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云南大围山国家级自然保护区生态敏感性评价及保护对策分析研究 被引量:3
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作者 杨泽鹏 范仕祥 +3 位作者 史兴惠 谭婉君 刘春雨 苏保芬 《山东林业科技》 2023年第1期21-28,共8页
生态敏感性评价为制定研究区域的生态环境综合整治政策提供科学依据。以云南大围山国家级自然保护区为研究区域,选取高程、坡度、坡向、水域缓冲区、道路缓冲区、植被覆盖度、土地利用类型7个生态敏感因子作为评价机制,通过层次分析法(A... 生态敏感性评价为制定研究区域的生态环境综合整治政策提供科学依据。以云南大围山国家级自然保护区为研究区域,选取高程、坡度、坡向、水域缓冲区、道路缓冲区、植被覆盖度、土地利用类型7个生态敏感因子作为评价机制,通过层次分析法(AHP)确定各评价因子权重,运用ArcGIS加权叠加法进行生态敏感性评价,分析结果显示:云南大围山国家级自然保护区的总体敏感程度较高,极度敏感区、高度敏感区、中度敏感区、轻度敏感区、不敏感区面积分别占保护区总面积的5%、8%、10%、27%、50%。本研究可为保护区开展针对性保护与功能区划提供一定的参考依据。 展开更多
关键词 大围山自然保护区 生态敏感性 层次分析法 加权叠加法
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云南大围山国家级自然保护区模式标本植物及其保护利用 被引量:5
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作者 程洪文 张贵良 杨治国 《林业调查规划》 2010年第2期58-62,共5页
统计并列出了采自云南大围山国家级自然保护区的模式标本种子植物219种,隶属于63科133属.分析了大围山自然保护区的模式标本植物不仅有古老、原始等特性,且热带性质明显.区内的模式标本植物除部分具有一定直接经济价值外,多数都具有重... 统计并列出了采自云南大围山国家级自然保护区的模式标本种子植物219种,隶属于63科133属.分析了大围山自然保护区的模式标本植物不仅有古老、原始等特性,且热带性质明显.区内的模式标本植物除部分具有一定直接经济价值外,多数都具有重要的间接经济价值.认为研究模式标本产地对植物的系统研究、种质资源的原地保存、保护以及准确确定保护对象具有重要意义. 展开更多
关键词 模式标本 种子植物 保护利用 大围山自然保护区
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云南大围山国家级自然保护区兰科植物调查研究 被引量:2
3
作者 陶公泯 《乡村科技》 2021年第28期94-96,共3页
兰科植物对生境具有较为严格的要求,不同生境条件下种类组成不同,是生物多样性保护中备受关注的类群。通过调查,对云南大围山自然保护区内兰科植物的多样性和垂直分布格局进行探讨。结果表明,云南大围山国家级自然保护区内有野生兰科植... 兰科植物对生境具有较为严格的要求,不同生境条件下种类组成不同,是生物多样性保护中备受关注的类群。通过调查,对云南大围山自然保护区内兰科植物的多样性和垂直分布格局进行探讨。结果表明,云南大围山国家级自然保护区内有野生兰科植物267种,隶属83属;其中地生类型124种,附生类型136种,腐生类型6种;其中中国特有29种,云南省特有8种,滇东南地区特有3种,大围山特有5种,中越特有10种。大围山保护区内野生兰科植物的垂直分布格局呈"中间膨胀形"或"单峰形",其中海拔1 000~1 500 m段的兰科物种多样性较高。 展开更多
关键词 兰科植物 多样性 垂直分布格局
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云南大围山自然保护区两类国家级保护植物的比较及其特点分析 被引量:4
4
作者 程洪文 张贵良 杨治国 《林业调查规划》 2009年第6期66-71,共6页
云南大围山自然保护区内有国家重点保护野生植物48种,其中一级16种,二级32种,隶属26科39属,国家珍稀濒危保护植物50种,其中一级2种,二级20种,三级28种.从保护级别、生活型、果型、物候期方面对这两类保护植物进行了比较,并从数量、分布... 云南大围山自然保护区内有国家重点保护野生植物48种,其中一级16种,二级32种,隶属26科39属,国家珍稀濒危保护植物50种,其中一级2种,二级20种,三级28种.从保护级别、生活型、果型、物候期方面对这两类保护植物进行了比较,并从数量、分布、古老性、生境及经济价值方面分析了其特点. 展开更多
