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孤独症谱系障碍合并先天性心脏病患儿1例的NSD1基因变异分析
1
作者
尹恒
邱忠清
+5 位作者
李童童
陈娅君
夏金蓉
黄格琳
许文明
谢江
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2023年第6期701-705,共5页
目的探讨1例孤独症谱系障碍(ASD)合并先天性心脏病(CHD)患儿的临床特征与遗传学病因。方法选取2021年4月13日于成都市第三人民医院就诊的1例ASD合并CHD患儿为研究对象。收集患儿临床资料,采集患儿及其父母外周静脉血样,应用全外显子组测...
目的探讨1例孤独症谱系障碍(ASD)合并先天性心脏病(CHD)患儿的临床特征与遗传学病因。方法选取2021年4月13日于成都市第三人民医院就诊的1例ASD合并CHD患儿为研究对象。收集患儿临床资料,采集患儿及其父母外周静脉血样,应用全外显子组测序(WES)对患儿进行基因检测,使用GTX遗传分析系统对WES数据进行分析,筛选出ASD候选致病基因。进一步采用Sanger测序进行家系验证,并对候选变异进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术,检测本研究患儿与3例正常同龄儿童和5例其他ASD患儿NSD1基因mRNA相对表达量的差异。结果患儿为男性,8岁,主要临床表现为ASD、智力低下及CHD。WES数据经GTX遗传分析系统分析,NSD1被筛选为该本研究患儿ASD候选致病基因,其NSD1基因存在c.3385+2T>C杂合变异,Sanger测序结果显示,患儿父母均未携带该变异,提示该变异为新发变异。生物信息学分析:NSD1基因c.3385+2T>C变异在ESP、1000 Genomes及ExAC等数据库中均未见收载;采取Mutation Taster在线软件对该变异有害性分析结果显示,提示为可能有害变异;根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南,该变异被评级为致病性变异。qPCR检测结果显示,与3例正常同龄儿童相比,本研究患儿和其他5例确诊ASD患儿的NSD1基因mRNA相对表达量均显著降低,并且差异有统计学意义(P<0.001)。结论NSD1基因c.3385+2T>C变异可导致其mRNA表达水平显著降低,与ASD具有一定关联,可能是本研究ASD患儿的遗传学病因,进一步拓展了NSD1基因变异谱。
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关键词
孤独症谱系障碍
NSD1基因
遗传变异
心脏病
先天性
智力障碍
儿童
原文传递
题名
孤独症谱系障碍合并先天性心脏病患儿1例的NSD1基因变异分析
1
作者
尹恒
邱忠清
李童童
陈娅君
夏金蓉
黄格琳
许文明
谢江
机构
西南交通
大学
医学院
成都市第三人民
医院
儿科
四川大学华西第二医院生殖遗传与表观遗传实验室
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2023年第6期701-705,共5页
基金
四川省科技厅项目(2021YJ0170)
成都市科技局项目(2019-YF05-00498-SN)。
文摘
目的探讨1例孤独症谱系障碍(ASD)合并先天性心脏病(CHD)患儿的临床特征与遗传学病因。方法选取2021年4月13日于成都市第三人民医院就诊的1例ASD合并CHD患儿为研究对象。收集患儿临床资料,采集患儿及其父母外周静脉血样,应用全外显子组测序(WES)对患儿进行基因检测,使用GTX遗传分析系统对WES数据进行分析,筛选出ASD候选致病基因。进一步采用Sanger测序进行家系验证,并对候选变异进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术,检测本研究患儿与3例正常同龄儿童和5例其他ASD患儿NSD1基因mRNA相对表达量的差异。结果患儿为男性,8岁,主要临床表现为ASD、智力低下及CHD。WES数据经GTX遗传分析系统分析,NSD1被筛选为该本研究患儿ASD候选致病基因,其NSD1基因存在c.3385+2T>C杂合变异,Sanger测序结果显示,患儿父母均未携带该变异,提示该变异为新发变异。生物信息学分析:NSD1基因c.3385+2T>C变异在ESP、1000 Genomes及ExAC等数据库中均未见收载;采取Mutation Taster在线软件对该变异有害性分析结果显示,提示为可能有害变异;根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南,该变异被评级为致病性变异。qPCR检测结果显示,与3例正常同龄儿童相比,本研究患儿和其他5例确诊ASD患儿的NSD1基因mRNA相对表达量均显著降低,并且差异有统计学意义(P<0.001)。结论NSD1基因c.3385+2T>C变异可导致其mRNA表达水平显著降低,与ASD具有一定关联,可能是本研究ASD患儿的遗传学病因,进一步拓展了NSD1基因变异谱。
关键词
孤独症谱系障碍
NSD1基因
遗传变异
心脏病
先天性
智力障碍
儿童
Keywords
Autism spectrum disorder
NSD1 gene
Genetic variant
Heart disease,congenital
Intellectual disability
Child
分类号
R54 [医药卫生—心血管疾病]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
孤独症谱系障碍合并先天性心脏病患儿1例的NSD1基因变异分析
尹恒
邱忠清
李童童
陈娅君
夏金蓉
黄格琳
许文明
谢江
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2023
0
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已选择
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参考文献
引证文献
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