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2019年四川大豆高效生产技术指导意见
1
作者
吴海英
梁建秋
+6 位作者
冯军
曾召琼
冯世友
杨文英
安建刚
于晓波
张明荣
《大豆科技》
2019年第3期41-42,共2页
2019年四川大豆高效绿色生产技术指导意见:因地制宜精选配套高产优质良种;抓住墒情,及时在高产播期播种;高效种植,轻简化播种;精准施肥,控旺防倒;防控病虫,确保大豆高产;及时机收晾晒,确保大豆质量。
关键词
四川
大豆
高效绿色
生产技术
下载PDF
职称材料
基于全基因组重测序的大豆分子标记开发及籽粒蛋白质含量QTL定位
被引量:
7
2
作者
王嘉
曾召琼
+3 位作者
梁建秋
于晓波
吴海英
张明荣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第16期2743-2757,共15页
【目的】基于全基因组重测序结果,开发与高蛋白、耐荫、抗倒伏等性状紧密相关的分子标记,同时利用开发的分子标记构建遗传连锁图谱,并对籽粒蛋白质含量进行QTL定位,为后续高蛋白、耐荫、抗倒育种研究提供参考和分子标记资源。【方法】...
【目的】基于全基因组重测序结果,开发与高蛋白、耐荫、抗倒伏等性状紧密相关的分子标记,同时利用开发的分子标记构建遗传连锁图谱,并对籽粒蛋白质含量进行QTL定位,为后续高蛋白、耐荫、抗倒育种研究提供参考和分子标记资源。【方法】以大面积栽培品种南豆12和地方品种十月黄为亲本,构建F2分离群体。对亲本材料进行覆盖度约为40×的全基因组重测序,用BWA、GATK及Breakdancer等软件比对,检测亲本材料在全基因组范围内的突变类型,挖掘相关变异基因。结合种子不同发育时期和荫蔽处理获得的转录组数据,结合qRT-PCR对发生突变的储藏蛋白、环境适应相关基因进行表达规律分析。同时,基于重测序数据,挖掘亲本间存在于基因编码区的SNP位点,对其进行酶切位点分析,将SNP标记转化为CAPS或dCAPS标记。此外,搜索亲本间存在的插入/缺失变异位点,在插入/缺失位点两侧高度保守的区域设计引物开发InDel标记。对开发的CAPS标记和InDel标记进行多态性筛选,选取具有多态性的CAPS分子标记和InDel标记,对F2材料进行基因分型。根据分型结果,利用JoinMap 4.0软件进行遗传连锁图谱的构建。依据构建的遗传图谱,结合近红外分析获得F2材料的籽粒蛋白质含量数据,使用Windows QTL Cartographer V2.5软件对大豆籽粒蛋白质含量进行QTL分析。【结果】测序结果显示,南豆12大量储藏蛋白、环境适应相关的重要基因或同源基因发生突变。转录组数据分析结果显示部分变异基因呈现不同的表达模式且差异显著,qRT-PCR分析进一步验证了该结果。此外,经检测开发的540个CAPS分子标记中有332个具有酶切多态性,300对InDel引物中有201对引物能扩增出多态性。基于533个多态性分子标记构建了一张包含20个连锁群的遗传连锁图谱,覆盖长度2 973.87 cM,标记间平均遗传距离5.58 cM。利用此图谱对大豆籽粒蛋白质含量进行QTL定位,共检测到QTL位点6个,可解释4.68%-18.25%的表型变异。【结论】基于亲本间的变异位点,共开发了533个多态性分子标记(包含8个基因特异性分子标记),检测到6个大豆籽粒蛋白质含量QTL位点,其中,主效QTL位点1个(qSPC-6)。
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关键词
大豆
全基因组重测序
套作
高蛋白
耐荫
抗倒伏
分子标记
下载PDF
职称材料
题名
2019年四川大豆高效生产技术指导意见
1
作者
吴海英
梁建秋
冯军
曾召琼
冯世友
杨文英
安建刚
于晓波
张明荣
机构
四川省南充市农业科学院大豆研究所/国家大豆产业技术体系南充综合试验站
出处
《大豆科技》
2019年第3期41-42,共2页
文摘
