LIPC基因突变和冠状动脉粥样硬化性心脏病易感性的关联研究

目的确定肝脂酶(hepaticlipase,HL)LIPC基因9种突变在中国人群中的频率,并探讨这些突变与脂代谢和冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病,CAD)易感性的关系。方法对224例CAD患者和129例正常人LIPC基因相应位点进行通用TaqMan探针技术的实时荧光PCR方法,检测LIPC基因单核苷酸多态性(SNP)。用HWE软件、STA或SPSS软件分别进行遗传平衡检验和多变量等统计学分析。结果在正常对照组和CAD患者组中LIPC的9个高频SNPs位点均检出突变基因。RS2242064位点突变基因型为A/A、A/C、C/C,其频率在CAD患者组和对照组中分布有显著差异(P=0.019);RS2242064位点突变的等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;在平衡了其他混杂因素的情况下A/C基因型是冠心病的一项独立的危险因素,且非常显著(OR=1.95,P=0.021)。在CAD组中AC突变杂合子与A/A+C/C的患者相比,apo(A)显著降低(P=0.045),HDL显著降低(P=0.02)。结论在中国人群中LIPC的9个高频SNPs位点突变均在入选对象中检出,LIPC基因RS2242064位点突变为A/C基因型可能是中国人的易感因子之一。

鼻咽癌中KLF6基因突变的检测

背景与目的:鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)高发于中国南方和东南亚地区,其发病是一个多因素、多步骤的过程,与遗传因素、EB病毒感染和环境因子有关,但分子机理仍不清楚。KLF6基因编码一种广泛表达的核转录因子,在某些前列腺癌肿瘤中发现有高频的等位基因的丢失和基因突变。本研究通过对KLF6基因在NPC肿瘤中的突变检测,探讨KLF6基因与NPC发病的关系。方法:采用PCR-直接测序分析方法,在19例散发性NPC组织细胞和3个NPC细胞系(CNE1,CNE2,SUNE1)中对KLF6编码区和拼接位点进行检测。结果:在3例散发性NPC肿瘤组织DNA中检测到KLF6基因的3个不同位置的错义改变,分别为GAG→GTG(Glu75Val)、AGC→AGG(Ser136Arg)和AGA→AAA(Arg243Lys),在50个随机正常个体(100条染色体)和3个NPC细胞系中没有发现这3个位点的碱基变异。结论:这3个变异可能是KLF6基因的新的突变位点,在某些NPC发病中可能有作用。

TSHR基因多态性与不同临床亚型的Graves'病治疗预后的关系

目的探讨山东潍坊地区汉族人群中染色体14q31区域的rs179247单核苷酸多态性(SNP)位点的等位基因及基因型频率分布情况及与不同临床亚型Graves'病(GD)治疗预后的关系。方法采用病例-对照研究方法,应用Taq Man探针技术在ABI Quant Studio^(TM)5荧光定量PCR仪上对1 961例不同临床亚型GD患者和553名健康对照者的SNP位点进行等位基因分型与检测,并进行统计学分析。结果染色体14q31区域的rs179247-A SNP与GD的遗传易感性相关(P_(Allelic)<0.001,OR=1.64,95%CI:1.42~1.89),遗传模型分析显示rs179247的显性模型相关性分析结果较显著(P_(Dominant)<0.001)。rs179247与不同临床亚型GD治疗预后未见明显相关(P_(Genotypic)=0.553)。结论 TSHR基因内含子1区域的SNP位点rs179247与山东潍坊汉族人群GD明显相关,rs179247-A是一独立致病位点,但其与不同临床亚型GD治疗预后不存在相关关系。

在鼻咽癌中hCDC4基因编码区不存在突变

目的：hCdc4蛋白可以通过泛素介导的蛋白降解途径来调节细胞周期素E的水平。在一些人类肿瘤细胞系中，发现hCdc4突变。方法：采用PCR-测序方法在3个鼻咽癌(NPC)细胞系和21例NPC活检组织中对hCDC4基因的编码区进行了检测。结果：没有发现hCDC4基因突变。结论：说明hCDC4基因可能与NPC发病无关。

