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基于全基因组重测序的杏鲍菇菌株遗传多样性与性状分析
1
作者
林俊彬
严俊杰
+8 位作者
韩星
赵金
甘颖
苗人云
冯仁才
李斐
赖学飞
仝宗军
甘炳成
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第11期2311-2318,共8页
【目的】通过分析20份杏鲍菇菌株的遗传多样性和菌丝、子实体的性状,为新型分子标记在杏鲍菇资源保护利用方面提供一定的基础,也为后续主要性状基因的准确定位、杂交育种、表型预测提供理论依据。【方法】以20株全国不同地区收集到的杏...
【目的】通过分析20份杏鲍菇菌株的遗传多样性和菌丝、子实体的性状,为新型分子标记在杏鲍菇资源保护利用方面提供一定的基础,也为后续主要性状基因的准确定位、杂交育种、表型预测提供理论依据。【方法】以20株全国不同地区收集到的杏鲍菇菌株作为试验菌株,对其进行全基因组重测序,将分析得到的SNP位点作为标记进行遗传多样性分析,并测定其菌丝在PDA培养皿上的生长速度、产量、子实体长度、菌盖直径、菌柄长度、菌柄直径、子实体硬度、子实体脆度、子实体咀嚼性和子实体胶着性,随后对10项性状指标进行主成分分析,将各项性状指标与遗传多样性结果进行联合分析,评价二者的相关性。【结果】当遗传距离大于0.08时,20份杏鲍菇菌株分为6个类群,每个类群的菌株的性状与其他类群相比均有一定的差异且类群内菌株性状比较接近。其中类群Ⅴ所含菌株数量最多,包含13份菌株,且各项性状指标最为突出;其次是类群Ⅱ包含3份菌株,其余几个类群都只包含1个菌株,不同类群之间性状均有差异,类群内差异很小。【结论】国内不同地区的杏鲍菇菌株在遗传多样性、菌丝生长速度、子实体性状和质构方面均有差异,其中各项性状比较优异且均衡的杏鲍菇菌株聚类在类群Ⅴ,说明杏鲍菇中SNP标记与子实体性状有很强的相关性。在育种实践中,可以通过SNP标记预测菌株的性状,以遗传距离比较远、个别性状比较突出的菌株作为亲本进行杂交育种,大大减少育种周期,提高育种效率与精度。
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关键词
杏鲍菇
遗传多样性
单核苷酸多态性
数量性状
主成分分析
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职称材料
响应面法优化黑皮鸡枞总黄酮提取工艺
被引量:
8
2
作者
张晨
赵金
+6 位作者
严俊杰
苗人云
林俊彬
李翔
周向荣
张攀
甘炳成
《中国调味品》
CAS
北大核心
2022年第11期138-143,共6页
以黑皮鸡枞为研究对象,考察了乙醇浓度、液料比、超声时间和温度4个因素,利用响应面法优化超声波辅助乙醇提取黑皮鸡枞中总黄酮,并通过NaNO-Al(OH)-NaOH法测定其吸光度,计算黑皮鸡枞总黄酮提取率。结果显示:乙醇浓度82%、液料比42∶1 (m...