关键词 大围山自然保护区 国家重点保护植物 珍稀濒危保护植物 生活型 物候期 分布特点
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云南大围山自然保护区石灰岩珍稀濒危植物研究 被引量:1
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作者 陶公泯 《林业调查规划》 2014年第6期50-55,59,共7页
在大围山自然保护区河口南溪石灰岩地区海拔100-1 200m区域设置样带、样方等进行标本采集,根据相关的植物志、植物图鉴及珍稀濒危植物保护文件进行统计分析。结果表明:区内有珍稀濒危保护植物34种,隶属26科32属,其中,蕨类植物3科3属3种... 在大围山自然保护区河口南溪石灰岩地区海拔100-1 200m区域设置样带、样方等进行标本采集,根据相关的植物志、植物图鉴及珍稀濒危植物保护文件进行统计分析。结果表明:区内有珍稀濒危保护植物34种,隶属26科32属,其中,蕨类植物3科3属3种,裸子植物4科5属6种,被子植物19科24属25种;濒危的种类8种,渐危的16种,稀有的10种。文章对植物濒危原因、保护措施等进行了分析。 展开更多
关键词 石灰岩植物 珍稀濒危植物 区系成分 分布区类型 大围山国家级自然保护区
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毛果木莲在云南大围山地区的资源分布现状及保护措施 被引量:6
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作者 楚永兴 欧阳志勤 +3 位作者 张荣贵 徐涛 钱良超 曹莹莹 《林业调查规划》 2011年第4期63-65,70,共4页
毛果木莲为中国云南特有珍稀树种,据文献记载仅分布于云南省屏边县"大围山",是国家Ⅱ级重点保护植物.于2008和2010年对毛果木莲在云南大围山地区资源分布状况进行了调查,分析其种群现状、自然更新能力、当地居民的利用及导致... 毛果木莲为中国云南特有珍稀树种,据文献记载仅分布于云南省屏边县"大围山",是国家Ⅱ级重点保护植物.于2008和2010年对毛果木莲在云南大围山地区资源分布状况进行了调查,分析其种群现状、自然更新能力、当地居民的利用及导致树种濒危的可能因素,指出其种质资源有效保护所面对的问题及应采取的措施. 展开更多
关键词 毛果木莲 种群数量 资源分布 大围山自然保护区
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大围山生态文明教育基地厚植“生态”根基奏响“文明”乐章
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作者 《云南林业》 2023年第12期12-17,共6页
大围山国家级自然保护区地处云南红河州东南部、北回归线以南,地跨个旧、蒙自、屏边、河口4县市,是我国大陆唯一分布有湿润雨林和热带山地森林垂直带谱最完整的保护区,生态价值凸显,人文氛围浓。因此,大围山国家级自然保护区于2019年5... 大围山国家级自然保护区地处云南红河州东南部、北回归线以南,地跨个旧、蒙自、屏边、河口4县市,是我国大陆唯一分布有湿润雨林和热带山地森林垂直带谱最完整的保护区,生态价值凸显,人文氛围浓。因此,大围山国家级自然保护区于2019年5月成功创建省级生态文明教育基地。 展开更多
关键词 生态文明教育 热带山地 大围山 垂直带谱 人文氛围 云南红河州 北回归线
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体外模拟胃肠消化过程中云南金花茶抗氧化能力变化
8
作者 石志娇 唐军荣 +4 位作者 向建英 阚欢 赵平 张贵良 刘云 《现代食品科技》 CAS 北大核心 2024年第4期95-103,共9页
