母胎亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T多态性与不明原因习惯性流产发生风险的相关性研究

目的探讨母亲和胎儿亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因多态性与不明原因习惯性流产的相关性。方法选取100例不明原因习惯性流产史的患者为病例组,同时收集70例病例组中流产胎儿组织样本;另征集100例正常妊娠者作为对照,其中70例有胎儿脐带血。采用PCR-芯片杂交法检测病例组、对照组以及流产胎儿组织、脐带血的MTHFR C677T基因多态性,统计学分析不同基因型孕妇、胎儿与不明原因习惯性流产风险的相关性。结果对照组C/C基因型频率显著高于病例组C/C基因型频率(35.0%vs.18.0%)(P<0.05),两组C/T基因型频率比较无显著性差异(P>0.05),病例组T/T基因型频率显著高于对照组T/T基因型频率(38.0%vs.24.0%)(P<0.05);与对照组相比,病例组等位基因C频率(40.0%vs.55.5%)显著降低,而等位基因T频率(60.0%vs.45.5%)显著升高,差异具有统计学意义(P<0.05);病例组与对照组配对的母亲-胎儿同时携带MTHFR677位T等位基因比较,频率显著升高(74.3%vs.52.9%),差异有统计学意义(P<0.05)。结论 MTHFRC677T基因型多态性是不明原因习惯性流产风险因子之一,若母婴同时携带T等位基因,不明原因习惯性流产风险进一步升高。

靶向捕获-高通量测序法对一个先天性白内障家系致病基因的研究

目的:应用靶向高通量测序技术鉴定一个常染色体显性遗传先天性白内障家系的致病基因。方法:采用靶向捕获已知白内障致病基因并行高通量测序,筛选出候选基因,并对其进行家系内外的共分离检验。结果:该家系符合常染色体显性遗传规律,所有患者均为核性白内障。靶向基因测序发现,位于主要内源性蛋白MIP基因的一个杂合突变c.97C>T(p.R33C)可能是该家系的致病突变,该变异造成MIP基因编码的水通道蛋白氨基酸序列错义改变,并引起蛋白质结构异常,从而影响其功能。通过一代测序验证并确定该杂合突变为该家系的致病突变。结论:MIP基因c.97C>T(p.R33C)突变是造成该先天性白内障家系致病的分子机制。

细胞信号转导通路介导年龄相关性白内障发生的研究进展（英文）

年龄相关性白内障是一种由于晶状体混浊而影响视力的致盲眼病,居世界首位。氧化应激下晶状体上皮细胞凋亡相关信号转导通路的激活是介导年龄相关性白内障的主要机制。细胞凋亡有许多相关的信号转导通路,是一个复杂的网络系统。本文总结介导年龄相关性白内障不同的凋亡细胞信号转导通路,为进一步研究奠定基础。

基于国际疾病分类(ICD-10)的四川省先天性病残儿疾病顺位及趋势分析

目的:了解四川省病残儿先天性疾病顺位及变化趋势。方法:基于标准化的国际疾病分类(ICD-10)编码自动归类流程,对四川省2004年-2015年地市级医学鉴定的18 897例先天性病残儿21 059个鉴定诊断进行疾病编码,应用SAS 9.2、R 3.3.3统计软件对鉴定资料进行基本人口学特征,总体、地区和年度的疾病顺位及趋势分析。结果:四川省2004年—2015年先天性病残儿平均鉴定审批率为83.3%,鉴定时患儿平均年龄7.7岁,男性占59.2%,农村占77.5%。先天性病残儿鉴定诊断共有131种,心脏的其他先天性畸形,心间隔先天性畸形,脑的其他先天性畸形,睾丸未降,肌肉骨骼的其他先天性变形,唐氏综合征,头、面、脊柱和胸的先天性肌肉骨骼变形,上肢短小缺陷,髋先天性变形,腭裂伴有唇裂为高发的前10位先天性疾病。地区顺位显示除泸州市首位高发先天性疾病为脑先天性畸形外,其余市(州)均为先天性心脏病。年度趋势分析结果表明唐氏综合征、心间隔先天性畸形和地中海贫血呈上升趋势,而肌肉骨骼的先天性变形、脑先天性畸形和睾丸未降呈下降趋势。结论:先天性心脏病、脑先天性畸形,睾丸未降,肌肉骨骼先天性变形,唐氏综合征等是四川省先天性病残儿的高发病种,需要针对唐氏综合征、心间隔先天性畸形和地中海贫血等呈上升趋势的先天性疾病制定切实有效的重点防治策略,降低儿童先天性疾病的发生率和致残率。

