四川7个地方山羊品种(类群)mtDNA遗传多样性研究

测定了四川7个地方山羊品种（类群）43个个体的mtDNA控制区全序列，结果表明：山羊mtDNA控制区全序列长度为1212bp或1213bp，A＋T含量（59．9％）明显高于G＋c含量（40．1％）。共检测到74个变异位点，序列均为中性突变，核苷酸多样度为1．686％，这些差异共定义了27种单倍型，单倍型多样度为0．966，遗传多样性较为丰富，品种（类群）间存在不同程度的遗传分化。7个地方山羊品种（类群）间的遗传距离变异范围为0．0017～0．0306。用MEGA软件的NJ法构建单倍型序列的系统发育无根树，结果表明四川地方山羊品种（类群）有两个母系来源，但是否就对应于角笋骨羊（Capra aegagrus）和捻角山羊（Capra falconeri）两个野生祖先，还有待于进一步研究。

基于Cytb基因多态性研究西藏地区8个藏山羊群体遗传结构及母系起源

旨在基于Cytb基因多态性探讨藏山羊群体间遗传结构及其母系起源。对西藏8个地区157只藏山羊的细胞色素b基因(Cytb)全序列进行扩增和测序,分析群体遗传多样性,计算群体间遗传分化指数,构建系统发育邻接树等。结果显示,藏山羊Cytb全序列为1 140bp,在8个群体中共检测到33个变异位点,定义了30种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.736和0.001 8,表明西藏地区藏山羊群体具有较丰富的遗传多样性。78.6%的群体间发生了显著的遗传分化(P<0.05),组内群体间的变异极显著(F_(SC)=0.321,P<0.001);系统发育邻接树分为了4个单倍型组(Haplogroup A-D),提示藏山羊有4个母系起源;单倍型网络图显示,不同地理来源的藏山羊没有完全聚类在同一群簇。在历史驯养过程中,藏山羊发生过群体扩增事件。本研究表明,西藏地区藏山羊有4个母系起源,并呈现出较丰富的遗传多样性,虽然群体间有一定程度的遗传分化,但没有形成明显的地理分隔格局,遗传结构差异在缩小。本研究结果为藏山羊遗传资源的保护和利用提供了科学依据。

我国优质麻鸭育种研究现状

我国肉鸭业产值居世界第一,在我国畜牧业中占有重要地位。由于各地区消费习惯差异及消费观念的转变,我国肉鸭产业呈现多元化发展趋势,优质麻鸭产业拥有巨大的发展空间。文章分析了优质麻鸭市场现状与发展趋势,归纳了优质麻鸭的现阶段育种目标、主要思路和基本环节,同时对优质麻鸭遗传繁育研究现状进行了总结,以期为优质麻鸭的育种提供一定参考。

二郎山山地鸡两品系主要繁殖性状遗传参数的估计及分析

近年来随着统计与计算方法的不断完善,基于动物模型的BLUP（Best linear unbiased prediction）已被广泛应用于畜禽的遗传评定中[1]。畜禽评定的准确性取决与对这些性状遗传规律——性状遗传参数的了解。

四川部分山羊品种(系)产奶量及乳营养分析

母羊泌乳量高低及乳的营养是影响羔羊成活及生长速度的两个重要因素。本实验对四川4个山羊品种(系)的产奶量及乳的常规营养成分进行研究。结果表明:4个山羊品种(系)产奶量高低顺序为天府肉羊>简阳大耳羊>乐至黑山羊>营山黑山羊,依次为(84.28±5.11)、(81.90±3.27)、(80.63±4.48)、(65.08±2.43)kg。产后48h内初乳中的干物质和蛋白质含量均迅速下降;脂肪含量先上升后下降,然后再上升;乳糖含量差异不大,相对稳定于4～5g/100mL之间。产后2h时蛋白水平高低为营山黑山羊>天府肉羊>乐至黑山羊>简阳大耳羊;乳中干物质含量为天府肉羊>营山黑山羊>乐至黑山羊>简阳大耳羊;脂肪含量为乐至黑山羊>简阳大耳羊>天府肉羊>营山黑山羊;乳糖含量为简阳大耳羊>乐至黑山羊>天府肉羊>营山黑山羊。2月龄所测定的常乳中,蛋白质与干物质含量最高的为天府肉羊,脂肪含量最高的为营山黑山羊,乳糖含量最高的为简阳大耳羊。

