Titin蛋白PEVK片段中PVAP基序的构象研究

目的通过构象搜索,得到Titin蛋白PEVK片段中PVAP基序的低能构象。方法利用分子力学随机构象搜索法和混合Monte Carlo方法,对Titin蛋白PEVK片段中的PVAP基序进行构象搜索。结果随机构象搜索得到的低能构象集中,PVAP的构象骨架分为折叠式和伸展式,其中以折叠式为优势构象;利用混合Monte Carlo方法得到的低能构象与随机构象搜索结果基本一致。结论在拉力作用下,PVAP的构象由折叠式转变成伸展式,使分子在宏观上表现为弹性,为解释其对Titin蛋白弹性的贡献提供了一定的理论依据。