为探究云南金花茶在消化过程中总黄酮、总多酚释放及功能活性的变化情况,该研究采用体外模拟胃肠消化模型测定了云南金花茶消化液中总黄酮、总多酚浓度及自由基清除能力、铁离子还原能力和脂质过氧化抑制能力,并对其进行了相关性分析。... 为探究云南金花茶在消化过程中总黄酮、总多酚释放及功能活性的变化情况,该研究采用体外模拟胃肠消化模型测定了云南金花茶消化液中总黄酮、总多酚浓度及自由基清除能力、铁离子还原能力和脂质过氧化抑制能力,并对其进行了相关性分析。结果表明,模拟胃消化过程中,云南金花茶总黄酮、总多酚含量均比口腔消化高,最高分别达229.99、327.65µg/mL,经肠消化后,总黄酮含量在38.56~78.88µg/mL之间,总多酚含量在30.04~65.52µg/mL之间,含量较低。在功能活性测定中,较口腔消化,胃消化阶段的DPPH·、ABTS+·清除能力和铁离子还原能力显著升高,脂质过氧化抑制能力随消化的进行呈上下波动;经肠消化后,DPPH·、ABTS+·清除能力和铁离子还原能力急剧下降,且均比胃消化阶段低,而脂质过氧化抑制能力则趋于平稳或逐渐上升。通过相关性及主成分分析,各指标之间存在一定的关联性。综上所述,云南金花茶是较好的活性物质来源,该研究可为探索云南金花茶在人体消化过程中活性物质的变化及作用机制提供一定的实验基础和新思路。 展开更多
关键词 云南金花茶 模拟胃肠道消化 清除自由基 抑制脂质过氧化
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以保护为主浅谈河口生态特色旅游开发
9
作者 陶公泯 《新农村(黑龙江)》 2012年第11期-,共2页
针对河口其得天独厚的区位和丰富的森林资源优势,提出在加强林业生态建设,保护森林资源,加强宣传工作,强化资源和生态保护意识的同时,合理进行旅游规划,充分挖掘、利用生态旅游资源,开发林区特色旅游产品.
关键词 河口 生态保护 旅游开发
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基于斑马鱼模型及网络药理学研究云南金花茶多酚的抗炎作用 被引量:5
10
作者 高妙姿 唐军荣 +6 位作者 邓佳 向建英 阚欢 赵平 张颖君 张贵良 刘云 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第11期134-142,共9页
为研究云南金花茶多酚(Camellia fascicularis polyphenols,CFP)发挥抗炎作用的分子机制,采用斑马鱼模型对CFP进行抗炎活性评价,利用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(ultra-performance liquid chromatography combined with qu... 为研究云南金花茶多酚(Camellia fascicularis polyphenols,CFP)发挥抗炎作用的分子机制,采用斑马鱼模型对CFP进行抗炎活性评价,利用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(ultra-performance liquid chromatography combined with quadrupole-time-of-flight mass/mass spectrometry,UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术分析其化合物组成,通过SwissTargetPrediction、DisGeNET等数据库获得有效成分和炎症的作用靶点,借助STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI),通过DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,使用AutoDockTools和PyMOL软件对关键成分和核心蛋白进行分子对接及可视化。结果显示,从CFP中鉴定出21个酚类化合物,筛选出32个交集靶点,GO功能和KEGG通路富集分析显示CFP可能通过细胞增殖的正向调节、细胞质、三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)结合等生物学过程作用于甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、基质金属蛋白酶2(matrix metallopeptidase 2,MMP2)等核心靶点,进一步调控花生四烯酸代谢、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)、血小板活化等信号通路来发挥抗炎作用。分子对接结果表明,云南金花茶多酚类关键成分与炎症靶点间存在良好的结合活性。本研究可为云南金花茶多酚类成分抗炎产品的开发提供理论参考。 展开更多
关键词 云南金花茶 炎症 斑马鱼模型 网络药理学 分子对接
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金花茶组植物的化学成分及保健功效研究进展 被引量:18
