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基于高通量测序技术的冠心病患者肠道菌群多样性研究
被引量:
27
1
作者
胡海兵
崔立
+4 位作者
郭靓骅
王春艳
华修国
余强
尹桂芝
《上海交通大学学报(农业科学版)》
2016年第2期1-11,19,共12页
为了分析冠心病人群肠道菌群结构和多样性特征,探究冠心病人群与健康人群肠道菌群结构差异。研究共采集50例冠心病患者和35例健康人粪便样本,提取粪便样本总DNA;根据细菌16SrDNA V3~V5区设计引物进行扩增,利用Illumina Miseq平台进行高...
为了分析冠心病人群肠道菌群结构和多样性特征,探究冠心病人群与健康人群肠道菌群结构差异。研究共采集50例冠心病患者和35例健康人粪便样本,提取粪便样本总DNA;根据细菌16SrDNA V3~V5区设计引物进行扩增,利用Illumina Miseq平台进行高通量测序;测序结果经过Reads拼接,OTUs(operational taxonomic units)聚类,物种注释,α多样分析,主成分分析,最终得到样品物种信息。在冠心病组和健康组中,拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)的丰度最高,其中拟杆菌门分别占到46.94%和61.96%,厚壁菌门分别占到41.51%和30.58%;丰度较高的是变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)。此外,两组菌群结构差异性表现为:冠心病组的拟杆菌门明显低于对照组(P=0.015〈0.05);而冠心病组的厚壁菌门显著高于对照组(P=0.009〈0.01)。α多样性分析结果显示,两组人群各样本在细菌种群多样性方面没有明显差异。OTUs比对结果表示,Veillonella、Veillonella dispar、Scardovia、Mogibacterium致病菌在冠心病组显著增高,而Bacteroidetes门下Parabacteroides、Bacteroides uniformis、Bacteroides caccae等有益菌则显著降低。主成份分析显示,综合PC1、PC2、PC3因素冠心病组和对照组样本被较好的区分开,表明健康组和冠心病组菌群结构存在显著差异。这些结果表明,冠心病患者与健康人群在肠道菌群多样性方面没有明显差异,但在菌群结构上存在较大差异;同时冠心病人肠道菌群致病菌数量多于健康人群,而拟杆菌类有益菌低于健康人群。
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关键词
肠道菌群
冠心病
宏基因组
高通量测序
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职称材料
吡格列酮对持续性心房颤动电复律术后炎症水平及效果的影响
2
作者
顾俊
胡伟
+2 位作者
宋芝萍
张大东
刘旭
《中国心脏起搏与心电生理杂志》
2015年第3期228-231,共4页
目的 探讨过氧化物增殖物激活受体γ-激动剂吡格列酮能否依靠其抗炎作用改善持续性心房颤动(AF)患者电复律的效果。方法 前瞻性入选持续性AF合并2型糖尿病患者,随机分为吡格列酮组和对照组,均接受电复律治疗,术后随访3个月。吡格列酮...
目的 探讨过氧化物增殖物激活受体γ-激动剂吡格列酮能否依靠其抗炎作用改善持续性心房颤动(AF)患者电复律的效果。方法 前瞻性入选持续性AF合并2型糖尿病患者,随机分为吡格列酮组和对照组,均接受电复律治疗,术后随访3个月。吡格列酮组接受吡格列酮或其他药物联用控制血糖,对照组采用非吡格列酮控制血糖。入选患者于电复律前和电复律后3个月检查超敏C反应蛋白(hs-CRP)、白介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-a)。结果 吡格列酮组和对照组分别入选48例和49例患者。随访期内吡格列酮组和对照组分别有22例(45. 8%),24例(49. 0%) AF复发(P=0. 756),两组患者无AF复发的Kaplan鄄Meier生存分析亦无明显差异(P=0. 567) 。电复律术后3个月吡格列酮组的hs-CRP、IL-6和TNF-a水平均明显低于对照组(P〈0. 01)。 Cox多因素分析提示AF病程(RR 1. 002, 95% CI 1. 003 -1. 061,P=0. 037)和左房直径(RR 1. 131, 95% CI 1. 029 -1. 242,P= 0. 010)是电复律术后AF复发的预测因素。结论 吡格列酮可减轻持续性AF合并2型糖尿病患者电复律术后炎症水平,但其并不能减少随访期内的AF复发。
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关键词
心血管病学
心房颤动
吡格列酮
电复律
炎症
原文传递
题名
基于高通量测序技术的冠心病患者肠道菌群多样性研究
被引量:
27
1
作者
胡海兵
崔立
郭靓骅
王春艳
华修国
余强
尹桂芝
机构
上海
交通
大学
农业与生物学院
复旦大学附属上海市闵行区中心医院心内科
出处
《上海交通大学学报(农业科学版)》
2016年第2期1-11,19,共12页
基金