新西兰白兔生长性状的遗传参数估计

【目的】对新西兰白兔不同生长日龄体重和平均日增重进行遗传分析。【方法】利用成都市爱华畜牧科技有限公司种兔场2011-2013年的生长性状记录，采用多性状动物模型约束性最大似然法（REML）对新西兰白兔35、42、56、70、84日龄的5个体重性状，35～42、42～56、56～70、70～84日龄的4个平均日增重性状进行遗传参数估计。【结果】结果表明，新西兰白兔35、42、56、70、84日龄体重的遗传力分别是0.63、0.46、0.43、0.42、0.39。各日龄间体重呈强正遗传相关，相邻日龄间的遗传相关较其他日龄间强。35～42、42～56、56～70、70～84日龄平均日增重的遗传力分别是0.30、0.36、0.31、0.21。4个平均日增重间呈弱遗传相关。【结论】为新西兰白兔育种方案的制定和选育工作提供了理论基础。

改善猪肉质性状的分子育种方法

本文对利用分子育种方法鉴定猪肉质相关基因和标记的研究进行综述。家畜基因组序列的大量解读为鉴定复杂性状的候选基因和QTL效应提供了丰富的信息。猪基因组序列的解读,为研究猪的生物学系统提供了基础知识,并且还为其育种选择提供了理论依据。在基因组学这个领域中,功能基因组学和蛋白质组学能够同时关注许多基因和蛋白质的变化,从而更好地了解基因的功能和调控以及基因是怎样参与到复杂表型性状的控制网络中。特别是对mRNA和蛋白质水平的全基因组表达谱的研究可以更好地为肉质性状相关生物学功能和生理学过程的研究提供非常有用的工具。此外,利用生物信息学工具将基因组学和蛋白质组学整合起来也是充分挖掘分子育种信息的基础。这些知识的发展将有益于科学家和养殖户将分子数据应用到育种程序中,进而改进传统育种选择方案的效率和准确度。

四川某规模化奶牛场乳成分变化规律及相关性分析

本研究测定了四川某规模化奶牛场头胎荷斯坦牛泌乳初期的常规乳成分,分析了该牧场不同泌乳阶段常规乳成分变化以及不同乳成分之间的相关性,以期为该奶牛场实际生产提供科学的指导。结果表明,该奶牛场的牛奶品质良好,不同泌乳阶段的乳成分差异达到显著水平(P<0.05),各乳成分含量变化密切相关。

饲粮策略对不同遗传品系二郎山山地鸡生产性能和屠宰性能的影响

本试验旨在研究饲粮策略对不同遗传品系和性别的二郎山山地鸡生产性能和屠宰性能的影响。试验采用4×2×2因子设计,4个二郎山山地鸡遗传品系、2个饲粮策略、公母2个性别。每个处理公母各4个重复,每个重复30只鸡,共计1 920只。试验考察了山地鸡各阶段的生产性能、28 d血清生化指标及67 d屠宰性能。结果表明：饲粮策略对各阶段二郎山山地鸡采食量无显著影响（P〉0.05）,高赖氨酸饲粮显著提高了山地鸡1~67 d死淘率（P〈0.05）,极显著提高了山地鸡67 d体重、1~67 d体增重（P〈0.01）,显著降低了1~49 d（P〈0.05）和1~67 d料重比（P〈0.01）,但对山地鸡屠宰率、半净膛率、全净膛率、左胸肌率、左腿肌率无显著影响（P〉0.05）,对67 d胸肌肉色及屠宰后45 min pH也无显著影响（P〉0.05）。品系SD02的28、67 d体重和1~28 d、1~49 d和1~67 d体增重在各品系中均最高,且遗传品系均极显著影响以上指标（P〈0.01）;品系SD0302的49 d体重最高,品系SD02次之,均极显著高于品系SD0203（P〈0.01）;品系SD0302和SD02的1~28 d采食量显著高于其他2个品系（P〈0.05）;品系SD02的屠宰率、腹脂率均显著低于另外3个品系（P〈0.05）。饲粮策略、性别和遗传品系之间在山地鸡67 d体重、1~67 d体增重上表现了极显著的交互效应（P〈0.01）。综上所述,高赖氨酸饲粮策略可显著改善二郎山山地鸡67 d体重、1~67 d体增重、1~49 d和1~67 d料重比;对生产性能和屠宰性能综合评估可知,4个遗传品系优劣顺序为：品系SD0302、SD02〉品系SD03〉品系SD0203;各遗传品系公鸡的生产性能均优于母鸡;饲粮策略、性别和遗传品系之间在体增重上表现了显著的互作效应,应区别饲养。