以黑皮鸡枞为研究对象,考察了乙醇浓度、液料比、超声时间和温度4个因素,利用响应面法优化超声波辅助乙醇提取黑皮鸡枞中总黄酮,并通过NaNO-Al(OH)-NaOH法测定其吸光度,计算黑皮鸡枞总黄酮提取率。结果显示:乙醇浓度82%、液料比42∶1 (mL/g)、超声时间117 min、超声温度70℃为最佳提取工艺。该条件下,黑皮鸡枞总黄酮理论提取率为4.91767 mg/g,实际平均提取率为4.89 mg/g,响应估计值与实际值相对误差为0.57%,误差较小。提取工艺操作简单,提取率稳定,为黑皮鸡枞有效成分的高效提取利用与产品研发奠定了基础。
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关键词
黑皮鸡枞
总黄酮
超声波
响应面法
优化
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职称材料
题名
基于全基因组重测序的杏鲍菇菌株遗传多样性与性状分析
1
作者
林俊彬
严俊杰
韩星
赵金
甘颖
苗人云
冯仁才
李斐
赖学飞
仝宗军
甘炳成
机构
中国农业科学院都市农业研究所
成都农业
科技
中心
金堂县现代农业装备产业园管理委员会
四川田岭涧生物科技发展有限公司
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第11期2311-2318,共8页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(Y2021XK03)
四川省科技计划项目(2021YFYZ0026)
+2 种基金
中国农业科学院科技创新工程项目(34⁃IUA⁃06)
凉山州科技计划项目(21ZDYF0023)
国家成都农业科技中心地方财政专项(NASC2021KR06)。
文摘
【目的】通过分析20份杏鲍菇菌株的遗传多样性和菌丝、子实体的性状,为新型分子标记在杏鲍菇资源保护利用方面提供一定的基础,也为后续主要性状基因的准确定位、杂交育种、表型预测提供理论依据。【方法】以20株全国不同地区收集到的杏鲍菇菌株作为试验菌株,对其进行全基因组重测序,将分析得到的SNP位点作为标记进行遗传多样性分析,并测定其菌丝在PDA培养皿上的生长速度、产量、子实体长度、菌盖直径、菌柄长度、菌柄直径、子实体硬度、子实体脆度、子实体咀嚼性和子实体胶着性,随后对10项性状指标进行主成分分析,将各项性状指标与遗传多样性结果进行联合分析,评价二者的相关性。【结果】当遗传距离大于0.08时,20份杏鲍菇菌株分为6个类群,每个类群的菌株的性状与其他类群相比均有一定的差异且类群内菌株性状比较接近。其中类群Ⅴ所含菌株数量最多,包含13份菌株,且各项性状指标最为突出;其次是类群Ⅱ包含3份菌株,其余几个类群都只包含1个菌株,不同类群之间性状均有差异,类群内差异很小。【结论】国内不同地区的杏鲍菇菌株在遗传多样性、菌丝生长速度、子实体性状和质构方面均有差异,其中各项性状比较优异且均衡的杏鲍菇菌株聚类在类群Ⅴ,说明杏鲍菇中SNP标记与子实体性状有很强的相关性。在育种实践中,可以通过SNP标记预测菌株的性状,以遗传距离比较远、个别性状比较突出的菌株作为亲本进行杂交育种,大大减少育种周期,提高育种效率与精度。
关键词
杏鲍菇
遗传多样性
单核苷酸多态性
数量性状
主成分分析
Keywords
Pleurotus eryngii
Genetic diversity
Single nucleotide polymorphism
Quantitative characteristics
Principal component analysis
分类号
S646 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
响应面法优化黑皮鸡枞总黄酮提取工艺
被引量:
8
2
作者
张晨
赵金
严俊杰
苗人云
林俊彬
李翔
周向荣
张攀
甘炳成
机构
中国农业科学院都市农业研究所
成都大学食品与
生物
工程学院
成都农业
科技
中心
金堂县现代农业装备产业园管理委员会
四川田岭涧生物科技发展有限公司
出处
《中国调味品》
CAS
北大核心
2022年第11期138-143,共6页
基金
中国农业科学院科技创新工程项目(34-IUA-06)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(S2021002)。
文摘
以黑皮鸡枞为研究对象,考察了乙醇浓度、液料比、超声时间和温度4个因素,利用响应面法优化超声波辅助乙醇提取黑皮鸡枞中总黄酮,并通过NaNO-Al(OH)-NaOH法测定其吸光度,计算黑皮鸡枞总黄酮提取率。结果显示:乙醇浓度82%、液料比42∶1 (mL/g)、超声时间117 min、超声温度70℃为最佳提取工艺。该条件下,黑皮鸡枞总黄酮理论提取率为4.91767 mg/g,实际平均提取率为4.89 mg/g,响应估计值与实际值相对误差为0.57%,误差较小。提取工艺操作简单,提取率稳定,为黑皮鸡枞有效成分的高效提取利用与产品研发奠定了基础。
关键词
黑皮鸡枞
总黄酮
超声波
响应面法
优化
Keywords
Oudemansiella raphanipes
total flavonoids
ultrasound wave
response surface methodology
optimization
分类号
TS201.1 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于全基因组重测序的杏鲍菇菌株遗传多样性与性状分析
林俊彬
严俊杰
韩星
赵金
甘颖
苗人云
冯仁才
李斐
赖学飞
仝宗军
甘炳成
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
响应面法优化黑皮鸡枞总黄酮提取工艺
张晨
赵金
严俊杰
苗人云
林俊彬
李翔
周向荣
张攀
甘炳成
《中国调味品》
CAS
北大核心
2022
8
下载PDF
职称材料
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