上海交通大学"AGri-X"基金项目(AF1500028/001)
文摘
为了分析冠心病人群肠道菌群结构和多样性特征,探究冠心病人群与健康人群肠道菌群结构差异。研究共采集50例冠心病患者和35例健康人粪便样本,提取粪便样本总DNA;根据细菌16SrDNA V3~V5区设计引物进行扩增,利用Illumina Miseq平台进行高通量测序;测序结果经过Reads拼接,OTUs(operational taxonomic units)聚类,物种注释,α多样分析,主成分分析,最终得到样品物种信息。在冠心病组和健康组中,拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)的丰度最高,其中拟杆菌门分别占到46.94%和61.96%,厚壁菌门分别占到41.51%和30.58%;丰度较高的是变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)。此外,两组菌群结构差异性表现为:冠心病组的拟杆菌门明显低于对照组(P=0.015〈0.05);而冠心病组的厚壁菌门显著高于对照组(P=0.009〈0.01)。α多样性分析结果显示,两组人群各样本在细菌种群多样性方面没有明显差异。OTUs比对结果表示,Veillonella、Veillonella dispar、Scardovia、Mogibacterium致病菌在冠心病组显著增高,而Bacteroidetes门下Parabacteroides、Bacteroides uniformis、Bacteroides caccae等有益菌则显著降低。主成份分析显示,综合PC1、PC2、PC3因素冠心病组和对照组样本被较好的区分开,表明健康组和冠心病组菌群结构存在显著差异。这些结果表明,冠心病患者与健康人群在肠道菌群多样性方面没有明显差异,但在菌群结构上存在较大差异;同时冠心病人肠道菌群致病菌数量多于健康人群,而拟杆菌类有益菌低于健康人群。
关键词
肠道菌群
冠心病
宏基因组
高通量测序
Keywords
gut flora
coronary heart disease
metagenome
high-throughput sequencing
分类号
R541.4 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
吡格列酮对持续性心房颤动电复律术后炎症水平及效果的影响
2
作者
顾俊
胡伟
宋芝萍
张大东
刘旭
机构
复旦大学附属上海市闵行区中心医院心内科
上海
交通
大学
附属
胸科
医院
心
内科
出处
《中国心脏起搏与心电生理杂志》
2015年第3期228-231,共4页
基金
上海市医学重点专科建设计划(ZK2012A24)
中国医师协会房颤专项基金项目(2013-2-12)
+1 种基金
上海市科委项目(14411972900)
上海市闵行区科委项目(2012MHZ072)
文摘
目的 探讨过氧化物增殖物激活受体γ-激动剂吡格列酮能否依靠其抗炎作用改善持续性心房颤动(AF)患者电复律的效果。方法 前瞻性入选持续性AF合并2型糖尿病患者,随机分为吡格列酮组和对照组,均接受电复律治疗,术后随访3个月。吡格列酮组接受吡格列酮或其他药物联用控制血糖,对照组采用非吡格列酮控制血糖。入选患者于电复律前和电复律后3个月检查超敏C反应蛋白(hs-CRP)、白介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-a)。结果 吡格列酮组和对照组分别入选48例和49例患者。随访期内吡格列酮组和对照组分别有22例(45. 8%),24例(49. 0%) AF复发(P=0. 756),两组患者无AF复发的Kaplan鄄Meier生存分析亦无明显差异(P=0. 567) 。电复律术后3个月吡格列酮组的hs-CRP、IL-6和TNF-a水平均明显低于对照组(P〈0. 01)。 Cox多因素分析提示AF病程(RR 1. 002, 95% CI 1. 003 -1. 061,P=0. 037)和左房直径(RR 1. 131, 95% CI 1. 029 -1. 242,P= 0. 010)是电复律术后AF复发的预测因素。结论 吡格列酮可减轻持续性AF合并2型糖尿病患者电复律术后炎症水平,但其并不能减少随访期内的AF复发。
关键词
心血管病学
心房颤动
吡格列酮
电复律
炎症
Keywords
Cardiology
Atrial fibrillation
Pioglitazone
Electrical cardioversion
Inflammation
分类号
R541.75 [医药卫生—心血管疾病]
R454.1 [医药卫生—治疗学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高通量测序技术的冠心病患者肠道菌群多样性研究
胡海兵
崔立
郭靓骅
王春艳
华修国
余强
尹桂芝
《上海交通大学学报(农业科学版)》
2016
27
下载PDF
职称材料
2
吡格列酮对持续性心房颤动电复律术后炎症水平及效果的影响
顾俊
胡伟
宋芝萍
张大东
刘旭
《中国心脏起搏与心电生理杂志》
2015
0
原文传递
已选择
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