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题名一种基于亲疏水性的替代矩阵
被引量：2
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作者
孟翔燕
孟军
葛家麒
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机构
东北农业大学理学院
国家大豆工程技术中心大豆发展战略研究部
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出处
《数学的实践与认识》
CSCD
北大核心
2009年第7期105-112,共8页
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文摘
主要利用蛋白质统计信息和氨基酸与疏水级映射关系,提出一种基于亲疏水性的替代矩阵HB62,解决蛋白质疏水级序列相似性计算问题.采用CB513数据集,分别利用Blosum62和HB62计算蛋白质间的相似程度,结果显示,两种方法计算结果具有一致性,验证了HB62的正确性与有效性.HB62的设计,极大地简化了蛋白质疏水级序列相似性计算问题,有效地降低预测算法复杂度,提高预测准确率,推动蛋白质亲疏水性的相关理论的发展.
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关键词
亲疏水性
比对算法
替代矩阵
HB62
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Keywords
hydrophilic-hydrophobic property
alignment algorithm
substitution matrix hydropbilic-hydrophobic blosum62
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分类号
Q51
[生物学—生物化学]
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