FoxO3基因在膀胱癌中的表达、功能富集和信号通路生物信息学分析

目的:探讨叉头盒状O转录因子3(FoxO3)在膀胱癌中表达、相关生物学功能和信号通路以及与患者生存期的关系。方法:分析癌症基因组图谱数据库(TCGA)中膀胱癌患者的癌组织和正常膀胱组织中FoxO3基因表达水平。STRING数据库构建FoxO3基因相关蛋白-蛋白相互作用网络,对网络中的基因进行聚类分析,并采用cytoscape筛选网络中的关键基因。采用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对FoxO3和相关基因进行功能富集。Cox回归模型构建生存曲线,比较FoxO3高低表达组患者的总生存期(OS)和无疾病进展生存期(DFS)有无差异。结果:FoxO3表达水平在膀胱癌组织中表达水平显著低于对应的正常膀胱组织(P<0.05),而FoxO3表达水平在不同临床分期膀胱癌患者的癌组织中无明显差异(P>0.05)。FoxO3蛋白-蛋白相互作用网络中共有51个蛋白和587个相互作用关,各蛋白平均相互作用指数为23,网络中各个蛋白富集明显(P<1-16)。FoxO3基因表达与FoxO3B基因表达呈正相关(r=0.94,P<0.05),而与TIMM16基因表达呈负相关(r=–0.43,P<0.05)。FoxO3低表达组膀胱癌患者的总生存期(HR=1.4,P=0.029)和无疾病进展生存期(HR=1.5, P=0.015)显著高于高表达组。结论:FoxO3在膀胱癌患者肿瘤组织中表达水平明显下调,且FoxO3低表达与患者的预后不良有关。