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卵形疟原虫非洲分离株K13基因的多态性分析
被引量:
1
1
作者
陈静
刘耀宝
+3 位作者
唐凤
陆凤
唐建霞
曹俊
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期167-172,共6页
目的分析卵形疟原虫柯氏亚种(Plasmodium ovale curtisi)和沃氏亚种(P. ovale wallikeri)非洲分离株K13蛋白编码基因的多态性,为卵形疟原虫青蒿素抗性监测提供科学依据。方法收集江苏省2012-2016年卵形疟患者血样,经流行病学调查确认为...
目的分析卵形疟原虫柯氏亚种(Plasmodium ovale curtisi)和沃氏亚种(P. ovale wallikeri)非洲分离株K13蛋白编码基因的多态性,为卵形疟原虫青蒿素抗性监测提供科学依据。方法收集江苏省2012-2016年卵形疟患者血样,经流行病学调查确认为非洲输入性卵形疟病例。提取血样DNA,通过实时荧光PCR探针法鉴别卵形疟原虫柯氏亚种和沃氏亚种。采用巢式PCR扩增K13基因的结构域并送测序,以卵形疟原虫柯氏亚种参考序列(PlasmoDB登录号:PocGH01_12019400)和沃氏亚种参考序列(GenBank登录号:LT594516.1)为模板,应用BioEdit软件对测序序列进行比对,应用DNAstar软件分析序列的突变情况,用DnaSP软件分析序列多态性,用MEGA软件构建系统进化树。结果 2012-2016年共收集168例卵形疟患者的血样,感染来源地为中非(95例)、南非(37例)、西非(34例)、东非(1例)和北非(1例);卵形疟原虫柯氏亚种和沃氏亚种各84例。168例血样K13基因巢式PCR均扩增获得1 500 bp的条带且均测序成功。卵形疟原虫K13基因核苷酸多样性指数π为0.000 02,单体型多样性指数Hd为0.024, 2个亚种K13基因分别含有2个单体型,分别发现1个单核苷酸多态性位点,各有1例样本检出卵形疟原虫核苷酸碱基突变,柯氏亚种在核苷酸717 bp (氨基酸239E)位点处存在A/G突变,沃氏亚种在核苷酸1998 bp (氨基酸666P)位点处存在T/A突变,均为同义突变,与卵形疟原虫青蒿素耐药性无关。本研究患者血样卵形疟原虫2个亚种K13基因序列中性检验统计结果无明显差异,符合中性进化模型。系统进化树显示,卵形疟原虫柯氏亚种2个单体型聚为一支,沃氏亚种2个单体型聚为另一支。结论卵形疟原虫非洲分离株柯氏亚种和沃氏亚种K13基因未发现非同义突变,其基因多态性水平较低,无青蒿素耐药性相关的基因突变。
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关键词
卵形疟原虫
K13基因
青蒿素抗性
基因多态性
原文传递
题名
卵形疟原虫非洲分离株K13基因的多态性分析
被引量:
1
1
作者
陈静
刘耀宝
唐凤
陆凤
唐建霞
曹俊
机构
国家卫生计生委寄生虫病预防与控制技术重点实验室江苏省寄生虫与媒介控制技术重点实验室世界卫生组织消除疟疾研究与培训合作中心江苏省寄生虫病防治研究所
扬州大学医学院
江南大学公共
卫生
研究
中心
出处
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期167-172,共6页
基金
国家重点研发计划专项(No.2016YFC1200500)
国家自然科学基金(No.81601790)
+4 种基金
江苏省自然科学基金(No.BK20150001)
江苏省重点研发计划(No.BE2016631)
江南大学公共卫生研究中心项目(No.GWZX201505)
江苏省公益类科研院所能力提升项目(No.BM2015024)
江苏省"科教强卫工程"项目~~
文摘
目的分析卵形疟原虫柯氏亚种(Plasmodium ovale curtisi)和沃氏亚种(P. ovale wallikeri)非洲分离株K13蛋白编码基因的多态性,为卵形疟原虫青蒿素抗性监测提供科学依据。方法收集江苏省2012-2016年卵形疟患者血样,经流行病学调查确认为非洲输入性卵形疟病例。提取血样DNA,通过实时荧光PCR探针法鉴别卵形疟原虫柯氏亚种和沃氏亚种。采用巢式PCR扩增K13基因的结构域并送测序,以卵形疟原虫柯氏亚种参考序列(PlasmoDB登录号:PocGH01_12019400)和沃氏亚种参考序列(GenBank登录号:LT594516.1)为模板,应用BioEdit软件对测序序列进行比对,应用DNAstar软件分析序列的突变情况,用DnaSP软件分析序列多态性,用MEGA软件构建系统进化树。结果 2012-2016年共收集168例卵形疟患者的血样,感染来源地为中非(95例)、南非(37例)、西非(34例)、东非(1例)和北非(1例);卵形疟原虫柯氏亚种和沃氏亚种各84例。168例血样K13基因巢式PCR均扩增获得1 500 bp的条带且均测序成功。卵形疟原虫K13基因核苷酸多样性指数π为0.000 02,单体型多样性指数Hd为0.024, 2个亚种K13基因分别含有2个单体型,分别发现1个单核苷酸多态性位点,各有1例样本检出卵形疟原虫核苷酸碱基突变,柯氏亚种在核苷酸717 bp (氨基酸239E)位点处存在A/G突变,沃氏亚种在核苷酸1998 bp (氨基酸666P)位点处存在T/A突变,均为同义突变,与卵形疟原虫青蒿素耐药性无关。本研究患者血样卵形疟原虫2个亚种K13基因序列中性检验统计结果无明显差异,符合中性进化模型。系统进化树显示,卵形疟原虫柯氏亚种2个单体型聚为一支,沃氏亚种2个单体型聚为另一支。结论卵形疟原虫非洲分离株柯氏亚种和沃氏亚种K13基因未发现非同义突变,其基因多态性水平较低,无青蒿素耐药性相关的基因突变。
关键词
卵形疟原虫
K13基因
青蒿素抗性
基因多态性
Keywords
Plasmodium ovale
K13 gene
Artemisinin resistance
Genetic polymorphism
分类号
R382.319 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
卵形疟原虫非洲分离株K13基因的多态性分析
陈静
刘耀宝
唐凤
陆凤
唐建霞
曹俊
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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