粉防己碱对心肌成纤维细胞增殖、活化的影响

目的:探讨粉防己碱(tetrandrine,Tet)对大鼠心肌成纤维细胞增殖、活化的影响。方法:采用细胞计数试剂盒(cell counting kit-8C,CCK-8)的方法检测不同浓度Tet对心肌成纤维细胞增殖的抑制作用;采用蛋白质印迹(Western blot)法检测Tet对由转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)诱导的心肌成纤维细胞β-链蛋白(β-catenin)、波形蛋白(vimentin,Vm)、纤连蛋白(fibronectin,Fn)及平滑肌α-肌动蛋白(smooth muscleα-actin,SMA)的表达上调的影响作用;采用实时荧光定量PCR的方法检测Tet作用下,TGF-β诱导的心肌成纤维细胞Ⅰ型胶原(collagen-1,Col-1)和Ⅲ型胶原(collagen-3,Col-3)的表达上调的变化。结果:CCK-8检测结果显示,分别用0.5、1、2、4、8μmol/L的Tet处理心肌成纤维细胞,其增殖活力分别下降至对照组的94.4%、84.9%、74.9%、63.8%、50.3%,差异有统计学意义(所有P值<0.05;1、2、4、8μmol/L处理组P值<0.001)。Western blot检测结果显示:5μg/L的TGF-β显著上调β-catenin、Vm、Fn及SMA的表达(P值分别为0.001、0.008、0.010、0.001),而用0.5μmol/L的Tet预处理心肌成纤维细胞后,可以阻断由TGF-β诱导的β-catenin、Fn、SMA的表达上调(P值分别为0.009、0.005、0.019),但不改变Vm的表达变化(P>0.05)。荧光定量PCR检测结果表明:用0.5μmol/L的Tet预处理心肌成纤维细胞,可以减弱由TGF-β诱导的Ⅰ型及Ⅲ型胶原的表达上调,差异有统计学意义(P<0.001)。结论:Tet可以显著抑制心肌成纤维细胞的增殖,并阻断由TGF-β诱导的心肌成纤维细胞活化,据此推断,Tet可能具有抗心肌纤维化的作用,进而阻断心肌重塑。

先天性白内障致病基因EPHA2的筛查与鉴定

目的:应用新一代高通量测序技术研究一个连续三代都有患病的先天性白内障家系的致病基因。方法:采用已知候选基因靶向捕获富集的方法并结合二代测序技术,筛选出候选突变,应用Sanger测序对其进行验证及家系内的共分离检验,之后对其进行信息学预测。结果:该家系共七名患者,遗传方式符合常染色体显性遗传规律。靶向基因测序发现了EPHA2基因的一个杂合突变c.1532C>T,该变异造成EPHA2基因编码的跨膜蛋白受体氨基酸序列错义改变(p.T511M),信息学预测表明E-PHA2氨基酸511位在物种进化上保守且T511M突变引起蛋白质功能改变,Sanger测序结果表明该突变可信并且在先天性白内障家系内与疾病表型共分离。结论:EPHA2基因c.1532C>T(p.T511M)可能是本研究先天性白内障家系的致病突变。病基因。方法:采用已知候选基因靶向捕获富集的方法并结合二代测序技术,筛选出候选突变,应用Sanger测序对其进行验证及家系内的共分离检验,之后对其进行信息学预测。结果:该家系共七名患者,遗传方式符合常染色体显性遗传规律。靶向基因测序发现了EPHA2基因的一个杂合突变c.1532C>T,该变异造成EPHA2基因编码的跨膜蛋白受体氨基酸序列错义改变(p.T511M),信息学预测表明EPHA2氨基酸511位在物种进化上保守且T511M突变引起蛋白质功能改变,Sanger测序结果表明该突变可信并且在先天性白内障家系内与疾病表型共分离。结论:EPHA2基因c.1532C>T(p.T511M)可能是本研究先天性白内障家系的致病突变。

缺失数据下蛋白质多结构叠加的迭代方法

蛋白质三维结构叠加面临的主要问题是,参与叠加的目标蛋白质的氨基酸残基存在某些缺失,但是多结构叠加方法却大多数需要完整的氨基酸序列,而目前通用的方法是直接删去缺失的氨基酸序列,导致叠加结果不准确。由于同源蛋白质间结构的相似性,因此,一个蛋白质结构中缺失的某个区域,可能存在于另一个同源蛋白质结构中。基于此,本文提出一种新的、简单、有效的缺失数据下的蛋白质结构叠加方法(ITEMDM)。该方法采用缺失数据的迭代思想计算蛋白质的结构叠加,采用优化的最小二乘算法结合矩阵SVD分解方法,求旋转矩阵和平移向量。用该方法成功叠加了细胞色素C家族的蛋白质和标准Fischer's数据库的蛋白质(67对蛋白质),并且与其他方法进行了比较。数值实验表明,本算法有如下优点:(1)与THESEUS算法相比较,运行时间快,迭代次数少;(2)与PSSM算法相比较,结果准确,运算时间少。结果表明,该方法可以更好地叠加缺失数据的蛋白质三维结构。

