分子人类学所见历史上闽越族群的消失

分子人类学用DNA材料和计算生物学方法解答了很多人类学的问题。对于中国南方和东南亚地区最大的族群,侗傣族群和马来族群,分子人类学研究发现他们有共同的起源——百越族群,所以可以定义为“澳泰族群”。闽越是这个族群历史上重要的一支,曾经是福建的主体民族。通过对现代福建和其他闽语人群的分子人类学研究,结果并没有看到闽越的结构。闽语人群基本都是来源于北方的汉族移民。所以可以确定历史上的闽越族在福建地区基本上已经消失。

空格人与八甲人5项舌运动类型的人类学分析

采用随机抽样的方法,在云南对空格人和尔苏人进行了5项舌运动类型的调查,调查了71例(男性46例,女性25例)空格人和158例(男性61例,女性97例)八甲人.调查结果显示,(1)空格人的卷舌率为66.20%,叠舌率为0.00%,翻舌率为8.45%,尖舌率为57.75%,三叶舌率为1.41%;八甲人的卷舌率为56.96%,叠舌率为0.63%,翻舌率为2.53%,尖舌率为61.39%,三叶舌率为5.70%.(2)与国内其他族群相比,空格人和八甲人的卷舌率和尖舌率处于中等水平,叠舌率和翻舌率的水平偏低,空格人的三叶舌率水平偏低,八甲人的三叶舌率处于中等水平.(3)聚类分析的结果表明,空格人、八甲人和布依族的舌运动类型最为接近.(4)空格人中只有翻舌和尖舌存在着相关性,八甲人中只有卷舌和三叶舌存在相关性.

分子人类学视野下的达斡尔族族源研究

达斡尔族不仅与其他蒙古语族人群具有共同的父系起源关系,并且是全体蒙古语族始祖人群的最古老分支的直系后裔。达斡尔族中部分主要姓氏与特定父系基因类型存在关联现象,敖拉哈拉处于达斡尔族最为古老和核心的奠基者哈拉的遗传学地位。

青铜时代晚期新疆五堡墓地人类颅骨非测量性状研究

人类颅骨非测量性状指在人类颅骨上一些微小的形态变异。本研究通过观察五堡墓地52具颅骨的61项非测量性状,对非测量性状进行了性别差异、左右侧别差异、性状之间的相关性分析,发现五堡人群的非测量性状没有显著的性别差异、侧别差异,性状之间的相关性较弱。为进一步探索新疆五堡与其他欧亚大陆人群之间的关系,研究收集整理世界范围古代及现代人群的颅骨非测量性状数据,对五堡墓地颅骨数据与世界范围数据进行主成分分析和邻接网络分析,观察到五堡人群靠近古代及现代东亚、东北亚、中亚和北极人群,推测青铜时代晚期新疆五堡人群可能受到较多东亚、东北亚及中亚人群的影响。

基因组拷贝数变异及其突变机理与人类疾病

拷贝数变异(Copy number variation,CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1 kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV是基因组结构变异(Structural variation,SV)的重要组成部分。CNV位点的突变率远高于SNP(Single nucleotide polymorphism),是人类疾病的重要致病因素之一。目前,用来进行全基因组范围的CNV研究的方法有:基于芯片的比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,aCGH)、SNP分型芯片技术和新一代测序技术。CNV的形成机制有多种,并可分为DNA重组和DNA错误复制两大类。CNV可以导致呈孟德尔遗传的单基因病与罕见疾病,同时与复杂疾病也相关。其致病的可能机制有基因剂量效应、基因断裂、基因融合和位置效应等。对CNV的深入研究,可以使我们对人类基因组的构成、个体间的遗传差异、以及遗传致病因素有新的认识。

肠道微生物测序研究中不同实验来源差异的综合评价以及应用

肠道微生物测序研究具有将微生物结果转化为人类健康的巨大潜力。16S扩增子测序和宏基因组鸟枪测序(whole-metagenome shotgun,WMS)是微生物组研究中的两大主要方法,各具优势。然而,研究样品的异质性、测序仪和文库制备方法的差异如何影响肠道微生物测序结果的可重复性仍有待深入研究。该研究旨在通过比较粪便样本中微生物组成的差异,为测序技术的选择提供参考标准。3种广泛采用的测序仪的结果显示,WMS法中技术重复相关性(r=0.94)较高,而生物学重复相关性(r=0.69)较低。Bray-Curtis距离表明,生物学重复的差异大于技术重复(P<0.001)。此外,16S和WMS数据集间具有明显的分类学图谱差异。研究结果表明,同质化是样品DNA提取前的一个必要步骤;测序仪对分类学变异的贡献小于文库制备方法。我们开发了经验贝叶斯方法,即在计算中“借用信息”,利用标准化数据和(非)参数先验分布分析批次效应参数,提高了16S和WMS之间的群体可比性,为进一步应用于融合分析已发表的16S和微生物数据集提供了依据。

