天津地区人偏肺病毒G蛋白特性分析

目的了解天津地区人偏肺病毒（hMPV）G蛋白特性，为深入研究（hMPV）奠定基础。方法采用RT—PCR方法扩增hMPV的G基因片段，测序后通过生物信息学软件分析核苷酸同源性，绘制种系发生树，并对推导的G蛋白氨基酸序列的糖基化位点、跨膜序列及二级结构进行预测。结果天津地区hMPVG蛋白由217～238个氨基酸组成。种系发生树分析显示，hMPV可分为A2a、A2b和B23个亚型，A2b为优势流行型。A2亚型内的核苷酸同源性在90．1％～99．5％，推导的氨基酸同源性在80．4％～99．1％；A、B亚型之间核苷酸同源性为57．4％～60．3％，推导的氨基酸同源性为30．3％～37．1％。hMPVG蛋白的S和T总含量在30．9％～34．0％之间，A和B型间差异无统计学意义（P〉0．05）。N-糖基化位点在2～6之间。10株A2亚型hMPVG蛋白的跨膜区为N-端33～55位氨基酸，1株B2亚型hMPVG蛋白为N-端27-49位氨基酸。G蛋白氨基酸变异多发生在膜外区。二级结构预测显示，柔性结构占G蛋白氨基酸总数的62．7％～84．1％，其中以无规则卷曲为主，占60．8％～84．1％。该区域也多集中在膜外区，成为抗原表位的可能性较大。结论天津地区hMPV的优势流行型为A2b，其G蛋白特性有地区流行特点。