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作者 刘云 付羚 +4 位作者 张颖君 唐军荣 阚欢 张贵良 赵平 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2019年第3期321-326,332,共7页
金花茶组植物系山茶科山茶属落叶小灌木,花为金黄色,是国家一级保护物种,同时也为传统的药食两用植物。金花茶的花、叶及种子中含有丰富的营养保健成分,如多糖、多酚、黄酮类、皂苷类等活性物质,具有极高的观赏价值、药用价值和良好的... 金花茶组植物系山茶科山茶属落叶小灌木,花为金黄色,是国家一级保护物种,同时也为传统的药食两用植物。金花茶的花、叶及种子中含有丰富的营养保健成分,如多糖、多酚、黄酮类、皂苷类等活性物质,具有极高的观赏价值、药用价值和良好的保健功效。本文综述了近年来关于金花茶组植物的化学成分及其抗氧化、抗肿瘤、预防心血管疾病、降血糖、增强机体免疫机能、抗炎、抗过敏及抑菌等保健功效的研究进展,为金花茶组植物资源的开发利用提供参考。 展开更多
关键词 金花茶组 化学成分 活性物质 保健功效
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越南安息香不同分布区的群落特征 被引量:8
12
作者 李因刚 柳新红 +4 位作者 赵勋 徐梁 黄勇 杨成华 杨治国 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2011年第4期500-504,共5页
2009年8—9月在福建南平芒荡山(Ⅰ)、贵州从江瑶人山(Ⅱ)、广西金秀大瑶山(Ⅲ)、云南屏边大围山(Ⅳ)和西双版纳南糯山(Ⅴ)等5个不同类型的分布区内设置样地,对越南安息香群落进行实地调查,研究了群落结构特征与物种多样性。结果表明:5... 2009年8—9月在福建南平芒荡山(Ⅰ)、贵州从江瑶人山(Ⅱ)、广西金秀大瑶山(Ⅲ)、云南屏边大围山(Ⅳ)和西双版纳南糯山(Ⅴ)等5个不同类型的分布区内设置样地,对越南安息香群落进行实地调查,研究了群落结构特征与物种多样性。结果表明:5个分布区的越南安息香群落均含有相对较少的物种数,越南安息香在各群落多与壳斗科、松科、杉科、桦木科、金缕梅科和山茶科等物种共优组成乔木层,或是壳斗科、杉科和漆树科的伴生物种;灌木层和草本层物种数量也较少,灌木层和草本层间还有一定数量的层间植物;群落丰富度指数(Dma)为乔木层>灌木层>草本层,优势度指数(D)和多样性指数(H)较小,变化趋势为Ⅴ>Ⅱ>Ⅳ>Ⅰ>Ⅲ。分布区气候类型的不同导致群落间共有物种数目少,相似性系数维持在较低水平。 展开更多
关键词 越南安息香 分布区 群落特征 物种多样性
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昆明动物园笼养倭蜂猴的能量代谢 被引量:4
13
作者 肖彩虹 王睿 +9 位作者 王政昆 柳鹏飞 楚永兴 钱良超 蔡金红 刘春燕 孟丽华 钮建然 贾婷 朱万龙 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期443-446,共4页
The Pygmy loris(Nycticebus pygmaeus) is a small prosimian living in Vietnam,Laos,eastern Cambodia and the south of part China. In China it is only found in Pingbian,Hekou,Jinping,Luchun of Yunnan Province. As N. pygma... The Pygmy loris(Nycticebus pygmaeus) is a small prosimian living in Vietnam,Laos,eastern Cambodia and the south of part China. In China it is only found in Pingbian,Hekou,Jinping,Luchun of Yunnan Province. As N. pygmaeus is seriously threatened by hunting,trade and habitat destruction,it is listed in AppendixⅡ of CITES,and in 2006 the IUCN classified it as "vulnerable". But the Pygmy loris