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基于生物信息学分析鉴定人牙周炎牙龈组织中的关键生物标志物及相关免疫细胞浸润
被引量:
5
1
作者
王子恢
郜洪宇
+2 位作者
莫菲菲
田广杰
王永兰
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期304-309,共6页
目的:通过生物信息学分析鉴定牙周炎牙龈组织中的关键生物标志物和相关免疫细胞浸润,探索牙周炎的发病机制。方法:从GEO数据库下载GSE10334、GSE16134和GSE23586三个数据集,通过“limma”程序包筛选差异基因,利用STRING和Cytoscape构建...
目的:通过生物信息学分析鉴定牙周炎牙龈组织中的关键生物标志物和相关免疫细胞浸润,探索牙周炎的发病机制。方法:从GEO数据库下载GSE10334、GSE16134和GSE23586三个数据集,通过“limma”程序包筛选差异基因,利用STRING和Cytoscape构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络来获取毂基因,利用CIBERSORT算法分析牙周炎和健康对照之间牙龈组织的免疫细胞浸润。结果:共筛选出129个差异表达基因,构建PPI网络后获取10个毂基因,其显著富集于趋化因子和细胞因子活性等多种细胞生理活动,和细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路、趋化因子信号通路、IL-17信号通路。与健康对照组相比,牙周炎牙龈组织中初始B细胞、浆细胞、初始CD4+T细胞、活化的记忆CD4+T细胞、单核细胞,M1巨噬细胞和中性粒细胞的比例更高(P<0.05)。结论:毂基因的功能分析及探究牙周炎和健康牙龈中所浸润的免疫细胞之间的差异可以为研究牙周炎的发生发展机制提供新的见解和思路。
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关键词
牙周炎
生物信息学
分子生物学
免疫浸润
细胞因子
下载PDF
职称材料
B细胞活化因子与炎症相关性疾病的研究进展
被引量:
1
2
作者
蒋少云
《武警后勤学院学报(医学版)》
CAS
2015年第1期71-76,共6页
B细胞活化因子(B cell activating factor,BAFF)作为肿瘤坏死因子超家族(tumor necrosis factor super family,TNFSF)配体的一员,是一种促炎细胞因子,通过结合3种不同受体调节炎症的发展过程。目前发现BAFF与感染、自身免疫、代谢紊乱...
B细胞活化因子(B cell activating factor,BAFF)作为肿瘤坏死因子超家族(tumor necrosis factor super family,TNFSF)配体的一员,是一种促炎细胞因子,通过结合3种不同受体调节炎症的发展过程。目前发现BAFF与感染、自身免疫、代谢紊乱、骨改建和肿瘤等炎症相关性疾病密切相关。本文就BAFF与炎症相关性疾病的研究进展作一综述。
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关键词
B细胞活化因子
受体
信号通路
炎症
疾病
原文传递
题名
基于生物信息学分析鉴定人牙周炎牙龈组织中的关键生物标志物及相关免疫细胞浸润
被引量:
5
1
作者
王子恢
郜洪宇
莫菲菲
田广杰
王永兰
机构
天津医科大学
口腔
医学院
•
口腔
医院
牙周
科
出处
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期304-309,共6页
基金
天津医科大学科学基金(编号:2016KYZM06)。
文摘
目的:通过生物信息学分析鉴定牙周炎牙龈组织中的关键生物标志物和相关免疫细胞浸润,探索牙周炎的发病机制。方法:从GEO数据库下载GSE10334、GSE16134和GSE23586三个数据集,通过“limma”程序包筛选差异基因,利用STRING和Cytoscape构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络来获取毂基因,利用CIBERSORT算法分析牙周炎和健康对照之间牙龈组织的免疫细胞浸润。结果:共筛选出129个差异表达基因,构建PPI网络后获取10个毂基因,其显著富集于趋化因子和细胞因子活性等多种细胞生理活动,和细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路、趋化因子信号通路、IL-17信号通路。与健康对照组相比,牙周炎牙龈组织中初始B细胞、浆细胞、初始CD4+T细胞、活化的记忆CD4+T细胞、单核细胞,M1巨噬细胞和中性粒细胞的比例更高(P<0.05)。结论:毂基因的功能分析及探究牙周炎和健康牙龈中所浸润的免疫细胞之间的差异可以为研究牙周炎的发生发展机制提供新的见解和思路。
关键词
牙周炎
生物信息学
分子生物学
免疫浸润
细胞因子
Keywords
periodontitis
bioinformatics
molecular biology
immune infiltration
cytokine
分类号
R78 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
B细胞活化因子与炎症相关性疾病的研究进展
被引量:
1
2
作者
蒋少云
机构
天津医科大学口腔医学院口腔医院牙周科
出处
《武警后勤学院学报(医学版)》
CAS
2015年第1期71-76,共6页
基金
国家自然科学基金(81100758/H1405)
文摘
B细胞活化因子(B cell activating factor,BAFF)作为肿瘤坏死因子超家族(tumor necrosis factor super family,TNFSF)配体的一员,是一种促炎细胞因子,通过结合3种不同受体调节炎症的发展过程。目前发现BAFF与感染、自身免疫、代谢紊乱、骨改建和肿瘤等炎症相关性疾病密切相关。本文就BAFF与炎症相关性疾病的研究进展作一综述。
关键词
B细胞活化因子
受体
信号通路
炎症
疾病
Keywords
B cell activating factor
Receptor
Signaling pathway
Inflammation
Diseases
分类号
R593.22 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析鉴定人牙周炎牙龈组织中的关键生物标志物及相关免疫细胞浸润
王子恢
郜洪宇
莫菲菲
田广杰
王永兰
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
下载PDF
职称材料
2
B细胞活化因子与炎症相关性疾病的研究进展
蒋少云
《武警后勤学院学报(医学版)》
CAS
2015
1
原文传递
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