重症监护病区碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌的主动筛查及基因分析

目的调查重症监护病区(ICU)患者在住院期间碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)主动筛查菌株的分布以及CRE耐药基因的检测和分析。方法收集424例ICU患者直肠拭子、咽拭子和腹股沟拭子样本,采用肉汤增菌法进行CRE阳性病例的主动筛查,全自动药敏分析仪进行体外药敏试验,PCR法检测碳青霉烯酶耐药基因,通过多位点序列分型(MLST)和肠杆菌基因间重复共有序列PCR分析CRE菌株的同源性关系。结果直肠拭子、咽拭子和腹股沟拭子CRE筛查阳性率分别为12.5%、5.0%和4.2%,CRE菌株主要来自肺炎克雷伯菌(82.6%)、大肠埃希菌(9.8%)和产气肠杆菌(4.3%),CRE菌株对替加环素、头孢他啶阿维巴坦敏感性较好(>90%);92株CRE碳青霉类耐药基因检测,以blaKPC-2亚型(91.3%)为主;MLST分型结果显示76株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)主要为ST11型(69.7%)和ST15型(28.9%);ERIC-PCR扩增结果分析显示,76株肺炎克雷伯菌主要为谱型A(69.7%)和谱型B(28.9%)。结论ICU住院患者CRE主动筛查以blaKPC-2亚型的CRKP为主,MLST分型和ERIC-PCR扩增结果聚类分析发现主要存在两个克隆株传播。

哈特草螺菌食源性感染致脓毒症1例

为探讨实验室常规鉴定手段对哈特草螺菌临床分离株的鉴定能力,分析案例患者血液中哈特草螺菌的感染来源,本文使用自动生化鉴定系统、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometer,MALDI-TOF MS)、16S rRNA基因测序和RNA聚合酶的β亚基(rpoB)基因测序对哈特草螺菌进行鉴定,并对患者多部位标本进行哈特草螺菌检测。结果显示,自动生化鉴定系统将哈特草螺菌错误识别为洋葱伯克霍尔德菌,MALDI-TOF MS和16S rRNA基因测序无法鉴别哈特草螺菌、aquaticum草螺菌或camelliae草螺菌,rpoB基因测序可以准确将其鉴定为哈特草螺菌;除血液外,仅在患者粪便中检出少量哈特草螺菌,血液和粪便来源的哈特草螺菌肠杆菌基因间重复共有序列聚合酶链反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus polymerase chain reaction,ERIC-PCR)结果显示,两者的DNA带型一致,MALDI-TOF MS核心图谱(main spectra projection,MSP)聚类分析显示两者位于同一节点,且distance level<50,其耐药表型亦相同,血液和粪便来源的哈特草螺菌高度同源。本研究展示了自动生化鉴定系统、MALDI-TOF MS、16S rRNA基因测序和rpoB基因测序对哈特草螺菌的鉴定水平,并证实了哈特草螺菌可通过污染食物,经胃肠道感染导致直肠腺癌术后化疗患者发生脓毒症。

泌尿系统子囊酵母Cyberlindnera fabianii感染1例

费比恩塞伯林德纳氏酵母(Cyberlindnera fabianii)是一种罕见的子囊酵母菌,曾使用Hansenula fabianii,Pichia fabianii,Lindnera fabianii和Candida fabianii等名称,可引起肺炎、心内膜炎、前列腺炎、真菌血症和导管相关感染[1]。以传统生化反应为鉴定依据的真菌鉴定系统对其缺乏鉴定能力,错误鉴定致使真实身份被隐藏,临床危害可能被严重低估[2]。