is nocturnal which creates difficulties to study in the field. In order to understand the characteristics of energy metabolism in N. pygmaeus,the energy intake,digestable energy intake and digestability were estimated by means of feeding trials in Kunming Zoo. The results obtained mainly were as follows:N. pygmaeus intook dry food averaged 9.28±0.48 g per day. Therefore they were estimated to gain 160.94±8.05 kJ/d from food intake,and earn 34.00±7.74 kJ digestable energy intake per day with 82.84±1.98% of the digestability. All these characteristics of energy metabolism in N. pygmaeus of cage are possibly related with their body mass,climate,habitat,and might be considered as the adaptive characteristics to their survival environment in tropical semi-evergreen and secondary forests. 展开更多
关键词 倭蜂猴 能量代谢 适应性
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我国越南安息香的地理分布及其气候特征 被引量:9
14
作者 李因刚 柳新红 +2 位作者 赵勋 徐梁 杨治国 《西南林学院学报》 2011年第1期5-10,共6页
用查阅资料和实地调查相结合的方法,对越南安息香在我国的天然与人工分布及其气候特征进行分析。结果表明:越南安息香零星分布于我国北纬21°28’48”~2939’00”,东经98°39’00”~118°09’36”,生境片段化严重,... 用查阅资料和实地调查相结合的方法,对越南安息香在我国的天然与人工分布及其气候特征进行分析。结果表明:越南安息香零星分布于我国北纬21°28’48”~2939’00”,东经98°39’00”~118°09’36”,生境片段化严重,种群内个体数量少或为孤立木;通过人工引种栽培,目前其分布的最北端为北纬30°11’24”;在云南和贵州分布区,越南安息香多分布于海拔1000~2000m;在中东部分布区,集中分布于200~1000m,偶见于〈200m的低海拔地区。根据天然分布区的气象资料,总结出越南安息香对温度、光照和水分等气候指标的需求特点。在引种栽培基础上,结合分布北缘和特殊分布点的气候特征,推出越南安息香潜在的适宜生长区,井提出引种驯化的首选种质。 展开更多
关键词 越南安息香 资源 地理分布 气候特征
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云南金花茶转录组序列分析及功能注释 被引量:2
15
作者 辛静 李斌 +4 位作者 叶鹏 刘成 唐军荣 张贵良 辛培尧 《经济林研究》 北大核心 2020年第3期85-94,共10页
【目的】深入研究云南金花茶优良性状、基因功能和基因分布特征,可为云南金花茶乃至山茶属植物功能基因的探索以及该物种的遗传保护提供基础生物信息学理论参考。【方法】采用Illumina Hi Seq 2000技术,对云南金花茶叶片进行转录组测序... 【目的】深入研究云南金花茶优良性状、基因功能和基因分布特征,可为云南金花茶乃至山茶属植物功能基因的探索以及该物种的遗传保护提供基础生物信息学理论参考。【方法】采用Illumina Hi Seq 2000技术,对云南金花茶叶片进行转录组测序及相关数据分析,在对测序数据整理、de novo组装后,获得Unigene序列,继而利用相关生物信息学数据库进行序列比对。【结果】组装后,共获得95979条Unigenes,其中N50(拼接转录本不小于总长50%的长度)为1660 nt,平均长度为1124 nt,Q20和Q30序列(处理后质量高于20和30的碱基)分别占96.39%和91.28%。