云南丽江古人类股骨的形态结构

1960年,在云南省丽江市发现了三根古人类股骨,通过地层观察,仅PA108可归为更新世晚期。前人对PA108做了初步报导,为了进一步了解丽江人股骨的演化分类地位和东亚早期现代人股骨形态变异,本文对PA108的内外结构进行了详尽的分析。研究发现,PA108具有明显的早期现代人特征,即明显的股骨粗线、骨干中部后侧骨密质最厚和中部横断面轮廓形状偏椭圆。PA108标本也有一定的特殊性,体现在骨干中近端和中部骨密质厚度分布上,这可能与其股骨嵴发育较弱有关,这一特征也导致了PA108与其他东亚早期现代人之间的形态差异,这些形态变异进一步扩大了目前已知的东亚地区早期现代人变异范围。同时,在采用骨密质厚度分布模式进行分类时,建议关注股骨骨干中部骨密质最厚部位。

辽宁建平古人类肱骨形态结构分析

1957年,在辽宁省建平县发现了一根古人类肱骨化石,编号PA103。通过同一批龙骨中筛选的哺乳动物化石,吴汝康推断PA103应该为更新世晚期古人类,并对该化石进行了表面形态特征观察和描述。为了对PA103化石的内外结构进行更全面的了解,除了线性测量数据的对比,本文还通过计算机断层扫描技术,结合生物力学和形态示量图分析对建平古人类右侧肱骨化石PA103进行了分析。通过本研究发现,PA103骨干横断面的生物力学粗壮度和力学形状指数明显小于尼安德特人,而与同时期欧亚大陆古人类不利手侧最为接近,这说明建平人右侧肱骨可能不是惯用手,同时,建平人的行为活动应该与同时期同地区的古人类处于同一水平,而小于尼安德特人。整体来看,PA103骨干骨密质厚度和截面惯性矩与近现代人的分布模式较为接近,除局部数值增大外,其整体数值小于近现代人的平均水平,这可能与遗传或行为活动有关,由于缺少古人类化石对比数据,更详细的了解还需后期开展更多相关的研究。

短期冻存时间和复苏温度对血清生化指标结果稳定性的影响

目的分析血清样本短期冻存时间和冻存后复苏温度对临床常规检测生化指标结果稳定性的影响。方法收集2021年6月同济大学附属上海市第四人民医院162例住院患者的血清样本为研究对象,将测得的新鲜血清样本临床生化指标结果作为基准值。血清样本各项指标检测完成后标记检测日期,将血清放置在–80℃冰箱中保存。运用配对t检验或秩和检验比较各组各项指标检测值与基准值之间的差异,分析血清短期冻存时间和复苏温度对于其生化指标结果稳定性的影响。结果短期冻存时间对血清样本的生化指标值产生影响,尤其是血清中的代谢类指标均受冻存时间和复苏温度的影响。而对于蛋白质类和脂类指标而言,血清样本在4℃的条件下缓慢复苏时,其稳定性优于在常温条件下复苏。结论短期冻存时间和复苏温度对血清生化指标结果准确性和稳定性有影响,为了后续临床研究结果的准确性,应根据不同的研究指标选择对血清样本的复苏温度。

汉族高姓父系人群的群体遗传分析与族源探究

姓氏与Y染色体都基本遵循父系遗传规律,通过研究同姓氏群体的Y染色体遗传标记可直接探索姓氏家族的起源。中国大部分姓氏群体还缺乏研究,例如南北朝时期的民族融合过程中影响颇大的高姓。本研究对中国18个省市的175个高姓男性个体唾液DNA进行PCR扩增,统计分析了Y染色体单核苷酸多态(SNP)与短串联重复序列(STR)的等位基因频率及单倍群频率。基因分型发现单倍群O2a-M324(61.83%)、O1b-M268(14.51%)、N-M231(9.16%)、C2-M217(5.34%)、O1a-M119(4.58%)为高姓常见类型,通过与汉族人群的对比发现单倍群常见类型一致,并未保留大量少数民族融入成分。通过与分属于不同语系和语族的人群进行主成分分析和多维尺度分析,表明高姓人群与汉族自然人群无显著差异,没有表现出Y染色体单倍群聚集性,也否定了高姓主体人群的少数民族起源说。但对高姓中北方民族特色单倍群O1b2-M176、C2b1a1a1a-M407、R1a1a-M198、R1b1a1a-M73的共祖时间估算显示北方少数民族在距今1000~2000年间有一个集中的迁入融合,与南北朝时期的民族融合事件吻合。