基于高斯曲率的蛋白质嵌入到对称低温电镜密度图的方法

为了解决低温电镜三维重构得到的对称生物大分子三维结构分辨率低的问题,提出一种新的基于高斯曲率计算的自动化的方法.通过计算生物分子表面的高斯曲率和优化模型等数学方法把单个蛋白质或其他亚基嵌入到对称的低温电镜密度图中,通过计算蛋白质和对称低温电镜密度图的离散高斯曲率来定义特征点,对低温电镜密度图,利用K-means分类来定义相应的特征点.用均方根偏差值、曲率的交叉关联系数和优化模型来匹配对应的特征点,用最小二乘法计算旋转矩阵和平移向量.最后,用同样的方法把其他部分也嵌入到对称的生物大分子中.给出了椭球体x^2+y^2/2+z^2/3=1的解析高斯曲率和数值计算的高斯曲率的比较、蛋白质1DOR的高斯曲率计算和特征点的计算结果、蛋白质1DOR和2REC的分子装配结果可视化.数值实验结果表明所提出来的一系列的方法是准确和有效的.

生物电阻抗分析法和双能X射线吸收法测量人体脂肪率的对比研究

目的探究生物电阻抗分析法(bioelectrical impedance analysis,BIA)和双能X射线吸收法(dual-energy X-ray absorptiometry,DXA)测量体脂肪率的相关性和一致性,为BIA法在人群筛查中的应用价值提供科学依据。方法在北京招募199名志愿者,其中男性92人,女性107人,分别采用DXA法和BIA法进行体成分测量,运用SPSS 18.0和Med Calc统计软件分析2种方法测量体脂肪率的相关性和一致性。结果通过配对t检验发现,DXA法和BIA法测得的女性、男性及全体受检者的体脂肪率的差异均无统计学意义(P>0.05);通过相关分析发现,DXA和BIA测量女性、男性及全体受检者体脂肪率的r值分别为0.960 4、0.973 4和0.976 9,有统计学意义(P<0.01),具有较高的相关性;通过Bland-Altman分析发现,2种方法测得的女性、男性及全体受检者的体脂肪率均具有较强的一致性。结论 BIA和DXA测量体脂肪率的相关性和一致性较好,BIA法在人群筛查中有较好的应用价值。

四川省病残儿先天性疾病性别、城乡顺位差异及年龄趋势分析

目的了解四川省病残儿先天性疾病性别、城乡顺位差异及年龄趋势,为探讨疾病重点防治策略提供科学依据。方法基于国际疾病分类编码体系,对四川省2004-2015年鉴定的18 897例先天性病残儿对应的21 059个鉴定诊断进行疾病编码,分析性别、城乡顺位差异及年龄趋势。结果先天性心脏病在女性(30.85%)病残儿中构成比高于男性(19.08%),脑先天性畸形、肌肉骨骼先天性变形构成比在男性(7.24%和4.76%)中高于女性(5.94%和3.92%)。脊柱及胸廓先天性畸形构成比随年龄增长而升高,先天性心脏病、脑先天性畸形、唐氏综合征则随年龄增长而降低(均有P<0.05)。唐氏综合征、先天性晶状体畸形在城镇组中构成比更高,肌肉骨骼先天性变形、上肢短小缺陷、唇腭裂在农村组中构成比更高。结论四川省病残儿先天性疾病在性别、城乡顺位构成和年龄趋势上存在差异,应据此制订切实有效的重点防治策略,合理管控先天性病残儿家庭再生育风险,降低疾病发生率和致残率。

一种基于特征点匹配的生物大分子装配方法

研究高分辨率的大分子三维结构,对于分析研究其功能和生物代谢路径具有很重要作用.许多大分子结构可以由低温电镜得到,然而低温电镜三维重构得到的三维结构仍然需要进一步提高其分辨率,所以这些结构仍然需要具体信息.大分子的单独组成部分可以通过结晶、NMR、或者蛋白质结构比较等方法得到.如何将这些高分辨率的组成部分正确装配到大分子结构中是一个很复杂的问题.该问题的实质可以理解为图像处理.在生物大分子的装配过程中,大部分研究者都会用到特征点的方法.现有的研究方法几乎都是基于几何体内的特征点,本文提出一种新的基于蛋白质和低温电镜密度图的表面高斯曲率的方法结合优化模型,对该问题进行研究.数值实验表明,我们的方法是有效的.