经比对,在Nr、Nt、Swiss-Prot中能得到注释的Unigene分别为58830、43623、44315条。在GO中,有41905条(43.66%)Unigenes注释224129个GO功能,将其分为3个大类和56亚类,所占比例最多的为生物过程这一类功能。在KOG中,有23499条(24.48%)Unigenes注释26430个KOG功能信息,将其分为26个基因功能大类,其中表达量较高的分别是一般功能基因和翻译后修饰、蛋白质转化、伴侣功能的相关基因。另外,共有23214条(24.18%)Unigenes在KEGG中得到注释,根据其涉及的相关通路可将其归为19个亚类,其中以代谢通路较为丰富。此外,利用相关数据库和ESTScan软件对云南金花茶转录组Unigene进行CDS比对和预测,共预测到26428条CDS,其长度集中在100~500 nt,占总CDS的82.10%。【结论】云南金花茶所含基因信息丰富,利用分析得到的所有注释信息可以更深层次地探索其基因组信息和基因分布情况。 展开更多
关键词 云南金花茶 转录组 UNIGENE 功能 注释
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稀有植物云南金钱槭的种子休眠与解除 被引量:1
16
作者 欧阳志勤 张光飞 +2 位作者 苏文华 楚永兴 陶国祥 《种子》 CSCD 北大核心 2009年第8期16-21,共6页
云南金钱槭果实各部分水浸提液含有内源抑制物,种子吸水性良好,果皮和种皮结构复杂,赤霉素(GA3)和变温(10~20℃和15—25℃)不能解除种子休眠,而低温(6℃)条件下:种子培养150d,萌发率达到98%;果实培养260d,有58%的种子... 云南金钱槭果实各部分水浸提液含有内源抑制物,种子吸水性良好,果皮和种皮结构复杂,赤霉素(GA3)和变温(10~20℃和15—25℃)不能解除种子休眠,而低温(6℃)条件下:种子培养150d,萌发率达到98%;果实培养260d,有58%的种子萌发。刮开种子胚芽处少许种皮,6、15℃和25℃条件下培养60d,种子萌发率分别达78%、38%和76%。云南金钱槭种子具有深休眠特性。 展开更多
关键词 稀有植物 云南金钱槭 种子休眠 解除休眠
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云南金花茶矿质元素及功能成分分析 被引量:10
17
作者 汪梦婷 张贵良 +3 位作者 刘云 辛亚龙 辛培尧 唐军荣 《黑龙江农业科学》 2018年第4期118-121,共4页
为促进云南金花茶产品开发,以云南金花茶的花、嫩叶、老叶为试材,采用离子体发射光谱仪、碳氢分析仪和分光光度法等对7种常量元素、5种微量元素,以及3种生理活性成分进行了测定。结果表明:花和嫩叶中的常量元素以钾元素含量居多,而老叶... 为促进云南金花茶产品开发,以云南金花茶的花、嫩叶、老叶为试材,采用离子体发射光谱仪、碳氢分析仪和分光光度法等对7种常量元素、5种微量元素,以及3种生理活性成分进行了测定。结果表明:花和嫩叶中的常量元素以钾元素含量居多,而老叶中则以钙元素含量居多,且在常量元素中钾元素含量均高于钠元素,呈现出高钾低钠的特点。微量元素中,均以硅元素含量最高,铜元素含量最低。此外,云南金花茶的3种生理活性成分含量,均呈现出茶多酚>粗多糖>总黄酮的规律。 展开更多
关键词 云南金花茶 叶片 矿质元素 功能成分
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云南省两栖类新属纪录——越南姬蛙属
18
作者 吴东益 刘小龙 +4 位作者 刘春雨 史兴惠 杨泽鹏 施德山 袁智勇 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2022年第4期155-160,共6页
2019年7月,在中国云南省红河哈尼族彝族自治州屏边苗族自治县大围山国家级自然保护区采集到两栖纲无尾目姬蛙科(Günther 1858)标本一号。该标本体型较小,头体长为16.8 mm。背部皮肤整体呈砖红色,有微微凸起的微小白色疣粒散布于背... 2019年7月,在中国云南省红河哈尼族彝族自治州屏边苗族自治县大围山国家级自然保护区采集到两栖纲无尾目姬蛙科(Günther 1858)标本一号。该标本体型较小,头体长为16.8 mm。背部皮肤整体呈砖红色,有微微凸起的微小白色疣粒散布于背部、侧腹和后肢背部;吻部至颞部为黑褐色,掺杂有少量白色斑块,手指第一指很短等形态特征与Vietnamophryne orlovi(Nikolay 2018)的形态特征一致。基于16S rRNA基因片段的系统发育分析结果显示,本研究的样本与V.orlovi聚在一支,遗传距离较小,为0.9%(Kimura−2−Parameter),确定该标本是V.orlovi,为中国新属记录,将其中文名记录为“越南姬蛙属”,该物种的中文名记录为“奥氏越南姬蛙”。 展开更多
