保存温度、时间和冻融次数对RNA样本浓度和纯度的影响

RNA在人类多种生理和病理过程中发挥着举足轻重的作用。近些年来,随着分子生物技术在生命科学、医学等方面的广泛应用,以RNA为靶标进行的组织及细胞的分子生物学研究较为广泛。在RNA的科学研究中,高质量RNA可满足RT-PCR、Northern blot、基因表达谱、转录组测序和阵列分析等生物学实验的研究需求[1-2],所以能够获得具有生物活性及化学稳定的完整RNA分子至关重要。然而由于RNA自身结构特性[3]和环境中广泛分布的核糖核酸酶(Ribonuclease,RNase)[4],从血液、组织或培养的细胞中抽提得到的RNA的稳定保存相对困难。

血液放置时间和RNA反复冻融对RNA质量的影响

在临床和科研工作中,血液和组织是比较容易获取的生物标本,特别适用于临床和实验室检测及生物样本库收集保存。DNA、RNA和蛋白质是三种重要的生物大分子,其中RNA在人类多种生理和病理过程中发挥着举足轻重的作用。RNA通常是从组织、全血和培养的细胞中提取获得[1],高质量RNA可满足RT-PCR、Northern blot、基因表达谱、转录组测序和阵列分析等生物学实验的研究需求[2-3]。由于RNA自身结构特性[4]和环境中广泛分布核糖核酸酶(ribonuclease,RNase)[5],同时RNA提取质量亦受到标本类型、储存温度、储存时间、冻融次数和处理方式等影响,使得从血液、组织和培养的细胞中抽提RNA以及RNA的稳定保存相对困难。

阻塞性睡眠呼吸暂停综合征相关性高血压微小核糖核酸调控网络分析

目的:通过生物信息学方法探讨阻塞性睡眠呼吸暂停综合征(OSAHS)相关性高血压的分子机制,挖掘差异表达的核心miRNA以及调控因子,为寻求临床诊断和治疗分子靶点提供理论基础。方法:从公共数据库中分别下载单纯OSAHS患者组与合并高血压OSAHS患者组的miRNA数据集,获得差异表达miRNA并探究其靶基因参与的生物学过程与通路,利用数据库挖掘与cytoscape网络分析获得其相应的核心miRNA、竞争性内源RNA(ceRNA)、转录因子(TF)。结果:与原发性高血压相比,在OSAHS相关高血压中筛选得到7个上调和1个下调的miRNA,靶基因涉及免疫、缺氧、代谢等生物学过程与信号通路,通过网络分析获得一组核心miRNA、ceRNA以及TF调控因子。结论:hsa-miR-22-3p、hsa-miR-595、hsa-miR-6856-5p、KCNQ1OT1、NEAT1、TSIX、ERG、KDM2B、RUNX1可能参与了OSAHS相关性高血压发生,为该病的机制研究与临床治疗提供了理论依据。