-
题名四川省Nam Dinh病毒的首次分离鉴定
被引量:1
- 1
-
-
作者
李伟
张佳珂
林世华
周兴余
冯玉亮
-
机构
四川省疾病预防控制中心微生物检验所虫媒病毒室
-
出处
《中国病毒病杂志》
CAS
2022年第2期108-113,共6页
-
基金
国家“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项(2017ZX10103010)。
-
文摘
目的对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离,利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus,NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)鉴定,同时扩增分离株的开放阅读框、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRp)、解旋酶超家族1(superfamily 1 helicase,HEL1)、刺突蛋白(spike protein,S蛋白)基因序列并测序,然后利用Mega Align软件对核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行比对分析,利用Mega 7软件绘制系统进化树。结果SC1502、SC1510病毒株能够引起C6/36细胞发生病变,但不能引起BHK-21细胞的病变。同源性分析结果显示,2株四川新分离株与NDiV的RdRp、HEL1、S蛋白的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别超过99.4%和97.5%。系统进化分析结果表明,2株四川新分离株与NDiV亲缘关系最近,处于同一进化分支。结论SC1502与SC1510为NDiV,该研究结果丰富了四川省的虫媒病毒病原谱数据库,对相关地区的不明原因疫情分析和调查提供了参考依据。
-
关键词
Nam
Dinh病毒
RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)
HEL1基因
S基因
系统进化树
-
Keywords
Nam Dinh virus
RNA-dependent RNA polymerase(RdRp)
HEL1 gene
S gene
Phylogenetic tree
-
分类号
R373
[医药卫生—病原生物学]
-