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中国六省份水痘-带状疱疹病毒糖蛋白M、L基因特征分析
被引量:
9
1
作者
牟君杰
齐梦缘
+7 位作者
李崇山
郑焕英
陈萌
周剑慧
何吉兰
许文波
许松涛
许晓光
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期419-423,共5页
目的 分析水痘-带状疱疹病毒(VZV)糖蛋白(g)M、L的基因特征。方法 依据国家科技重大专项中发热伴出疹症候群病毒性病原监测项目,以2007—2015年北京(1例)、上海(5例)、吉林(2例)、青海(1例)、广东(2例)、四川(1例)监...
目的 分析水痘-带状疱疹病毒(VZV)糖蛋白(g)M、L的基因特征。方法 依据国家科技重大专项中发热伴出疹症候群病毒性病原监测项目,以2007—2015年北京(1例)、上海(5例)、吉林(2例)、青海(1例)、广东(2例)、四川(1例)监测到的12例VZV疑似患者为研究对象,收集其疱疹液或咽拭子标本共12份。通过琼脂糖凝胶电泳鉴定标本VZV阳性情况,采用PCR扩增VZV阳性标本以及国产水痘减毒活疫苗v-Oka-BK和进口水痘减毒活疫苗Varilrix-1的gM、gL基因序列片段,进行核苷酸序列测定和分析。采用BioEdit、MEGA 5.0软件,比对VZV阳性标本与疫苗株(v-Oka-BK、varilrix-1)以及GenBank的国外野毒株(41株)、亲本株(p-Oka)、疫苗株(v-Oka、varilrix、varivax)的核苷酸序列。结果 12份标本均为VZV阳性。与疫苗株和亲本株相比,1份阳性标本gM基因在86686位点发生碱基突变,并导致氨基酸突变,5份阳性标本在87844位点发生碱基突变,有30株国外野毒株在87844位点上也存在相同变异;1份阳性标本gL基因在101245位点发生碱基突变,并导致氨基酸突变,6份阳性标本在101624、101625、101625位点上均发生了碱基缺失,国外野毒株在这3个位点均发生相同变异。与疫苗株相比,12份VZV阳性标本gM的核苷酸、氨基酸同源性分别为99.2%~100%和98.2%~100%,gL的分别为99.3%~100%和98.6%~100%;与41株国外野毒株相比,gM的核苷酸、氨基酸同源性分别为99.3%~100%和98.5%~100%,gL的分别为99.1%~100%和98.6%~100%。基因亲缘性关系树分析显示,基于gM有7份VZV阳性标本与疫苗株及亲本株在同一分支上;基于gL,有12份VZV阳性标本均与疫苗株及亲本株在同一分支。结论 12份VZV阳性标本gM、gL基因序列高度保守,抗原性稳定,存在减毒位点可能。
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关键词
糖蛋白类
水痘疫苗
基因特征
水痘.带状疱疹病毒
原文传递
题名
中国六省份水痘-带状疱疹病毒糖蛋白M、L基因特征分析
被引量:
9
1
作者
牟君杰
齐梦缘
李崇山
郑焕英
陈萌
周剑慧
何吉兰
许文波
许松涛
许晓光
机构
大连医科大学中西医结合研究院
上海市
疾病预防控制中心
卫生检验所
广东省
疾病预防控制中心
卫生检验所
北京市
疾病预防控制中心
免疫所
吉林省
疾病预防控制中心
免疫所
四川省疾病预防控制中心微检所
中国
疾病预防控制中心
病毒病
预防
控制
所
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期419-423,共5页
基金
国家重点研发计划(2016YFC1200905)
国家自然科学基金(81302477)
文摘
目的 分析水痘-带状疱疹病毒(VZV)糖蛋白(g)M、L的基因特征。方法 依据国家科技重大专项中发热伴出疹症候群病毒性病原监测项目,以2007—2015年北京(1例)、上海(5例)、吉林(2例)、青海(1例)、广东(2例)、四川(1例)监测到的12例VZV疑似患者为研究对象,收集其疱疹液或咽拭子标本共12份。通过琼脂糖凝胶电泳鉴定标本VZV阳性情况,采用PCR扩增VZV阳性标本以及国产水痘减毒活疫苗v-Oka-BK和进口水痘减毒活疫苗Varilrix-1的gM、gL基因序列片段,进行核苷酸序列测定和分析。采用BioEdit、MEGA 5.0软件,比对VZV阳性标本与疫苗株(v-Oka-BK、varilrix-1)以及GenBank的国外野毒株(41株)、亲本株(p-Oka)、疫苗株(v-Oka、varilrix、varivax)的核苷酸序列。结果 12份标本均为VZV阳性。与疫苗株和亲本株相比,1份阳性标本gM基因在86686位点发生碱基突变,并导致氨基酸突变,5份阳性标本在87844位点发生碱基突变,有30株国外野毒株在87844位点上也存在相同变异;1份阳性标本gL基因在101245位点发生碱基突变,并导致氨基酸突变,6份阳性标本在101624、101625、101625位点上均发生了碱基缺失,国外野毒株在这3个位点均发生相同变异。与疫苗株相比,12份VZV阳性标本gM的核苷酸、氨基酸同源性分别为99.2%~100%和98.2%~100%,gL的分别为99.3%~100%和98.6%~100%;与41株国外野毒株相比,gM的核苷酸、氨基酸同源性分别为99.3%~100%和98.5%~100%,gL的分别为99.1%~100%和98.6%~100%。基因亲缘性关系树分析显示,基于gM有7份VZV阳性标本与疫苗株及亲本株在同一分支上;基于gL,有12份VZV阳性标本均与疫苗株及亲本株在同一分支。结论 12份VZV阳性标本gM、gL基因序列高度保守,抗原性稳定,存在减毒位点可能。
关键词
糖蛋白类
水痘疫苗
基因特征
水痘.带状疱疹病毒
Keywords
Glycoprotein
Vaccine
Genetic characterization
Varicella zoster virus
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国六省份水痘-带状疱疹病毒糖蛋白M、L基因特征分析
牟君杰
齐梦缘
李崇山
郑焕英
陈萌
周剑慧
何吉兰
许文波
许松涛
许晓光
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
9
原文传递
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引证文献
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