长链非编码RNA H19对哺乳动物肌肉生长发育的调控

作为最早被鉴定的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)之一,H19在动物机体内发挥着广泛的作用,不仅可以作为肿瘤抑制因子和致癌基因参与疾病的发生过程,还参与对哺乳动物胚胎各组织生长发育的调控。其中,H19对哺乳动物肌肉组织(包括骨骼肌和心肌)发育的调控受到广泛关注。目前研究发现,H19可通过顺式调控Igf2促进骨骼肌卫星细胞(skeletal muscle satellite cells,SMSCs)的成肌分化和肌肉的生成;H19也可反式作用于靶标基因参与肌肉生长发育过程,如作为"分子海绵"结合let-7、mi R-106、mi R-29等,影响肌肉细胞中葡萄糖的摄取、心肌细胞增殖和肌腱修复等过程,或作为染色质修饰因子结合MBD1蛋白促进胚胎发育和肌肉再生。本文综述了H19对哺乳动物肌肉生长发育调控的研究进展,以期为进一步阐明肌肉生长发育的分子调控机制提供参考。

基于RAD-seq简化基因组测序的西藏黄牛遗传多样性研究

为在基因组水平研究西藏黄牛的遗传多样性,并通过选择信号分析发掘重要种质特性基因,利用RAD-seq简化基因组测序鉴定拉萨黄牛、阿沛甲咂牛、日喀则驼峰牛和樟木黄牛的SNP标记,计算群体遗传结构和遗传进化,鉴定基因组受选择区域和受选择基因。结果表明,共鉴定出1355274个SNP标记。阿沛甲咂牛和樟木黄牛遗传多样性最为丰富,观察杂合度分别为0.1856、0.1644,核苷酸多样性分别为0.2022、0.2026,拉萨黄牛和日喀则驼峰牛的遗传多样性相对低些。近交系数最高的为阿沛甲咂牛,而日喀则驼峰牛的近交系数最低。拉萨黄牛与日喀则驼峰牛之间的遗传分化系数最高(0.0927),而樟木黄牛和阿沛甲咂牛之间的遗传分化系数最低(-0.0011)。聚类分析结果表明,日喀则驼峰牛和阿沛甲咂牛之间的亲缘关系最近,而与樟木黄牛的亲缘关系最远。通过选择信号分析,在西藏黄牛群体中检测出22个基因组区域受到选择,包含96个受选择基因。GO富集分析表明,这些受选择基因显著富集在心血管系统发育、炎症反应、细胞间连接、染色质结合等生物学通路。本研究从基因组水平揭示西藏黄牛的种质特性,为进一步开展西藏黄牛种质资源保护及利用提供了重要理论依据。

基因及其顺式调控元件在动物表型进化中的作用

顺式调控假说是当前进化发育生物学中重要的理论之一,该假说认为顺式调控元件的进化是调控外表性状进化的主要遗传机制。然而越来越多的实验结果表明,仅靠顺式调控假说远不足以解释复杂的进化发育过程,其他因素也会导致表型的进化,如:与顺式调控元件相联基因的蛋白序列改变;基因及染色体组复制;蛋白结构域与顺式调控元件的灵活性等。文章回顾了近年来顺式调控元件以及与顺式调控元件相联基因的进化发育研究,探讨了进化发育生物学研究的新方法与新思路。

