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题名应用改进型遗传算法进行药物分子对接设计
被引量:4
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作者
李纯莲
王希诚
赵金城
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机构
大连理工大学电信学院计算机科学技术系
大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室
大连大学生物信息学与分子设计研究所
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2003年第36期31-33,89,共4页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:10272030)
国家973基础研究发展规划项目(编号:19990328)
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文摘
文章建立了一种约束优化的演化模型,并构造出求解此模型的多种群空间收缩遗传算法,将信息熵概念引入进化过程,控制各种群寻优搜索时解空间的收缩。该算法用种群的多样性避免遗传进化的早熟现象,并以空间收缩尺度作为停机判椐,有效地控制了算法的收敛。利用基于小种群的多种群进化策略,在保证种群多样性的前提下,极大程度地减少了计算量,提高了计算效率。数值算例表明,熵的介入增强了随机搜索类进化算法的寻优目的性,使收敛过程平稳且迅速。算例表明此算法能有效的应用于药物分子对接设计。
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关键词
药物设计
药物分子
改进型遗传算法
对接设计
计算机辅助设计
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Keywords
Micro genetic algorithm,Information entropy,Drug design,Molecular docking
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分类号
TQ460.6
[化学工程—制药化工]
TP391.72
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名基于信息论遗传算法药物分子对接设计
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作者
李纯莲
王希诚
赵金城
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机构
大连理工大学电信学院计算机科学技术系
大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室
大连大学生物信息与分子设计研究所
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出处
《大连大学学报》
2004年第2期75-79,共5页
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基金
国家973计划项目(19990328)
国家自然科学基金资助项目(10272030)
+2 种基金
大连市科技基金资助项目(200206)
大连理工大学研究生院博士生联合培养计划项目(0221)
大连大学博士生联合培养资助项目(0303023)
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文摘
本文建立了一种约束优化的演化模型,并构造出求解此模型的多种群空间收缩遗传算法,将信息熵概念引入进化过程,控制各种群寻优搜索时解空间的收缩 本算法用种群的多样性避免遗传进化的早熟现象,并以空间收缩尺度作为停机判据,有效地控制了算法的收敛 利用基于小种群的多种群进化策略,在保证种群多样性的前提下,极大程度地减少了计算量,提高了计算效率 数值算例表明,熵的介入增强了随机搜索类进化算法的寻优目的性,使收敛过程平稳且迅速
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关键词
信息论
遗传算法
药物设计
分子对接
信息熵
小种群
计算机应用
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Keywords
micro genetic algorithm
information entropy
drug design
molecular docking
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分类号
R914.2
[医药卫生—药物化学]
TP399
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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