3种方法对1株临床疑难菌的鉴定及结果比较

目的通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、16S rRNA序列分析和全基因组测序(WGS)对从临床标本中分离的1株疑似盐单胞菌进行菌种鉴定,比较3种方法的鉴定结果。方法采用MALDI-TOF MS对待测菌进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现菌种鉴定;对菌株进行16S rRNA基因测序,将测序结果与数据库比对;待测菌WGS后进行序列比对分析,具体包括使用ANIm和ANIb 2种方法计算平均核苷酸一致性(ANI)以及与基因组分类数据库(GTDB)进行比对;基于全基因组序列中的16S rRNA序列和看家基因序列构建系统进化树,以及基于COG和KEGG功能对基因组进行聚类分析。结果MALDI-TOF MS对待测菌株的鉴定结果是Halomonas hamiltonii;经16S rRNA序列分析,发现待测菌株与3种盐单胞菌(Halomonas hamiltonii、Halomonas stevensii和Halomonas johnsoniae)的相似度均>99%,且相似度差异非常小,因此无法进行准确的菌种鉴定;基于WGS的基因序列比对、系统发育树、聚类分析均显示待测菌与Halomonas stevensii的亲缘关系更为接近。结论3种方法对分离的1株疑难菌的菌种鉴定结果有差异,MALDI-TOF MS的菌种鉴定操作更加方便、快速,非常适用于临床检验工作;基于WGS的细菌鉴定更适合用于遗传特征相似的菌种之间的鉴别。

眩晕患者同型半胱氨酸及叶酸变化及其与疾病严重程度关系研究

目的研究眩晕患者同型半胱氨酸(Hcy)及叶酸水平变化与疾病严重程度的关系。方法将2017年3月至2018年9月该院收治的主诉眩晕患者238例纳入研究作为眩晕组,并选择同期于本院正常体检者129例作为对照组。统计眩晕患者DHI量表评分,比较两组受试者Hcy和叶酸水平的差异,分析其与眩晕严重程度的关系。结果研究中纳入前庭性偏头痛患者69例(28.99%)、持续性姿势-知觉性眩晕患者54例(22.69%)、良性阵发性位置性眩晕患者58例(24.37%)、后循环缺血患者57例(23.95%)。眩晕组患者Hcy水平显著高于对照组,且高于正常阈值,而叶酸水平则显著低于对照组,且低于正常阈值(均P<0.05);不同严重程度眩晕患者Hcy和叶酸水平均具有较大差异(均P<0.05);Pearson分析显示,Hcy水平(r=0.57,P<0.05)与眩晕严重程度呈正相关,而叶酸水平(r=-0.66,P<0.05)与眩晕严重程度呈负相关。结论眩晕患者Hcy水平将显著升高,而叶酸水平将明显降低,且Hcy水平与眩晕严重程度呈正相关,而叶酸水平与眩晕严重程度呈负相关。

侵袭性金黄色葡萄球菌感染患儿的感染株与定植株的分子病原学特征比较

目的研究侵袭性金黄色葡萄球菌(SA)感染患儿的感染部位分离株与其鼻腔定植株的分子生物学特征,并对两类不同来源菌株的一致性进行分析。方法2019年1月至8月四川省妇幼保健院儿科病房收治的社区侵袭性SA感染患儿的无菌部位收集到45株SA侵袭株,并从患儿鼻前庭筛查出28株定植株。采用肉汤稀释法对菌株进行药敏试验测定;采用PCR法检测菌株中耐药基因mecA、blaZ及毒力基因杀白细胞素(pvl)的携带情况;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术检测感染株和定植株的同源性。结果62.2%(28/45例)的感染患儿鼻前庭存在SA定植。侵袭株40.0%(18/45株)是耐甲氧西林SA(MRSA)菌株,定植株32.1%(9/28株)为MRSA菌株,二者相比差异无统计学意义(P>0.05)。感染株对克林霉素、阿奇霉素、红霉素的抵抗力强于定植株,耐药率差异均有统计学意义(χ^2=7.114、7.820、5.359,均P<0.05)。感染株和定植株的耐药基因balZ和毒力基因pvl的携带率差异均无统计学意义(均P>0.05)。表型上显示,与MRSA感染相比,甲氧西林敏感SA(MSSA)感染更容易发生鼻腔一致性定植[16.7%(3/18例)比48.1%(13/27例),χ^2=4.671,P<0.05]。PFGE分型技术检测结果显示,感染MSSA菌株的患儿与感染MRSA菌株者相比,前者更易存在同源性的SA定植[59.3%(16/27株)比27.8%(5/18株),χ^2=4.301,P<0.05]。结论侵袭性SA感染患儿的感染株与定植株对某些抗生素的耐药情况存在差异,但其常见耐药和毒力基因的携带情况无差异性。MSSA菌株感染患儿较MRSA菌株感染患儿的鼻腔内更有可能出现一致性定植菌。在侵袭性SA感染患儿中筛查SA的定植状态可能有潜在的临床意义。