基于计算流行病学的埃博拉出血热的传播与爆发仿真研究

目的本研究旨在模拟外来输入性埃博拉出血热（Ebolavirusdisease，EVD）病例出现后，不同的防控策略对该病在我国传播及爆发流行模式的影响，并为相关决策部门提供一种循证决策依据。方法选用传染病SIR动力学模型建模。模拟病毒输入区域为我国南方某特大型城市群，该城市群人口5000万，所有人均为易感者。出现输入性病例，模拟情况分别包含单个感染者入境I（0）=1，某小型旅行者团体（全为感染者）入境I（0）=5及I（0）=10。I（0）我们称为“零号感染者”，其发病过程呈现典型的埃博拉出血热发病过程。其传播能力用B表示。对于输入性埃博拉感染者进入我国后，从其发病到得到控制（启动紧急预案）的时间t＋设定了如下特征参数：t。=6，12，18，24，30h。传播模式设定如下：S0=5×108，IoЕ[1，20]；k（0．1）；qЕ（0．1]；t。E{6，12，18，24}h。结果零号感染者输入后，随着应急预案启动的时刻t,变化，病毒暴发曲线为指数型，指数方程为Y=1．053e1801，模型拟合度R2=1，RSME=0．1185。如在给定启动应急预案的时间点后（即在同一时间点启动应急预案），零号感染者的数量与被感染者人数上限之间的关系表现为线性增加，线性方程为Y：7．605x，模型拟合度R2=1。以最好模型估计，若零号感染者人数为1，输入后在6h内即被识别并启动应急预案进行处置，则感染人数为7人；若其被隔离时间延长为12，18，24及30h，则对应的感染人数分别为32、400、1400和8600。以最坏模型估计，若零号感染者人数为10，在6，12，18，24及30h后才被识别并启动应急预案进行处置，则在对应的新发感染人数分别为67、380、2400、1．4万和8．7万。结论埃博拉出血热在我国爆发流行的可能性较低，即使出现输入性病例，只要能严格执行国家卫计委的相关规定，该病的传播范围将极为有限。应该加大投入，加强对一线传染科、急诊科和发热门诊医护人员的培训，使之能及时识别该病并加以处置。

急性心肌梗死早期基因表达和代谢调控网络扰动的可视化研究

目的应用系统生物学方法，研发一种基于转录组表达谱的基因网络可视化工具，以直观显示急性心肌梗死后早期的转录组和代谢调控的整体变化。方法在美国国立卫生研究中心（NCBI）GEO数据库下载编号为GDS2331的一个急性心肌梗死后大鼠心脏左心室的基因芯片表达文件，其平台编号为GPL83。筛选实验时间在15min，60min，4h，12h，24和48h的假手术和急性心肌梗死模型亚组数据，利用Mathwork bioinformatics toolbox工具包将数据转化为计算机可读的结构体。利用模式识别算法剔除表达背景噪声；最后获得心肌梗死建模后表达模式扰动最明显的基因谱。利用K—mean算法对这些基因进行分类，并进行基因本体分析（gene ontology，GO）。进而将有关通路标定在京都基因和基因组百科数据库（kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG）中，形成基因组．表达谱系统分析。结果共有1400个基因被筛选出来。在损伤后的前48h，这些基因的变化模式可归为16类。根据可以获得基因本体分析发现：在生物学过程上，心肌梗死后早期调控发生改变主要和发育基因相关，其中主要包括蛋白激酶B信号传导途径，中枢神经系统发育途径，以及cytochalasin B调控相关途径。在分子功能上，这些功能主要和磷酸化，肌动蛋白的结合以及核酸的配对解离有关。在细胞成分上，主要与细胞内外膜相结构之间的联系、高尔基复合体、出胞作用、以及细胞骨架特别是dynactin complex等结构有关。KEGG作图标记可显示在分子调控传导路径当中，受到影响的基因很可能通过该传导通路的上下游分子进行调控。如以肌动蛋白为核心的细胞骨架信息传导途径的调控中，GF RTK Vav／tiam Rac mlCK Myosin整个调控途径中的分子都有相同的调控模式。结论利用系统生物学技术可以实现急性心肌梗死后基因表达波动模式的可视化描述。这些模式可以反映基因表达在不同时间点质和量上的表达差异。结合Gene ontology的基因语义功能学上的研究和基于KEGG的作图法是一种有力的联合分析工具，前者可以直观的展示扰动的基因在功能上的共同点，后者可以显示在特定细胞网络中哪些基因受到了影响。

