四川省什邡市健康儿童中埃柯病毒11型基因特征分析

目的分析四川省什邡市埃柯病毒E11型(echovirus 11,E11)的基因特征。方法对采集的健康儿童大便标本进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测、病毒分离和VP1区核苷酸全序列测序,根据进化树聚集确定E11基因型/基因亚型。结果69份标本中,EV核酸阳性32份,选取Ct值≤33的20份标本进行病毒分离,收获毒株14株,其中8株为E11。E11间VP1区核苷酸序列一致性≥99.4%,推导氨基酸序列一致性≥98.9%。进化树分析显示,什邡市E11与D5基因亚型参考株聚集在同一进化分支上。结论什邡市健康儿童中分离到的E11为D5基因亚型,与以前我国流行的基因型(A和C)不同。D5基因亚型E11可引起脑炎、脑膜炎和手足口病等疾病,需对其流行程度和持续时间开展监测。