2019年四川大豆高效绿色生产技术指导意见:因地制宜精选配套高产优质良种;抓住墒情,及时在高产播期播种;高效种植,轻简化播种;精准施肥,控旺防倒;防控病虫,确保大豆高产;及时机收晾晒,确保大豆质量。
关键词
四川
大豆
高效绿色
生产技术
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于全基因组重测序的大豆分子标记开发及籽粒蛋白质含量QTL定位
被引量:
7
2
作者
王嘉
曾召琼
梁建秋
于晓波
吴海英
张明荣
机构
四川省南充市农业科学院大豆研究所/国家大豆产业技术体系南充综合试验站
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第16期2743-2757,共15页
基金
国家重点研发计划(2017YFD0101500)
文摘
【目的】基于全基因组重测序结果,开发与高蛋白、耐荫、抗倒伏等性状紧密相关的分子标记,同时利用开发的分子标记构建遗传连锁图谱,并对籽粒蛋白质含量进行QTL定位,为后续高蛋白、耐荫、抗倒育种研究提供参考和分子标记资源。【方法】以大面积栽培品种南豆12和地方品种十月黄为亲本,构建F2分离群体。对亲本材料进行覆盖度约为40×的全基因组重测序,用BWA、GATK及Breakdancer等软件比对,检测亲本材料在全基因组范围内的突变类型,挖掘相关变异基因。结合种子不同发育时期和荫蔽处理获得的转录组数据,结合qRT-PCR对发生突变的储藏蛋白、环境适应相关基因进行表达规律分析。同时,基于重测序数据,挖掘亲本间存在于基因编码区的SNP位点,对其进行酶切位点分析,将SNP标记转化为CAPS或dCAPS标记。此外,搜索亲本间存在的插入/缺失变异位点,在插入/缺失位点两侧高度保守的区域设计引物开发InDel标记。对开发的CAPS标记和InDel标记进行多态性筛选,选取具有多态性的CAPS分子标记和InDel标记,对F2材料进行基因分型。根据分型结果,利用JoinMap 4.0软件进行遗传连锁图谱的构建。依据构建的遗传图谱,结合近红外分析获得F2材料的籽粒蛋白质含量数据,使用Windows QTL Cartographer V2.5软件对大豆籽粒蛋白质含量进行QTL分析。【结果】测序结果显示,南豆12大量储藏蛋白、环境适应相关的重要基因或同源基因发生突变。转录组数据分析结果显示部分变异基因呈现不同的表达模式且差异显著,qRT-PCR分析进一步验证了该结果。此外,经检测开发的540个CAPS分子标记中有332个具有酶切多态性,300对InDel引物中有201对引物能扩增出多态性。基于533个多态性分子标记构建了一张包含20个连锁群的遗传连锁图谱,覆盖长度2 973.87 cM,标记间平均遗传距离5.58 cM。利用此图谱对大豆籽粒蛋白质含量进行QTL定位,共检测到QTL位点6个,可解释4.68%-18.25%的表型变异。【结论】基于亲本间的变异位点,共开发了533个多态性分子标记(包含8个基因特异性分子标记),检测到6个大豆籽粒蛋白质含量QTL位点,其中,主效QTL位点1个(qSPC-6)。
关键词
大豆
全基因组重测序
套作
高蛋白
耐荫
抗倒伏
分子标记
Keywords
soybean
whole genome re-sequencing
relay intercropping
high protein
shade tolerant
lodging resistance
molecular marker
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2019年四川大豆高效生产技术指导意见
吴海英
梁建秋
冯军
曾召琼
冯世友
杨文英
安建刚
于晓波
张明荣
《大豆科技》
2019
0
下载PDF
职称材料
2
基于全基因组重测序的大豆分子标记开发及籽粒蛋白质含量QTL定位
王嘉
曾召琼
梁建秋
于晓波
吴海英
张明荣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
7
下载PDF
职称材料
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