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中药络石藤及其习用品的DNA条形码鉴定
被引量:
6
1
作者
宫璐
黄志海
+4 位作者
张靖
白俊其
苏贺
张晓柠
徐文
《世界科学技术-中医药现代化》
2016年第8期1413-1418,共6页
目的:本研究应用ITS2序列鉴定区分络石藤及其习用品广东络石藤、地瓜藤、薜荔藤和扶芳藤。方法:提取以上5种中药基原植物基因组DNA,扩增不同样品的ITS2序列。采用隐马尔科夫模型HMMer进行序列注释,Clustal W法进行序列比对,K2P模型计算...
目的:本研究应用ITS2序列鉴定区分络石藤及其习用品广东络石藤、地瓜藤、薜荔藤和扶芳藤。方法:提取以上5种中药基原植物基因组DNA,扩增不同样品的ITS2序列。采用隐马尔科夫模型HMMer进行序列注释,Clustal W法进行序列比对,K2P模型计算种内和种间遗传距离分析,邻接法和最大似然法构建进化树。结果:5个物种的ITS2序列长度各不相同,在220-243 bp之间。遗传距离分析显示,5个物种的最大种内遗传距离为0.038,最小种间遗传距离为0.113,最大种内遗传距离大于最小种间遗传距离。同时5个物种可以在进化树上区分开来。结论:ITS2序列可以用于中药络石藤及其习用品的分子鉴定,为准确区分该类药材提供新的技术手段。
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关键词
络石藤
鉴定
ITS2
条形码
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职称材料
应用ITS2条形码鉴定岭南药材余甘子及其混淆中药品种
被引量:
2
2
作者
黄辉庆
黄志海
+3 位作者
黄娟
张靖
张晓柠
丘小惠
《世界科学技术-中医药现代化》
2016年第8期1419-1423,共5页
目的:本研究应用ITS2序列作为DNA条形码,建立余甘子及其混淆品分子鉴定方法。方法:收集8种共17份余甘子及其混淆品植物样本,提取基因组DNA,扩增ITS2基因并双向测序。所得序列采用Codon Code Aligner进行拼接,同时,从Gen Bank数据库中获...
目的:本研究应用ITS2序列作为DNA条形码,建立余甘子及其混淆品分子鉴定方法。方法:收集8种共17份余甘子及其混淆品植物样本,提取基因组DNA,扩增ITS2基因并双向测序。所得序列采用Codon Code Aligner进行拼接,同时,从Gen Bank数据库中获3条相关ITS2序列用于比较分析。利用MEGA 6.06软件分析其种内及种间遗传距离,并构建系统进化树。结果:余甘子ITS2序列长度为208 bp,与其他各物种种间变异位点较多,遗传距离较大,为0.174-0.823。聚类树结果显示,余甘子基原植物独聚一支,与其他混淆品能够容易区分。结论:本研究采用ITS2序列能够有效鉴别余甘子及其混淆品基原植物,可为保证临床用药真实安全提供技术支撑。
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关键词
余甘子
ITS2序列
分子鉴定
DNA条形码
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职称材料
题名
中药络石藤及其习用品的DNA条形码鉴定
被引量:
6
1
作者
宫璐
黄志海
张靖
白俊其
苏贺
张晓柠
徐文
机构
广州中医药大
学
第二临床医
学
院
国家人类基因组北方研究中心/北京诺赛基因组研究中心有限公司/基因组学研究北京市重点实验室
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
2016年第8期1413-1418,共6页
基金
国家自然基金委青年科学基金项目(81402887)基于组合质谱技术与代谢组学方法的中药何首乌体内物质作用组群与肝毒性研究
负责人:徐文
+3 种基金
广东省科技厅社会发展领域科技计划(2013B021800236)基于代谢组学的附子毒性研究
负责人:徐文
广东省中医院院内专项(2015KT1817):岭南中草药DNA条形码分子鉴定和生态适宜性研究
负责人:黄志海
文摘
目的:本研究应用ITS2序列鉴定区分络石藤及其习用品广东络石藤、地瓜藤、薜荔藤和扶芳藤。方法:提取以上5种中药基原植物基因组DNA,扩增不同样品的ITS2序列。采用隐马尔科夫模型HMMer进行序列注释,Clustal W法进行序列比对,K2P模型计算种内和种间遗传距离分析,邻接法和最大似然法构建进化树。结果:5个物种的ITS2序列长度各不相同,在220-243 bp之间。遗传距离分析显示,5个物种的最大种内遗传距离为0.038,最小种间遗传距离为0.113,最大种内遗传距离大于最小种间遗传距离。同时5个物种可以在进化树上区分开来。结论:ITS2序列可以用于中药络石藤及其习用品的分子鉴定,为准确区分该类药材提供新的技术手段。
关键词
络石藤
鉴定
ITS2
条形码
Keywords
Trachelospermumjasminoides, identification, internal transcribed spacer 2, DNA barcoding
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
应用ITS2条形码鉴定岭南药材余甘子及其混淆中药品种
被引量:
2
2
作者
黄辉庆
黄志海
黄娟
张靖
张晓柠
丘小惠
机构
广州中医药大
学
第二临床医
学
院
国家人类基因组北方研究中心/北京诺赛基因组研究中心有限公司/基因组学研究北京市重点实验室
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
2016年第8期1419-1423,共5页
基金
广东省中医院院内专项(2015KT1817):岭南中草药DNA条形码分子鉴定和生态适宜性研究
负责人:黄志海
文摘
目的:本研究应用ITS2序列作为DNA条形码,建立余甘子及其混淆品分子鉴定方法。方法:收集8种共17份余甘子及其混淆品植物样本,提取基因组DNA,扩增ITS2基因并双向测序。所得序列采用Codon Code Aligner进行拼接,同时,从Gen Bank数据库中获3条相关ITS2序列用于比较分析。利用MEGA 6.06软件分析其种内及种间遗传距离,并构建系统进化树。结果:余甘子ITS2序列长度为208 bp,与其他各物种种间变异位点较多,遗传距离较大,为0.174-0.823。聚类树结果显示,余甘子基原植物独聚一支,与其他混淆品能够容易区分。结论:本研究采用ITS2序列能够有效鉴别余甘子及其混淆品基原植物,可为保证临床用药真实安全提供技术支撑。
关键词
余甘子
ITS2序列
分子鉴定
DNA条形码
Keywords
Phyllanthus emblica, ITS2, molecular identification, adulterants, DNA barcode
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中药络石藤及其习用品的DNA条形码鉴定
宫璐
黄志海
张靖
白俊其
苏贺
张晓柠
徐文
《世界科学技术-中医药现代化》
2016
6
下载PDF
职称材料
2
应用ITS2条形码鉴定岭南药材余甘子及其混淆中药品种
黄辉庆
黄志海
黄娟
张靖
张晓柠
丘小惠
《世界科学技术-中医药现代化》
2016
2
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职称材料
已选择
0
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引证文献
统计分析
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