西南地区HPV-6和HPV-11 E6/E7基因多态性分析

目的研究西南地区人乳头瘤病毒6型(HPV-6)和11型(HPV-11)E6/E7基因多态性,为低危型HPV的防治提供分子水平。方法对HPV-6和HPV-11阳性标本扩增其目的基因,测序并对比Genenbank参考序列,对变异初步分析;PAML 4.8软件作用于E6/E7基因的选择压力。结果 HPV-6E6/E7基因共12个突变位点,其中有3个是首次发现的突变位点,5/12为非同义突变;HPV-11E6/E7中,共计5个单核苷酸突变,具有2/5非同义和3/5同义突变。选择压力结果显示,只有HPV-6E7基因有3个正向选择位点,分别是4R**,34E**和52F**。结论 HPV-6E6和E7序列在分析的群组中高度保守,表示HPV-6在进化的过程中,形成了有利于生存的分离株。HPV-11突变未发现正向选择位点,表明选择的变异对HPV-11来说适应环境较困难。