀性巴氏杆菌和猪肺炎支原体鉴定和联合检测的新工具。
关键词
基因芯片
胸膜肺炎放线杆菌
猪肺炎支原体
多杀性巴氏杆菌
检测
Keywords
microarray
Actinobacillus pleuropneumoniae
Mycoplasma hyopneumoniae
Pasteurella multocida
detection
分类号
S858.282.6 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
猪多杀性巴氏杆菌5:A型Ts-8株psl基因的克隆和序列分析
被引量:
3
2
作者
肖国生
曹三杰
黄小波
文心田
机构
重庆三峡
学院
生物系
四川农业大学动物医学院基因芯片实验室/动物疫病与人类健康四川省重点实验室
出处
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2008年第4期108-110,114,共4页
基金
重庆三峡学院科研项目(2006-SXXYRC-09,2007-SXXYYB-02)
文摘
根据禽多杀性巴氏杆菌psl基因序列,设计了1对引物,从猪源多杀性巴氏杆菌5:A型Ts-8株中扩增出453bp的psl基因,将其克隆到pMD18-T载体后测序。序列分析表明,该基因与禽多杀性巴氏杆菌T16株的psl基因序列只相差2个碱基,同源性高达99%;与流感嗜血杆菌编码P6蛋白的基因序列同源性为83%。猪psl基因的推导氨基酸序列与禽psl基因、P6蛋白的氨基酸序列同源性分别为100%,87%。结果表明,多杀性巴氏杆菌psl基因在猪和禽的菌株中是高度保守的,而且与P6蛋白的氨基酸序列具有较高的同源性。
关键词
猪多杀性巴氏杆菌
psl基因
克隆
序列分析
Keywords
Pasteurella raultocida
psl gene
Cloning
Sequence analysis
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪胸膜肺炎放线杆菌、肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌联合检测芯片的研制及应用
肖国生
曹三杰
黄小波
文心田
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
下载PDF
职称材料
2
猪多杀性巴氏杆菌5:A型Ts-8株psl基因的克隆和序列分析
肖国生
曹三杰
黄小波
文心田
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2008
3
下载PDF
职称材料
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