动物肝细胞生长因子(HGF)基因生物信息学分析

肝细胞生长因子（HGF）是一种多功能细胞因子。最初发现HGF具有调节肝脏生长的重要功能，随着研究的不断深入，其生物学功能也逐渐被揭示。

热应激状态下牛血清生化指标、miRNA表达变化及其相关性分析

本研究旨在探索热应激对牛miRNA表达量和血清生化指标的影响及其相互关系,筛选牛血清中与热应激相关的调控因子。选择20头体况相近、饲养管理一致的红安格斯公牛,分别于热应激期和非热应激期采集血样,进行血清生化指标及miRNA表达量的测定。结果表明,与非热应激期相比,热应激下血清Cl-浓度、LDH活性显著升高(P<0.05),MDA含量极显著升高(P<0.01);T-AOC活性、GSH-Px活性、IgA含量、IgG含量显著降低(P<0.05),SOD活性、IL-2含量极显著降低(P<0.01)。对血清miRNA定量分析发现,miR-181a、miR-486表达量显著下调(P<0.05),分别与IgA、IL-2含量均呈显著正相关(P<0.05),分别与IgG含量呈极显著正相关(P<0.01)。而miR-1246表达量极显著上调(P<0.01),与MDA含量呈极显著正相关(P<0.01)。综上表明,miR-1246、miR-181a、miR-486在机体热应激状态下参与了调控免疫应答及抗氧化等方面的作用,可作为肉牛抗热应激的分子标记。

环境因素对DNA甲基化的影响

在哺乳动物中,DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶(DNA-methyl transferase,DNMT)的作用下,以S-腺苷甲硫氨酸提供甲基供体,将其甲基转移到脱氧胞嘧啶环第5位碳原子形成甲基化脱氧胞嘧啶的共价修饰。DNA甲基化改变组蛋白和DNA之间的相互作用,使染色质构象发生改变从而影响基因的表达,总体来说DNA甲基化水平与基因的表达呈负相关。越来越多的报道证实,环境因素可以影响表观遗传修饰,其并没有涉及遗传信息的改变,所以在一定范围内可以解释表型变化。文章围绕环境因素(温度、营养供给、异常化学因子、早期环境刺激和辐射等)对DNA甲基化产生的影响进行综述,这些影响包括亲代和子代DNA甲基化的改变及子代行为和表型变化等方面,以期进一步阐释环境因素与基因互作的关系。

脂肪甘油三酯脂肪酶(ATGL)的生物学功能及调控机制

脂肪甘油三酯脂肪酶(ATGL)是近年来研究发现的启动脂肪动员的又一关键脂肪酶.ATGL能特异性地水解甘油三酯(TAG)的第一酯键,被认为是TAG水解过程的限速酶.ATGL在脂肪组织和非脂肪组织脂代谢过程中都发挥着重要作用,其活性和表达在细胞内受到转录水平、翻译后水平等调控.ATGL介导的脂解过程可能与肥胖、糖尿病、脂肪肝等代谢疾病存在关联.本文主要就ATGL的结构特征、生物学功能及其调控机制进行综述,并对今后的研究方向和应用进行了展望.

山羊clock和cry1基因的克隆及其在大脑和垂体中表达差异的研究

本研究旨在探讨生物钟基因clock和cry1在山羊出生后不同时期的大脑和垂体中的表达差异。在出生后30、60、90和120d共屠宰24只南江黄羊羔羊(公母各12只),取其大脑皮质层和垂体组织样品用于抽提RNA,进行分子克隆和实时荧光定量PCR分析。结果,分离克隆得到了山羊clock基因外显子1到外显子8以及cry1基因外显子6到外显子15的CDS区序列,其长度分别为1 479bp和993bp,其中clock基因部分CDS区序列与绵羊、牛、人和小鼠的对应序列相似性分别为99%、90%、94%和92%,cry1基因部分CDS区序列与绵羊、牛、人和小鼠的对应序列相似性分别为99%、98%、94%和87%。组织表达分析结果表明,性别对clock和cry1基因的表达影响不显著(P>0.05),2个基因在垂体中的mRNA表达量极显著高于大脑中的表达量(P<0.01);在不同时期的垂体组织中,clock和cry1基因表达量均呈现先上升后下降的趋势;在不同时期的大脑组织中,clock基因的表达量趋于波动平衡,呈现上升趋势,cry1基因的相对表达量呈细微的上升趋势。结果提示:clock和cry1基因的CDS区在物种间保守性较高。clock和cry1基因在山羊大脑和垂体组织中起到重要的作用,且其mRNA发育性表达模式具有组织特异性。