特发性矮小患儿生长激素受体基因外显子10单核苷酸多态性研究

目的研究特发性矮小(ISS)患儿生长激素受体(GHR)基因外显子10的单核苷酸多态性(SNPs),探讨GHR基因外显子10 SNPs与ISS的相关性。方法 2008年9月-2009年7月在苏州大学附属儿童医院就诊的ISS患儿30例为ISS组,健康体检的儿童30例为健康对照组。抽取空腹静脉血2 mL,提取基因组DNA,应用PCR扩增GHR基因外显子10的序列,PCR产物经纯化后进行DNA测序,将测得序列与美国国立生物技术信息中心公布的基因序列对比,采用SAS8.0统计软件对ISS组与健康对照组基因型频率及等位基因频率进行χ2检验。结果 GHR基因外显子10有2个SNP位点,分别为685位点和790位点。第685位碱基A→C杂合突变,造成第526号氨基酸由组氨酸转变为脯氨酸,即I526L。该位点上存在3种基因型(AA、CA、CC),其基因型频率及等位基因频率在2组间比较差异均无统计学意义(Pa>0.05)。第790位碱基C→A杂合突变,造成第561号氨基酸由丙氨酸转变为天冬氨酸,即P561T。该位点存在2种基因型(CC、CA),其基因型频率及等位基因频率在2组间比较差异均无统计学意义(Pa>0.05)。结论 GHR基因外显子10的685位点和790位点SNPs均与ISS的发病无关。

一个鼻咽癌家系中存在COX7B2基因的低频变异

在中国南方鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)高发地区,遗传易感性在鼻咽癌发病中起重要作用,在4p11-4p14区域存在一个鼻咽癌易感位点.采用PCR-直接测序法对位于该区域内的细胞色素C氧化酶亚单位Ⅶb2(COX7B2)基因进行单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)筛查,对发现的变异在家系患者、散发病例和正常人群中进行分型分析,探讨COX7B2基因变异是否与鼻咽癌有关.在COX7B2基因中共发现5个新的SNP位点,分别位于上游启动子区(-158101G>T和-157322G>A)、第2内含子区域(-109602A>G)、第3外显子区(78T>A)和3 -非翻译区(354T>A).位于第3外显子编码区的78T>A变异导致CAT26CAA(His26Gln)改变,在31号鼻咽癌家系中与患者易感单体连锁,但不存在于其他家系患者和散发病人中.在广东地区和华东地区对照个体中78T>A变异的频率分别为0.45%(2/448)和0.26%(1/384),在白人、黑人样本中没有发现该变异.蛋白质序列比对显示COX7B2亚基26His位点在人、大猩猩、黑猩猩、长臂猿、大鼠和小鼠中十分保守.上述结果提示COX7B2基因26His是一个保守的位点,低频的His26Gln变异可能与31号家系的鼻咽癌高发有关.

染色体4p14与6q27区域基因多态性与山东潍坊地区汉族人Graves病的相关性

目的探讨中国山东潍坊地区汉族人群中染色体4p14区域的rs6832151与染色体6q27区域的rs9355610单核苷酸多态性(SNP)位点的等位基因频率、基因型频率分布情况及与Graves病(GD)的关系。方法采用病例-对照研究方法,应用Taq Man探针技术在ABI 7900平台上对2 382例GD患者和3 092名健康对照者的SNP位点进行等位基因分型,并进行统计分析。结果在2个SNPs位点中,染色体4p14区域的rs6832151 SNP(OR=1.27,P_(Allelic)=1.48×10-9)、6q27区域的rs9355610 SNP(OR=1.10,P_(Allelic)=1.04×10-2),分别与GD的遗传易感性相关。遗传模型分析显示rs6832151的隐性模型相关性分析结果较显著(P_(Recessive)=2.75×10-11),rs9355610的显性模型相关性分析结果较显著(P_(Dominant)=7.15×10-3),而隐性模型分析未发现显著相关(P_(Recessive)=0.130)。结论染色体4p14和6q27区域基因多态性与山东潍坊地区汉族人GD病明显相关联,rs6832151和rs9355610位点是GD发病的易感位点。