甜樱桃绿变植原体的分子检测及鉴定

为明确甜樱桃绿变植原体的分类地位,通过对表现绿变症状的甜樱桃感病植株总DNA进行16S rRNA基因、rp基因和tuf基因的PCR扩增、克隆及序列分析。结果表明,甜樱桃绿变植原体16SrRNA基因片段大小为1248 bp,与枣疯植原体(AB052876)聚为一簇,且相似系数为1.00,应同属于16SrⅤ-B亚组。基于rp基因系统进化分析表明,甜樱桃绿变植原体与枣疯植原体JWB(AY197681)聚为一簇,属于rpV-C亚组。基于tuf基因系统进化分析显示,甜樱桃绿变植原体与枣疯植原体JWB-XFDO(GU968759)等聚为一簇,属于16SrⅤ组。明确了甜樱桃绿变植原体的分类,为泰安地区病害检测、诊断以及科学防控提供依据。

基于小RNA测序的甜樱桃病毒种类检测及鉴定

病毒病是甜樱桃的重要病害之一,利用高通量测序技术鉴定病毒病害种类,通过对2个表现“花脸”症状的甜樱桃样品YT-1和YT-2进行小RNA测序,并对获取的小RNA进行组装注释。结果表明,样品YT-1获得14190241条reads,鉴定到的主要病毒是樱桃小果病毒2,占小RNA的55.12%,还包括李属坏死环斑病毒、樱桃病毒病A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒、樱桃绿环斑驳病毒及啤酒花矮化类病毒;样品YT-2获得14954849条reads,鉴定到的主要病毒是李属坏死环斑病毒,占小RNA的59.05%,还包括樱桃病毒A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒及樱桃绿环斑驳病毒。