基于锦绣杜鹃花蕾转录组的SSR标记开发及应用

[目的]探究锦绣杜鹃(Rhododendron pulchrum Planch.)EST-SSR的类型、分布频率和分布特征,开发有效的SSR标记,并验证其在遗传多样性研究和跨物种转移中的应用潜力。[方法]采用RNA-seq技术对锦绣杜鹃‘紫鹤’品种的花蕾进行转录组测序,MISA软件对组装的unigenes内部的SSR位点进行检索,分析其类型、分布频率。利用Primer3.0软件设计引物,并对锦绣杜鹃群体和其近缘种映山红群体进行多样性检测,利用POPGENE-PC2.2软件计算等位基因数、有效等位基因数、多态性位点百分率、Shannon’s信息指数、Nei氏多样性指数、观察杂合度、期望杂合度等参数。[结果]锦绣杜鹃‘紫鹤’花蕾转录组共有49527个unigenes(43766249bp),从中筛选出16120个SSR位点(24.46%),发生频率为1·(2.7kb)^-1。微卫星的重复次数主要集中在524次之间,二核苷酸发生频率最高(9624个,59.70%),其次是单核苷酸(3738个,23.19%),频率最低的为五核苷酸(42个,0.26%)。频率最高的重复基序有A/T、AG/CT、AAG/CTT、AGG/CCT、ACC/GGT、AGC/GCT、AAAG/CTTT、AAGAG/CTCTT、AGAGGG/CCCTCT等。选用13个多态性SSR标记对锦绣杜鹃群体进行PCR扩增,共得到71个等位基因,平均每个位点3~9个;有效等位基因数在各SSR位点之间变化范围为1.684~5.930;观察杂合度HO和期望杂合度HE的变化范围分别为0.000~1.000和0.433~0.848,平均值分别为0.696±0.426和0.705±0.129;Shannon’s信息指数I和Nei氏多样性指数h的变化范围分别为0.736~1.961和0.406~0.831,平均值分别为1.376±0.339和0.683±0.131。此13个标记在映山红群体中的跨物种扩增成功率为100%,并反映出丰富的遗传多样性。2个群体间的遗传差异93.4%存在于群体内部。[结论]基于AG/CT重复基序开发的13个SSR标记具有高度的多态性,为后续杜鹃花属植物的遗传多样性研究、遗传图谱构建、基因定位、分子标记辅助育种等研究奠定了基础。大别山野生映山红资源具有较高的遗传多样性,且杂合度过剩,遗传变异主要发生在群体内部。

基于EST-SSR标记的龟峰山杜鹃花种质资源的遗传多样性研究（英文）

杜鹃是杜鹃花科(Ericaeae)杜鹃花属(Rhododendron)植物,具有较高的观赏价值和生态维持价值。该研究采用EST-SSR标记对湖北龟峰山32个天然杜鹃花样品进行遗传多样性分析,旨在为龟峰山杜鹃的育种研究及新品种选育提供理论基础。7对EST-SSR引物共扩增出31条多态性条带,平均每个位点的等位基因数为4.43个,平均观察杂合度Ho和期望杂合度He的值分别为0.679 58和0.723 14。该研究开发的EST-SSR标记不仅丰富了现有的SSR数据库,也为后续分子标记辅助育种、遗传多样性和遗传结构分析、亲缘关系分析奠定了基础。

柿果实水溶性提取物的抗氧化活性研究

水果具有加快人体体能恢复、延缓衰老的作用。研究利用DPPH法测定罗田甜柿(Diospyros kaki)果实水溶性提取物的抗氧化能力,经优化的最佳反应条件为40℃反应15 min。1 g/mL的柿果实水溶性提取物相当于1.5 mg/mL维生素C的抗氧化效率。对比甜柿果实提取物3种水性溶剂的抗氧化效率,水提取物的抗氧化活性最高,Tris-HCl缓冲液提取物次之,PBS缓冲液提取物抗氧化活性相对较差。

打碗花根状茎介导的自我/非我识别研究

打碗花(Calystegia hederacea)主要以根状茎繁殖,可作为植物自我/非我识别研究的理想材料。试验设置了3种邻株关系进行盆栽,分别是根状茎相连的两株打碗花、根状茎相连但从中断开的两株打碗花,以及来自不同克隆的两株打碗花。结果发现,根状茎断开的同一克隆分株相比根状茎相连分株,茎的生长速度下降,茎基部的分枝显著减少,地上部分茎的分配和叶分配都下降,说明根状茎连接的断开抑制了地上部分生长。表明打碗花很可能是通过根状茎连接介导自我身份认同,并进行生理整合从而最大化克隆植株的适合度。