基于数据库挖掘皮肤黑色素瘤微环境预后生物标志物

目的 通过探索肿瘤微环境(TME)来确定与皮肤黑色素瘤(SKCM)预后生存相关基因,并进一步构建评估SKCM患者预后的风险预测模型。方法 根据癌症基因组图谱(TCGA)数据库和ESTIMATE算法计算SKCM患者的免疫评分和基质评分,筛选高分组与低分组之间的差异表达基因(DEG),并进一步通过功能富集分析、蛋白质相互作用网络(PPI)、生存分析和Lasso回归分析筛选预后显著相关基因,最终利用预后显著相关基因构建风险预测模型。结果 471例SKCM病例纳入本研究,根据免疫评分和基质评分的中位数,将236例评分≥中位数的患者纳入高分组,235例评分<中位数的患者纳入低分组。高免疫评分组和高基质评分组的中位生存时间分别显著长于低免疫评分组和低基质评分组(P值均<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线显示,免疫评分、基质评分均与SKCM患者的生存时间呈正相关(P=0.000 11、0.046)。SKCM患者中高分组和低分组的基因表达数据分析结果显示,高分组和低分组具有不同的基因表达谱。基于免疫评分的结果显示,高分组有1 257个基因上调,20个基因下调[log2差异倍数(|log2(FC)|>1.5),P<0.05];基于基质评分的结果显示,高分组有876个基因上调,42个基因下调[|log2(FC)|>1.5,P<0.05]。免疫评分和基质评分进行基因集富集分析(GSEA),结果显示上调基因主要富集的基因组百科全书(KEGG)通路为细胞因子-细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号传导途径、NF-κB信号传导途径等,基因本体(GO)通路为免疫学突触、细胞因子产生的负向调节和正向调节、细胞杀伤等。韦恩图显示,有728个DEG在免疫评分和基质评分的高分组中表达上调,3个DEG在免疫评分和基质评分的高分组中表达下调,即一共731个基于不同评分筛选出的共有DEG。对731个共有DEG进行功能富集分析,结果显示共有DEG与免疫应答具有相关性;生存分析显示,共有599个(81.9%)基因的表达情况与SKCM患者的预后相关,其中596个(81.5%)基因的高表达与SKCM患者更好的预后相关(P<0.05),3个(0.4%)基因的低表达与SKCM患者更好的预后相关(P<0.05)。通过Lasso回归进一步筛选出29个候选基因,利用29个候选基因计算风险评分,并且根据风险评分将SKCM患者分为高风险组(评分≥中位数)和低风险组(评分<中位数);结果显示,低风险组的中位生存时间显著长于高风险组(P<0.000 1),且AUC达到0.66。结论 探索SKCM患者的TME确定了29个SKCM预后相关基因,构建的风险预测模型可用于评估患者生存情况。

汉族和壮族人群牙齿非测量表型特征

目的 通过对牙齿非测量表型出现率的多元统计学分析和比较,探讨中国汉族和壮族人群牙齿表型的表现特点及与世界人群之间的关系。方法 2015~2019年,在河南省、江苏省和广西壮族自治区壮族和汉族共采集1785例(分别为674例、547例、388例和176例)样本的10项牙齿非测量表型,与已发表的世界人群数据进行主成分分析(PCA)、多维尺度分析(MDS)以及邻接网络分析等。结果 东亚人群可明显划分为东北亚和东南亚两大类群,其中汉族和壮族人群均与东北亚人群接近,而与东南亚人群距离较远;汉族人群内部也存在一定的南部、北部和中部的差异。结论 东亚地区人群确实存在中国型齿和巽他型齿两种牙齿形态类型,中国汉族和壮族人群的牙齿表型均更接近于中国型齿。

