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乙型肝炎病毒基因组C区启动子突变位点新型检测方法的建立、验证及初步应用
被引量:
5
1
作者
程鹏飞
刘绪
+2 位作者
余敏
冯杨
唐景峰
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2014年第10期1313-1320,共8页
目的 利用错配扩增和荧光PCR技术,建立一种针对乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因组C区启动子(basal core promoter,BCP)1762/1764突变位点的新型检测方法,并对该方法进行验证及临床评价。方法 根据NCBI登录的HBV A-H型基因...
目的 利用错配扩增和荧光PCR技术,建立一种针对乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因组C区启动子(basal core promoter,BCP)1762/1764突变位点的新型检测方法,并对该方法进行验证及临床评价。方法 根据NCBI登录的HBV A-H型基因序列(以GenBank号为AB033556.1的C基因型作为标准参考序列)合成野生型和突变型标准品序列,测序后连接至pMD-18T载体上,构建质粒标准品,设计引物、探针及合适的突变检测体系,确定检测的线性范围;对建立的方法进行灵敏度、重复性、特异性、稳定性验证;分别用本实验建立的ARMS-PCR法和基因Sanger测序法(金标准)检测132份慢性乙型肝炎患者血液样本的基因位点是否发生突变,并分析ARMS-PCR法的灵敏度和特异度。结果ARMS-PCR法能检测1 × 10^2- 1 × 10^9 copies/ml的野生型和突变型质粒;野生型和突变型样本检测的Ct差值(驻Ct)在7以上,且能检出最低达1%突变含量的混合质粒和样本;该方法灵敏度较高,重复性、特异性、稳定性良好;其检测132份慢性乙型肝炎患者血液样本1762/1764位点突变阳性率为41.7%,明显高于Sanger测序法检测结果(P〈0.05)。结论 建立的ARMS-PCR法能很好地用于评估乙肝患者患肝癌的风险,且较Sanger测序法检测精度更高,更适合于临床推广。
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关键词
乙型肝炎病毒
肝癌
基因组C区启动子
1762/1764突变
扩增阻碍突变系统
聚合酶链反应
原文传递
题名
乙型肝炎病毒基因组C区启动子突变位点新型检测方法的建立、验证及初步应用
被引量:
5
1
作者
程鹏飞
刘绪
余敏
冯杨
唐景峰
机构
武汉大学医院检验科
基因诊断与肿瘤个性化治疗湖北省工程研究中心
武汉百泰
基因
工程
有限公司
武汉大学生命科学学院病毒学国家重点实验室
出处
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2014年第10期1313-1320,共8页
基金
"艾滋病与病毒性肝炎等重大传染病防治"科技重大专项-传染病核酸诊断试剂的研制(2013ZX10004802)
文摘
目的 利用错配扩增和荧光PCR技术,建立一种针对乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因组C区启动子(basal core promoter,BCP)1762/1764突变位点的新型检测方法,并对该方法进行验证及临床评价。方法 根据NCBI登录的HBV A-H型基因序列(以GenBank号为AB033556.1的C基因型作为标准参考序列)合成野生型和突变型标准品序列,测序后连接至pMD-18T载体上,构建质粒标准品,设计引物、探针及合适的突变检测体系,确定检测的线性范围;对建立的方法进行灵敏度、重复性、特异性、稳定性验证;分别用本实验建立的ARMS-PCR法和基因Sanger测序法(金标准)检测132份慢性乙型肝炎患者血液样本的基因位点是否发生突变,并分析ARMS-PCR法的灵敏度和特异度。结果ARMS-PCR法能检测1 × 10^2- 1 × 10^9 copies/ml的野生型和突变型质粒;野生型和突变型样本检测的Ct差值(驻Ct)在7以上,且能检出最低达1%突变含量的混合质粒和样本;该方法灵敏度较高,重复性、特异性、稳定性良好;其检测132份慢性乙型肝炎患者血液样本1762/1764位点突变阳性率为41.7%,明显高于Sanger测序法检测结果(P〈0.05)。结论 建立的ARMS-PCR法能很好地用于评估乙肝患者患肝癌的风险,且较Sanger测序法检测精度更高,更适合于临床推广。
关键词
乙型肝炎病毒
肝癌
基因组C区启动子
1762/1764突变
扩增阻碍突变系统
聚合酶链反应
Keywords
Hepatitis B virus
Liver cancer
Basal core promoter(BCP)
1762 / 1764 mutation
Amplification refractor mutation system(ARMS)
Polymerase chain reaction(PCR)
分类号
R373.21 [医药卫生—病原生物学]
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乙型肝炎病毒基因组C区启动子突变位点新型检测方法的建立、验证及初步应用
程鹏飞
刘绪
余敏
冯杨
唐景峰
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2014
5
原文传递
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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