关键词 两栖类 越南姬蛙属 奥氏越南姬蛙 云南省 大围山国家级自然保护区
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云南金花茶转录组SSR的分布及其序列特征 被引量:27
19
作者 叶鹏 李显煌 +5 位作者 唐军荣 李斌 张贵良 刘成 雷瀚 辛培尧 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期86-91,共6页
分析云南金花茶转录组中的SSR位点信息及其序列分布特征,为SSR引物的大量开发奠定前期基础。利用MISA软件分析了云南金花茶转录组数据155011条Unigenes的SSR位点信息,在云南金花茶转录组中共检测到30435个SSR位点,出现频率为19.63%,平均... 分析云南金花茶转录组中的SSR位点信息及其序列分布特征,为SSR引物的大量开发奠定前期基础。利用MISA软件分析了云南金花茶转录组数据155011条Unigenes的SSR位点信息,在云南金花茶转录组中共检测到30435个SSR位点,出现频率为19.63%,平均3.46kb就出现1个SSR位点。而重复基元类型从二核苷酸到六核苷酸均有出现,其中二核苷酸重复基元为主要类型,占SSR总数的71.44%;其次是三核苷酸,占SSR总数的25.48%;四核苷酸到六核苷酸仅占3.08%。AG/TC与CT/GA是二核苷酸的优势重复基元,分别占总基元的26.75%与25.17%;CTT/GAA与AGA/TCT是三核苷酸的优势重复基元,分别占总数的2.64%与2.23%。根据云南金花茶转录组测序结果,云南金花茶转录组的SSR位点出现的频率较高,具有丰富的基元类型,并且有较高的重复次数,具有较高的多态性潜力。随机选出50对设计的SSR引物用于检测,其中有14对引物能扩增出清晰且单一的谱带。对云南金花茶转录组数据中SSR位点信息进行分析,可为其SSR引物的设计与筛选、SSR遗传多样性分析以及种质资源的保护提供理论依据。 展开更多
关键词 云南金花茶 转录组 SSR特征
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云南金花茶SSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:8
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作者 李显煌 高丽云 +5 位作者 王娟 张贵良 唐军荣 叶鹏 雷瀚 辛培尧 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期101-108,共8页
以云南金花茶为试验材料,利用试剂盒法、SDS法及CTAB法3种方法提取其DNA,并对3种方法的提取结果进行比较;经初筛合成云南金花茶EST-SSR引物,并对影响SSR-PCR体系的Mg^2+、Taq DNA聚合酶、dNTP、引物及模板DNA这5个因素进行L16(4^5)正交... 以云南金花茶为试验材料,利用试剂盒法、SDS法及CTAB法3种方法提取其DNA,并对3种方法的提取结果进行比较;经初筛合成云南金花茶EST-SSR引物,并对影响SSR-PCR体系的Mg^2+、Taq DNA聚合酶、dNTP、引物及模板DNA这5个因素进行L16(4^5)正交实验,以期建立较为稳定的云南金花茶SSR-PCR体系。试验结果表明:试剂盒法提取得到的云南金花茶DNA质量最好且符合SSR分子标记试验。各因素对PCR扩增效果的影响程度为:Mg^2+>引物> Taq DNA聚合酶> dNTP>模板DNA。试验最终确定的金花茶SSR-PCR最佳反应体系(20μL)为:2.0μL Taq Buffer、1.5μL Mg^2+(25 mmol/L)、0.3μL dNTP(10 mmol/L)、0.2μL Taq DNA聚合酶(5 U/μL)、前后引物各0.4μL(10μmol/L)、0.5μL模板DNA(50 ng/μL)、14.7μL ddH2O。建立和优化云南金花茶SSR反应体系,可为云南金花茶不同种群的遗传变异研究提供基础。 展开更多
关键词 云南金花茶 SSR-PCR 体系建立 优化
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