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胸膜肺炎放线杆菌荚膜多糖输出基因部分序列的克隆鉴定、序列拼接和分析应用 被引量:1
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作者 肖国生 曹三杰 +4 位作者 段丽丽 文心田 肖驰 马晓平 杨利 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期325-329,共5页
用设计的引物对胸膜肺炎放线杆菌1、3、6、9型标准株的荚膜多糖输出部分基因序列进行了扩增,克隆,测序,分别获得4个型的部分cpxDC基因序列和3型的部分cpxD基因序列。对克隆序列和GenBank中已知序列进行序列拼接,分别拼接出1、3、6... 用设计的引物对胸膜肺炎放线杆菌1、3、6、9型标准株的荚膜多糖输出部分基因序列进行了扩增,克隆,测序,分别获得4个型的部分cpxDC基因序列和3型的部分cpxD基因序列。对克隆序列和GenBank中已知序列进行序列拼接,分别拼接出1、3、6型的荚膜输出cpxD基因全序列。通过基因序列分析发现,胸膜肺炎放线杆菌1、3、5、6、9型荚膜多糖输出基因已知序列间的同源性很高,达89%~99.88%。1、3、5、6型cpxD基因的推导氨基酸序列间的同源性为93%~99%。在cpxDC基因的保守区内设计出1对种特异性引物,对胸膜肺炎放线杆菌进行鉴定和检测,结果从8个标准型菌株和3株分离株中均扩出约720bp的阳性片段,其他6种能引起猪呼吸道疾病的细菌均呈阴性。所建立的PCR方法最低检出量为10Pg,最适模板量为5ng(50ptL)。试验结果表明,胸膜肺炎放线杆菌不同血清型间的荚膜多糖输出基因存在着高度的保守性。设计出的种特异性引物能用于胸膜肺炎放线杆菌的检测和鉴定。 展开更多
关键词 胸膜肺炎放线杆茵 荚膜多糖输出基因 克隆鉴定 序列拼接 PCR
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