4种肥胖测量指标与高脂血症关系的比较研究及适宜切点的选择

目的 比较腰围（waist circumference,WC）、腰臀比（waist hip ratio,WHR）、腰围身高比（waist-to-height ratio,WHtR）、体质指数（body mass index,BMI）4种肥胖测量指标对高脂血症的风险效应,并选择最佳指标计算适宜切点,作为人群高脂血症防控的简便目标.方法 样本数据为泰州人口健康队列Ⅲ期基线调查,应用Pearson相关、Logistic回归来分析4种指标之间及其与血清胆固醇升高（高TC）、三酰甘油升高（高TG）、低密度脂蛋白升高（高LDL）和高密度脂蛋白降低（低HDL）的关联.选择风险贡献最大的指标,计算防控适宜切点及人群归因危险度（population attributable risk,PAR）.结果 相关系数矩阵显示,WHtR与各代谢指标的综合相关性最高;调整常见混杂因素后的Logistic回归分析显示,WHtR对高TC、高LDL及低HDL的风险均相对最高,OR （95 ％CI）分别为1.34 （1.28～1.35）、1.42 （1.37～1.48）及1.45 （1.30～1.54）.而对于高TG,风险最高的指标为WC,调整常见混杂因素后OR（95％CI）为2.09 （1.97～2.22）,其余依次为WHtR的1.97 （1.86～2.09）,WHR的1.93 （1.82～2.05）和BMI的1.80 （1.75～1.86）.可见WHtR对高脂血症有最大的风险效应.性别和年龄分层后,4种指标的风险排序不变.以WHtR作为预测高脂血症的指标选择最优切点,范围为0.51～0.53.以0.52为防控目标计算人群PAR％,可防止人群中约27％的高TG、23％的高TC、近30％的高LDL和16％的低HDL-C的发生.结论 在反映高脂血症的肥胖测量指标中,WHtR具有最大的风险效应.可将WHtR＜0.52作为预防高脂血症的简易防控目标,发挥其在健康教育与自我管理中的作用.

情感平衡在长寿老人健康状况与生活满意度之间的中介效应:结构方程模型的应用

目的探索情感平衡在长寿人群健康状况与生活满意度之间的中介效应。方法研究对象为439例来自如皋长寿队列的长寿老人(≥95+岁)。健康状况包括自评健康及客观健康(疾病严重程度);生活满意度采用生活满意度指数A(Life Satisfaction Index A,LSIA)量表测量;情感平衡通过情感平衡量表(Affect Balance Scale,ABS)测量。采用Spearman相关分析和结构方程模型进行分析。结果客观健康、自评健康、情感平衡以及生活满意度两两之间均相关(P均<0.05);客观健康和自评健康对生活满意度的直接效应不显著(β=0.02,P=0.791;β=0.16,P=0.153),客观健康和自评健康通过情感平衡对生活满意度的间接效应显著(β=-0.14,P<0.05;β=0.45,P<0.001)。结论在长寿人群中情感平衡是健康状况与生活满意度之间的中介变量。

木雅人的手长宽、足长宽与身高的关系

目的探讨四川木雅人手长、手宽、足长、足宽与身高的关系,为人类学、法医学及临床医学提供参考,同时为中国人体质调查积累资料。方法按人类学规定的方法和标准,对年龄在20~70岁四川省木雅人157人（男77名,女80名）的手长、手宽、足长、足宽和身高进行测量统计学分析。结果得出手长、手宽、足长、足宽、身高的均数及相关系数,各组相关系数r在0.279~0.623之间,手长与身高、手宽与身高、足长与身高、足宽与身高呈现相关性,其r分别为：男性0.285,女性0.345;男性0.500,女性0.379;男性0.623,女性0.620;男性0.359,女性0.279。结论由此推算出的8个回归方程可推算出四川木雅人身高。

硬皮病及其在不同人群中遗传因素的差异

硬皮病是一种复杂的自身免疫性疾病,其主要特征有微血管受损和组织器官纤维化,根据其发病累及范围不同,主要分为系统性硬皮病和局限性硬皮病两种类型。硬皮病发病症状复杂,发病机制不明,导致治疗效果不甚理想。硬皮病发病有家族聚集现象及种族差异,表明硬皮病具有遗传易感性。近年来许多研究集中于寻找硬皮病发病的遗传因素,并已发现有多种候选基因及通路参与硬皮病的发生与发展过程。然而,不同人群中的研究结果并未得出完全一致的结论,群体遗传结构的差异可能与硬皮病的发生密切相关。