地方蛋鸡新品系(HS)基础群产蛋率与累计产蛋数曲线拟合

【目的】探索地方蛋鸡产蛋率和产蛋量变化规律，提高地方蛋鸡的产蛋量和生产性能。【方法】以蛋鸡新品系（HS）基础群的Z0041周龄产蛋率和总产蛋数变化规律为研究对象。各采用3种模型对产蛋率（伍德模型、分室模型与杨宁模型）和总产蛋数（Logistic模型、Gompertz模型和Bertallanffy模型）进行拟合，并对产蛋率及累计产蛋数的拟合值与真实值进行比较。【结果】结果表明，杨宁模型、分室模型和伍德模型的产蛋曲线拟合度分别为R2=0．959、R4=0．923和R2=0．796；Logistic、Gompertz和Bertallanffy3种模型对累计产蛋数的拟合度（R2）都在0．99以上；综合实际与生产实际数据比较发现杨宁模型和Bertallanffy模型拟合效果最佳。【结论】在实际生产中可以利用杨宁模型和Bertallanffy模型对该品系产蛋率和累计产蛋数变化规律进行估计与预测，为地方蛋鸡新品系的育种及管理提供参考。

山羊CAST基因Ⅱ型转录本的克隆及在山羊不同组织中的表达

钙蛋白酶抑制蛋白（Calpastatin，CAST）基因是与畜禽肉质性状密切相关的重要候选基因。文章根据牛和绵羊CAST基因mRNA，应用RACE技术首次成功克隆了山羊CAST基因Ⅱ型转录本（以下简称CASTII基因）全长cDNA，对序列及编码的氨基酸进行了生物信息学分析。结果显示，该基因cDNA全长2474bp，完整的开放阅读框（ORF）为558～2252bp，编码564个氨基酸。氨基酸序列中存在4个保守结构域和1个保守七肽序列；蛋白质二级结构以无规卷曲和a-螺旋为主，富含疏水区，存在多个磷酸化位点以及蛋白激酶C（Protein kinaseC，PKC）的磷酸化位点。通过实时荧光定量RT—PCR技术分析了CASTⅡ基因在天府肉羊部分组织中的表达情况。结果表明：CASTII基因在所选择的天府肉羊7种组织中均有表达，半岁各组织中，眼肌的表达量最高，与腿肌差异显著（P〈0．05），极显著高于内脏各组织（P〈0．01）；在眼肌组织中，CASTⅡ基因的表达量随着年龄的增长而增加，3岁时的表达量最高。

猪皮下与内脏脂肪组织mRNA转录组的构建与差异分析

【目的】研究猪皮下脂肪和内脏脂肪的表型和代谢差异,找出差异转录本。【方法】选取长白母猪的皮下脂肪(背部皮下脂肪)和内脏脂肪(大网膜脂肪和肠系膜脂肪)进行表型测定及高通量转录组测序(RNA-Seq)。【结果】①背部皮下脂肪体积最大,大网膜次之,肠系膜的脂肪体积最小;与皮下脂肪相比,内脏脂肪中饱和脂肪酸含量更高(P<0.01)而不饱和脂肪酸的含量相对较低(P<0.05);②转录组测序共获得30 532 913～33 479 707个唯一比对到基因组的读段(reads),鉴定了22 015个转录本,覆盖猪已注解转录本的80.2%,同时还发现4 583～4 765个新的转录本、936～1 029个可变剪切、16 559个单核苷酸多态位点(SNPs)和1 481个插入/缺失位点(INDELs)。③皮下脂肪和内脏脂肪间差异表达的基因共有183个,基因注释(GO)和代谢通路(Pathway)分析发现它们在不饱和脂肪酸合成、羧酸代谢和炎症反应过程中有重要作用。【结论】提供了猪皮下脂肪和内脏脂肪的完善转录组信息,获得了影响脂肪酸代谢的潜在候选基因,为进一步揭示皮下脂肪和内脏脂肪的功能特征与差异提供了数据基础。