高渗溶液不能降低创伤失血性休克的病死率：系统评价研究

目的系统地评价高渗盐溶液（hypertonic saline）复苏治疗对创伤性休克（traumatic shock，TS）患者临床预后的影响。方法检索2002年1月至2012年8月中英文7个生物医学数据库，建立随机对照试验（RCT）纳入排除标准进行鉴定。采用Cochrane评价员手册5．0．1及改良Jadad质量评分进行质量评定。用RevMan5．1软件进行Meta分析。结果检索到的221篇相关文献中，共5个随机对照研究符合全部纳入标准。Meta分析主要发现了早期复苏使用高渗溶液不能降低患者早期（人院后48h内）病死率（解=1．04，P=0．74）和远期（伤后7d至3个月）病死率（RR=0．97，P=072）；亦不能减少首日输液量和红细胞悬液输注量（P=0．38），不能降低院内感染事件（RR=1．04，P=0．70）、住ICU时间（P=0．20）和总住院时间。结论高渗溶液复苏与常规复苏措施相比，不能改善创伤失血性休克患者的病死率以及院内感染率，其对治疗首日输液总量和输血量无显著影响，且不能减少住院总时间和住ICU时间。需要更多大样本且方法学质量高的随机对照试验对高渗液体是否可改变创伤失血性休克患者住院时间及住院费用等进行研究。

采用核磁共振波谱技术筛选严重烧伤患者代谢紊乱的生物靶标

近年来，尽管采用了一些新的诊疗技术，但严重烧伤患者的存活率并未显著提升，如何降低严重烧伤患者病死率仍然是烧伤医学的核心问题之一。大面积烧伤导致机体代谢模式发生显著改变，这些改变与疾病的发生、发展及转归密切相关。

基于Meta回归算法评估烧伤临床营养系统评价的异质性

目的基于Meta回归算法对烧伤临床营养系统评价研究的异质性进行量化评估。方法检索《PubMed数据库》、荷兰《医学文摘》光盘数据库、《科学引文索引数据库》、《Cochrane中心随机对照试验（RCT）注册数据库》、《中国生物医学文献数据库》、《中文生物医学期刊数据库》和《中国期刊全文数据库》1980年以后的文献资料，鉴定烧伤临床营养系统评价研究。纳入标准包括：研究设计为干预性系统评价或Meta分析；烧伤患者年龄大于或等于18岁；采用临床营养类干预，制剂包括特殊营养素、途径包括肠内或肠外营养；结局指标为病死率。采用两步法分析系统评价的异质性，（1）定性分析：统计系统评价发表年份以及纳入临床研究外部设计、患者类型、营养素摄人（制剂或途径）、热量摄人、结局的报告情况；（2）定量分析：对系统评价纳入有结局报告的临床试验，建立其研究外部设计、发表时间、营养素摄入（制剂或途径）、热量摄入对病死率的Meta回归方程，采用广义线性回归模型以病死率作为回归结局变量得到各临床试验的预期死亡数，计算实际数／预期数（O／E）比及其95％置信区间鉴定系统评价中临床试验的异质性。结果（1）检索获得6项系统评价研究，时间跨度为10年，其中3项针对成人患者的系统评价报告了营养素摄人（制剂或途径）、热量摄人和结局3项特征指标中的2项。共纳人11项有患者结局报告的临床试验，包括10项RCT、l项病例对照试验。（2）Meta回归分析显示，与另外7项研究不同，4项RCT（5个研究组）存在显著异质性，不是来自于一个总体。对3项全面报告了营养素摄入（制剂或途径）、热量摄入及结局的RCT进行Meta回归分析，结果显示其无异质性。结论烧伤临床营养系统评价质量不高，所纳人的RCT有显著的异质性；基于Meta回归技术的O／E统计量能有效识别RCT异质性并有助于鉴定异质性来源。