茶洞话群体的Y染色体遗传结构及其父系起源研究

我国广西的桂东北地区大约有20,000人使用茶洞话,该群体的族源问题一直存在争议。本文为调查茶洞话群体的Y染色体遗传结构,探讨其父系起源,对临桂县使用茶洞话的21名无关男性个体的Y-STR和Y-SNP进行了检测分型,并对该群体与周边民族的遗传关系进行了研究分析。结果显示:茶洞话群体的17个Y-STR位点具有丰富的遗传多态性,适用于群体遗传学和法医学研究;Y染色体高频单倍群为O2*-P31和O2a1*-M95,表明茶洞话群体具有显著的百越民族系统侗傣族群的遗传背景;N-J树和主成分分析显示茶洞话群体与仫佬族的父系遗传关系较之与毛南族和汉族更亲近。本研究结果为茶洞话群体的族源研究提供了遗传学证据。

山东地区汉族人群15个X-STR基因座的遗传多态性

目的研究山东地区汉族人群15个X-STR基因座的遗传多态性,建立法医学应用数据库。方法采用Primer Premier 5.0软件设计多重PCR引物,用4色荧光(FAM、VIC、NED、TET)进行标记,建立多重PCR体系,对山东地区无关汉族人群481例个体(女性295例,男性186例)的15个X染色体上筛选的STR基因座(DXS10011、DXS101、GATA165B12、DXS6795、DXS6800、DXS6801、DXS6803、DXS7132、DXS7133、DXS7423、DXS7424、DXS8377、DXS8378、DXS9898和HPRTB)进行检测。结果所检测的15个X-STR基因座中,GATA165B12、DXS6800、DXS6803、DXS7133与DXS7423在中国山东汉族人群中具有中度多态性,其余10个基因座都具有高度多态性(PIC>0.5,H>0.5)。群体中男性样本之间没有检测到共享单倍型。结论构建的荧光标记复合扩增体系为建立中国山东汉族人群X-STR基因座群体遗传学数据库及其法医学应用提供了有效的手段。

博莱霉素诱导肺纤维化小鼠模型的建立及特征

目的探讨博莱霉素气管灌注诱导肺纤维化小鼠模型在不同时期分子生物学及组织病理学的改变。方法 6～8周龄C57BL/6小鼠60只,30只为正常对照组,30只以博莱霉素2.5 mg/kg单次气管灌注建立小鼠肺纤维化模型(模型组),以肺组织病理学形态及基因表达水平为指标,判断模型小鼠肺纤维化发展阶段。结果正常对照组小鼠的肺组织无明显病理改变,模型组小鼠肺部有不同程度的肺泡结构破坏、炎性细胞浸润以及大量以胶原为主的细胞外基质沉积。基因表达检测结果显示:模型组灌注博莱霉素1～2周,小鼠肺组织白介素(IL)-4、IL-13较正常对照组升高,而3～5周模型组与正常对照组无差异(P>0.05)。模型组肺组织中胶原基因Colla2、Cola13、结缔组织生长因子(CTGF)、转化生长因子-β_1(TGF-β_1)均较正常对照组有不同程度的升高,与组织病理学改变一致。结论博莱霉素2.5 mg/kg单次气管灌注可成功建立肺纤维化小鼠模型;博莱霉素灌注早期以肺部炎性浸润为主,第3周时肺纤维化达到高峰,第5周开始纤维化有所缓解。

中国八甲人与空格人的体质特征

八甲人与空格人属于我国未识别族群。我们去云南省西双版纳调查了八甲人158例(男为61例,女为97例)与空格人71例(男为46例,女为25例)的86项体质指标,初步分析了八甲人与空格人的体质特征。结果如下:1)八甲人的上眼睑皱褶率男为95.08%,女为98.97%;空格人的上眼睑皱褶率男为80.43%,女为100%。八甲人蒙古褶率男为18.03%,女为29.90%;空格人的蒙古褶率男为32.61%,女为64.00%。八甲人与空格人眼裂高度多为中等,眼外角高于眼内角。八甲人男女鼻根高度多为中等。空格人男性鼻根较高,女性鼻根中等。八甲人与空格人男女均为直型鼻梁,鼻基部多为水平方向。八甲人男女颧骨体不突出。八甲人鼻翼高度约为鼻高的1/4。八甲人与空格人男女鼻翼宽与两眼内角间宽几乎等长,多为圆形耳垂,上红唇多为薄唇,唇皮类型多为中等。八甲人眼色多为褐色,空格人眼色多为黑色。2)根据头面部、体部指数分型,八甲人与空格人男女均以高头型率、阔头型率、中鼻型率、中腿型率、宽肩型率、身材矮型率最高。八甲人男女还以圆头型率、长躯干型率、宽胸型率最高。空格人男女还以中胸型率、窄骨盆型率最高。八甲人与空格人男性还以阔面型率最高,而女性则以中面型率最高。3)聚类分析显示八甲人与空格人体质特征属于南方族群类型。